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'protein interaction mapping' 에 대한 통합검색결과 18건입니다.

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Massively parallel reporter assay investigates shared genetic variants of eight psychiatric disorders
- Cell January 22, 2025 | https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.12.022
- 2025.01
- 이송이(Stanford University)
Engineered allostery in light-regulated LOV-Turbo enables precise spatiotemporal control of proximity labeling in living cells
- Nat. Methods 2023 May 15 | https://doi.org/10.1038/s41592-023-01880-5
- 2023.05
- 김태욱(한양대학교)
Mapping the signaling network of BIN2 kinase using TurboID-mediated biotin labeling and phosphoproteomics
- Plant Cell 2023 Jan 20;koad013 | https://doi.org/10.1093/plcell/koad013
- 2023.01
- 생명과학
- 김원호(University of Pennsylvania Perelman School of Medicine)
BRD4 orchestrates genome folding to promote neural crest differentiation
- Nat. Genet. Published: 05 October 2021 | https://doi.org/10.1038/s41588-021-00934-8
- 2021.10
- 생명과학
- 김효정(University of Nottingham, 현 우석대학교)
Crystal structure of ADAMTS13 CUB domains reveals their role in global latency
- Sci. Adv. 16 Apr 2021: Vol. 7, no. 16, eabg4403 | DOI: 10.1126/sciadv.abg4403
- 2021.04
- 의약학
Chemical RNA digestion enables robust RNA-binding site mapping at single amino acid resolution
- Nat. Struct. Mol. Biol. Published: 08 June 2020 | https://doi.org/10.1038/s41594-020-0436-2
- 2020.06
- 생명과학
Cyclase-associated protein 1 is a binding partner of proprotein convertase subtilisin/kexin type-9 and is required for the degradation of low-density
- Eur. Heart J. Published: 16 August 2019 | https://doi.org/10.1093/eurheartj/ehz566
- 2019.08
- 의약학
- 최순강(Harvard Medical School, Dana-Farber Cancer Institute)
Maximizing binary interactome mapping with a minimal number of assays
- Nat. Commun. Published 29 August 2019, 10, Article number: 3907 | DOI https://doi.org/10.1038/s41467-019-11809-2
- 2019.08
정명호

