공생미생물은 숙주의 체내·외 여러 장기(위장관, 구강, 생식기, 피부 등)에 서식하며, 수만 년 동안 인간과 상호작용을 통해 숙주의 항상성 유지에 중요한 역할을 하는 세균 등의 미세 생물을 말함. 공생미생물은 숙주와 상호작용을 통해 인체의 항상성을 유지하는 필수조건임이 밝혀지고 있음. 현대 과학에서 인체를 하나의 유기적인 통합 관점으로 보는 “Supraorganism(초유기체)”은 한의학의 “정체관(整體觀)”과 일치함.