학술웨비나 개최예정
D&D-seq: 싱글셀 수준의 전사인자 프로파일링 기술 [Cell]
유전자 발현은 세포의 분화, 발달 및 상태 변화를 위해 정교하게 유지되는 과정으로, 다양한 전사인자와 크로마틴 조절 단백질의 DNA 결합으로 조절됩니다. 하지만 기존 기술로는 단일세포 수준에서 이러한 DNA-전사인자 상호작용과 같은 약하거나 일시적인 결합을 정확히 측정하기 어려웠습니다. 저희 연구진이 개발한 Docking and Deamination followed by sequencing (D&D-seq)은 항체-나노바디 타게팅을 통해 표적 단백질 주변 DNA에 DddA deaminase를 위치시키는 방법으로, C->U 탈아미노화를 표적 단백질 주변 영역에 영구적으로 기록하게 됩니다. 본 연구에서는 CTCF scD&D-seq과 GoT-ChA targeted genotyping을 통하여 IDH2 R140Q 돌연변이를 갖는 T cell 내에서 나타나는 chromatin architecture 변화를 확인할 수 있었으며, GATA1 D&D-seq을 10X Multiome과 결합하여 erythropoiesis 에서 나타나는 GATA1 조절 네트워크를 멀티오믹스 수준에서 분석했습니다. 본 세미나에서는 D&D-seq을 활용한 분석사례와 함께 다양한 적용 예시 및 응용 분야를 공유하고자 합니다.
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