성균관대학교 의과대학

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 심장은 다양한 생리적, 병태적 환경에 적응하기 위해서 심근 비대 (cardiac hypertrophy) 와 심근 섬유화 (cardiac fibrosis)를 동반하는 다양한 리모델링 과정을 거치게 됩니다. 이런 과정들은 결국 심근 병증 및 심부전을 초래하게 되는데 이를 방지하고 치료하기 위해서 많은 연구자들이 심근 리모델링 과정에 관여하는 분자적 기전에 대해 연구 하고 있습니다. 그 노력으로 Wnt signaling, TGF signaling 등이 심근 리모델링 과정에 중요한 역할을 할 것으로 생각되고 있습니다. 특히 Wnt signaling의 경우 심근형성 및 재생과정에 필수적인 역할을 한다고 알려져 있습니다. 더욱이 Wnt/beta-catenin의 신호를 조절하는 것은 심근 비대와 심근 섬유화와 같은 병태적 심근 리모델링 과정을 억제 할 수 있을 것이라 사료되고 있습니다. 본 연구에서는 2014년 Nature communication에 출판된 “Cdo suppresses canonical Wnt signalling via interaction with Lrp6 thereby promoting neuronal differentiation” 연구의 연장선으로 Cdon (Cdo)이 cardiac intercalate disc 에 위치하며 Wnt/beta-catenin 신호를 조절함으로써 gap jucntion의 활성을 조절하여 심근섬유화를 억제할 수 있음을 밝혔습니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁 드립니다. 저는 성균관대학교 의과대학 줄기세포분화연구실에서 강종순 교수님의 지도아래 연구를 진행하고 있습니다. 저희 실험실은 교수님께서 직접 cloning 하여 발견하신 Cdon (Cdo)과 Boc 유전자에 의한 심장, 근육, 신경 세포의 분화 및 생리적 활성에 관한 연구를 진행하고 있습니다. 또한 Protein arginine methyl transferase 의 한 종류인 PRMT7에 관하여 최근 연구를 시작하였으며 위의 유전자를 바탕으로 노화와 관련된 여러 질병에 관한 연구 또한 병행하여 진행하고 있습니다. 심장과 근육, 신경세포 특이적 유전자 KO mouse model을 최근 확립하여 보다 심층적인 연구를 수행하기 위해 노력 하고 있습니다. 현재 저희 실험실은 박사학생을 포함하여 9명의 연구원과 2명의 인턴학생으로 구성되어 있습니다. 근육, 심장 , 신경분야에 관심이 많으시거나 줄기세포 분야에 흥미가 있으신 분들은 언제든지 저희 실험실을 찾아 주세요. 연구실 주소 : http
- Proc. Natl. Acad. Sci. USA
- 2017.02.10
Proteome-wide discovery of mislocated proteins in cancer
- Genome Res. Published in Advance May 14, 2013, doi: 10.1101/gr.155499.113
- 2013.05
- 남진우(Massachusetts Institute of Technology)
Long non-coding RNAs in C. elegans
- Genome Res. Published online before print, June 15, 2012 | doi: 10.1101/gr.140475.112
- 2012.06
- 생명과학
- 남진우(Massachusetts Institute of Technology)
Long non-coding RNAs in C. elegans
- Genome Res. Published online before print, June 15, 2012 | doi: 10.1101/gr.140475.112
- 2012.06
- 생명과학
- 백융기(연세대학교 연세프로테옴연구센터(YPRC))
The Human Proteome Project: Current State and Future Direction
- Mol. Cell. Proteomics July 1, 2011 | doi: 10.1074/mcp.M111.009993
- 2011.07
- 이기영(아주대학교 의과대학, UCSD)
Mapping Plant Interactomes Using Literature Curated and Predicted Protein–Protein Interaction Data Sets
- Plant Cell 22:997-1005 (2010); Published on April 6, 2010; 10.1105/tpc.109.072736
- 2010.04
김형

Baylor College of Medicine

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 간단히 설명 chromosomes의 말단부위는 DNA damage로 인식되어 부적절한 DNA repair 과정이 일어나지 않도록 구별되어 지고, 보호되어져야 합니다. Telomeres는 진핵생물의 linear chromosomes의 말단부분의 반복된 DNA 염기서열과 여러 단백질들 (six core telomere proteins: TRF1, TRF2, POT1, RAP1, TIN2, and TPP1 )로 구성된 특이한 구조로서 chromosome end를 보호하는 역활을 합니다. TRF1과 TRF2는 가장 잘 알려져 있는 단백질로써, telomere dsDNA에 직접 결합하는 homodimeric TRF homology (TRFH) domain 구조를 가지고 있습니다. 최근, TRF1과 TRF2는 telosome assembly 뿐만이 아니라, telomere length regulation, DNA replication, repair, end joining, recombination, 그리고 cell cycle control에 관련되 여러 다양한 단백질들과 상호작용하는 것으로 알려졌 있습니다. 바꾸어 말해서, TRF1과 TRF2는 protein interaction hub로써 기능하여, 다양한 signaling pathway의 mediator들과 직접 상호작용 합니다. 그러나 어떻게 여러 단백질들과 이러한 상호작용이 가능한 것인지, 그 mechanism은 지금까지 알려져 있지 않습니다. 따라서 이번 연구과제에서, 저는 Oriented Peptide Library mapping을 통하여 TRF2의 TRFH domain이 [Y/F]XL를 core motif로 하는 linear peptide sequence를 인식 한다는 것을 밝혔습니다. 그리고 genome-wide target analysis를 통하여 [Y/F]XL가진 새로운 TRF2-상호작용 단백질들(PNUTS과 MCPH1)을 확인할 수 있었습니다. 더욱이 이 새로운 단백질들은 TRF2와의 상호작용을 통하여 telomere length와 telomere DNA damage response를 조절하는 기능을 가지는 것으로 각각 확인 되었습니다. 그러므로 TRF2는 telomere에서 linear sequence code의 인식을 통하여, 다양한 target protein들과 상호작용하여 telomere 의 기능을 조절하는 “Protein Hub”로써의 역활을 한다는 것을 밝혔습니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁 드립니다. 저는 미국 텍사스주 휴스톤에있는 베일러 의과 대학에서 포스트닥터로 근무하고 있습니다. 베일러 의과 대학은 세계에서 가장 규모가 커다고 하는 텍사스 메디컬 센터내에 자리잡고 있습니다. 주위엔 M. D. Anderson Cancer Center 와 Texas University, 그리고 Rice University등 많은 학교와 병
- Nat. Struct. Mol. Biol.
- 2009.03.23
- 이은정(University of California San Diego / KAIST)
Network-based classification of breast cancer metastasis
- Mol. Syst. Biol. 3 Article number: 140 doi:10.1038/msb4100180 | Published online: 16 October 2007
- 2007.10
- 의약학
김태희

