줄기세포의 후성유전학적 상태는 배양 환경에 따라 변화하며, 이는 세포의 안정성과 활용에 중요한 영향을 미칩니다. 본 연구에서는 다양한 배양 조건에서 마우스 배아줄기세포의 후성유전학적 상태를 조절하는 핵심 인자로 DNA methyltransferase 3-like (Dnmt3L)의 역할을 규명하였습니다. 특히 2i-LIF 조건에서 Dnmt3L은 독특한 발현 패턴을 보이며 외부 환경 변화에 민감하게 반응하였습니다. 질량 분석을 통해 K238 및 K412 라이신 잔기의 아세틸화가 Dnmt3L 단백질 안정성을 조절하는 핵심 기전임을 확인하였습니다. 이러한 아세틸화는 DNA 메틸화와 생식, 신경, 심장 계열로의 분화 능력에 영향을 미치며, 관련 유전자의 발현 변화도 밀접하게 연관되어 있음을 확인하였습니다. 이는 줄기세포의 발달 잠재력과 후성유전적 안정성 유지 기전을 이해하는 데 중요한 근거를 제공하며, 배양 조건 최적화 및 재생의학 분야에서 유용한 기초 자료가 될 것으로 기대됩니다. 이로써 줄기세포의 후성유전적 안정성을 정밀하게 제어하기 위한 새로운 전략을 제시합니다.