생명과학분야 학술정보 온라인 세미나!
BRIC은 생명과학분야 연구자들의 학술정보 교류에 적극적으로 참가하실 학술웨비나 발표연사를 모십니다.
학술웨비나 개최완료
TAPE-seq: Prime Editor를 직접 사용한 Genome-wide off-target 예측 방법 [Nat. Commun.]
TAPE-seq is a cell-based method for predicting genome-wide off-target effects of prime editor
Nat. Commun., 2022 Dec 29;13(1):7975 | https://doi.org/10.1038/s41467-022-35743-y
본 세미나에서는 직접 Prime Editor (PE)를 사용하여 genome-wide off-target 활동을 예측하는 툴이 아직 보고되지 않았다는 문제점을 해결하기 위해, TAgmentation of Prime Editor sequencing (TAPE-seq)이라는 세포 기반 assay의 개발 과정과 성능 테스트 검증 결과를 발표합니다. 다양한 버전의 PE를 사용하여 TAPE-seq 분석을 성공적으로 수행하고, 그 결과를 Cas9 nuclease나 nickase 활동 분석 기반의 두 가지 다른 off-target 예측 방법, GUIDE-seq와 Digenome-seq(nDigenome-seq)와 비교하였습니다. TAPE-seq은 다른 방법들에 비해 가장 낮은 miss rate와 가장 높은 receiver operating characteristic curve (ROC) area를 보여주었습니다. 또한 TAPE-seq는 다른 방법에서 누락된 유효한 off-target site를 발견하는 데 성공하였습니다.
개최 완료
학술웨비나
일시
2023년 11월 30일 (목) 오전 10시
연사
고중현(서울대학교)
학술웨비나
일시
2023년 11월 27일 (월) 오후 02시
연사
정도원(서울대학교 의과대학)
학술웨비나
일시
2023년 11월 27일 (월) 오전 10시
연사
김보아(University of North Carolina, University of Pennsylvania)
일시
2023년 11월 22일 (수) 오후 02시
연사
박규태(부산대학교 의과대학)
학술웨비나
일시
2023년 11월 22일 (수) 오전 11시
연사
Godagama Gamaarachchige Dinesh Suminda(제주대학교)
학술웨비나
일시
2023년 11월 20일 (월) 오후 02시
연사
여진기(서울대학교)
학술웨비나
일시
2023년 11월 17일 (금) 오후 02시
연사
김경민(라트바이오)
학술웨비나
일시
2023년 11월 17일 (금) 오전 10시
연사
홍지소(Perelman School of Medicine)
학술웨비나
일시
2023년 10월 30일 (월) 오전 11시
연사
이무열(University of North Texas)
학술웨비나
일시
2023년 10월 23일 (월) 오전 11시
연사
박종찬(성균관대학교)