Cornell University/Sloan-Kettering Institute

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망 및 연구 활동에 관련된 앞으로의 계획 Forward genetic screens (mouse ENU mutagenesis) : 논문에서 제가 연구한 humdy mutant mouse는 mouse ENU screen에서 발견된 것입니다. 제가 아는 한 Dr. Kathryn Anderson Lab (Sloan-Kettering)에서 embryonic development을 연구하기 위한 mouse forward genetic screen을 최초로 성공적으로 수행하였고, 운이 좋게 저희 Lab에서 공동 연구를 시작하여 screen 전반부터 직접 참여하게 되었습니다. 물론 많은 시간이 소요되기는 하였지만 screen 전 과정이 어떻게 이루어지고 서로 다른 mouse strain의 DNA polymorphism를 이용한 genetic mapping 과정을 통해 gene을 찾아나가는 과정을 배울 수 있었습니다. Phactr4's function during neurulation : 저는 Central Nervous System (CNS)의 기초를 만드는 morphogenesis을 뜻하는 neurulation에 관심을 가지게 되었는데, 이것은 과연 인간이 어떻게 그 자신의 brain이 만들어지는 과정의 질문을 풀 수 있을 능력의 brain 가지고 있느냐 하는 매우 흥미 있는 과제이기도 합니다. 그래서 ENU screen에서 얻은 수많은 mouse mutant들 중에서 neurulation defects을 가진 한 mutant (humdy mutant)를 가지고 연구를 시작하였습니다. Neurulation 기간 동안 neural tube의 Dorsal/Ventral axis에 따라 differentially regulated proliferation이 관찰되었으나 그 중요성이나 유전적 증거가 보고되지 않았었습니다. 제가 Phactr4 gene을 cloning 함으로써 differentially regulated proliferation이 neurulation 과정에 중요하다는 것을 처음 보고하게 되었습니다. Phactr4의 조절기작으로 humdy mutant의 Phactr4 gene에서 ENU에 의해 induced되고, protein phosphatase 1 (PP1) interaction을 disrupt하는 missense mutation를 발견하였고, PP1 downstream target, Rb가 misregulation되는 것을 보여주었으며, 더 나아가 MD fellow, Jessica Goodmand에 의해 Rb downstream, E2F genetic rescue 실험을 성공적으로 마치게 되었습니다. 하지만 어떻게 이 differentially regulated proliferation이 직접적으로 neurulation 과정에 영향을 미치는지, 그리고 어떻게 Phactr4와 PP1이 Rb phosphorylation regulation에 관여하는지, 과연 Phactr4가 암발생 과정에서 PP1, Rb와 함께 tumor suppressor 역할을 하
- Dev. Cell
- 2007.08.03
HCCR-1-Interacting Molecule “Deleted in Polyposis 1“ Plays a Tumor-Suppressor Role in Colon Carcinogenesis.
- Gastroenterology 2006 Jun;130(7):2074-86.
- 2006.06
- 의약학

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