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'nucleolus' 에 대한 통합검색결과 21건입니다.

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Nucleolar actions in plant development and stress responses
- Plant Cell Environ. 22 August 2024 | https://doi.org/10.1111/pce.15099
- 2024.08
- 생명과학
- 조민정(성균관대학교 의과대학)
- 권영대(성균관대학교 의과대학)
Reduced dynamicity and increased high-order protein assemblies in dense fibrillar component of the nucleolus under cellular senescence
- Redox Biol. Jul 25 2024, 75 S2213-2317(24)00257-X | https://doi.org/10.1016/j.redox.2024.103279
- 2024.07
- 의약학
- 박세훈(Max Planck Institute of Biochemistry)
Stress-dependent condensate formation regulated by the ubiquitin-related modifier Urm1
- Cell https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.06.009
- 2024.06
- 생명과학
The Phytophthora nucleolar effector Pi23226 targets host ribosome biogenesis to induce necrotrophic cell death
- Plant Commun. 2023 Apr 23;100606 | https://doi.org/10.1016/j.xplc.2023.100606
- 2023.04
- 생명과학
The nucleolus is the site for inflammatory RNA decay during infection
- Nat. Commun. Published 03 September 2022 | https://doi.org/10.1038/s41467-022-32856-2
- 2022.09
- 생명과학
이태윤

연세대학교

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 사이토카인(cytokine)은 면역 반응을 조절하는 중요한 단백질로서 균형 잡힌 면역 항상성을 유지하기 위해서 사이토카인 발현은 매우 섬세하게 조절되어야 한다고 알려져 있습니다. 과거 연구들은 대부분 세포질 또는 핵질에서 사이토카인 RNA 제거 기전에 연구를 진행해왔으며 아직 ribosomal RNA의 생합성에 중요한 장소로 잘 알려진 핵소체(nucleolus)에 초점을 두고 연구된 바가 없습니다. 본 연구팀은 선천성 면역 반응을 유도하는 박테리아 유래 물질인 LPS(lipopolysaccharide)에 의한 대식세포 핵소체의 형태학적 변화를 관찰하였고 이를 기반으로 핵소체 RNA-sequencing 분석을 통해 염증성 precursor mRNA(pre-mRNA)가 핵소체 내 매우 축적되어 있다는 것을 확인하였습니다. 더 나아가, 핵소체 단백질인 nucleolin(NCL)이 cytosine 또는 urail(C/U)로 구성된 염기서열을 특이적으로 인지하여 염증성 pre-mRNA를 핵소체로 인도할 뿐만 아니라 Rrp6-exosome 복합체를 통해 pre-mRNA를 소거한다는 것을 확인하였습니다. 이러한 염증성 pre-mRNA의 제거는 감염에 따른 NCL의 수식화(post-translational modifications) 변화를 통해 결정되고 실제 NCL 발현이 저하된 실험용 쥐가 정상 쥐에 비해 LPS에 더 민감하게 반응하게 되어 패혈 쇼크 사망률이 증가한다는 것을 확인하였습니다. 이 연구를 통해 감염 시 핵소체가 기존의 전통적인 기능을 넘어 면역 항상성을 유지하기 위한 염증성 유전자의 발현을 조절한다는 새로운 면역학적 기능을 제시하였습니다. 그림 1 감염 시 핵소체의 염증성 pre-mRNA 제거 기전 모델 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. 본 연구는 연세대학교 시스템 생물학과의 박보연 교수님의 지도하에 진행되었으며 제가 소속된 인체 면역병리학 연구실은 암, 자가면역질환과 같은 인체 질병을 유도하는 다양한 인자들의 발병 기전을 세포 분자 수준에서 연구하고 있습니다. 이를 통해 질병의 진단 또는 예후 바이오마커를 발굴하고 타겟 인자를 기반으로 한 치료제 개발에 초점을 두고 있습니다. 이와 함께 대부분의 사람들이 감염되었다고 알려진 거대세포바이러스(HCMV)의 면역 회피 기전과 염증성 장 질환 촉발 기전에 대한 연구도 진행하고 있습니다. 3. 연구 활동
- Nat. Commun.
- 2022.09.13
- 심명섭(Duke University)
The autophagic protein LC3 translocates to the nucleus and localizes in the nucleolus associated to NUFIP1 in response to cyclic mechanical stress
- Autophagy Published online: 16 Sep 2019 | https://doi.org/10.1080/15548627.2019.1662584
- 2019.09
- 생명과학
- 김대석(University of Texas Southwestern Medical Center)
Activation of PARP-1 by snoRNAs Controls Ribosome Biogenesis and Cell Growth via the RNA Helicase DDX21
- Mol. Cell Available online 24 July 2019 | https://doi.org/10.1016/j.molcel.2019.06.020
- 2019.07
- 신용대(서울대학교, Princeton University)
Liquid Nuclear Condensates Mechanically Sense and Restructure the Genome
- Cell Volume 175, Issue 6, 29 November 2018, Pages 1481-1491.e13 | DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.10.057
- 2018.11
- 바이오·의료융합
- 신용대(서울대학교, Princeton University)
Liquid Nuclear Condensates Mechanically Sense and Restructure the Genome
- Cell Volume 175, Issue 6, 29 November 2018, Pages 1481-1491.e13 | DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.10.057
- 2018.11
- 바이오·의료융합
- 성민경(California Institute of Technology)
Ribosomal proteins produced in excess are degraded by the ubiquitin–proteasome system
- Mol. Biol. Cell September 1, 2016 vol. 27 no. 17 2642-2652 | doi: 10.1091/mbc.E16-05-0290
- 2016.09
- Rakesh Srivastava(한양대학교)
- 안성훈(한양대학교)
The Epigenetic Pathways to Ribosomal DNA Silencing
- Microbiol. Mol. Biol. Rev. September 2016, vol. 80 no.3, 545-563 | doi: 10.1128/MMBR.00005-16
- 2016.09
- 생명과학
- 성민경(California Institute of Technology)
A conserved quality-control pathway that mediates degradation of unassembled ribosomal proteins
- eLife 2016;5:e19105 | DOI: http://dx.doi.org/10.7554/eLife.19105
- 2016.08
- 이상배(성균관대학교)
- 안지인(성균관대학교)
S-nitrosylation of B23/nucleophosmin by GAPDH protects cells from the SIAH1–GAPDH death cascade
- J. Cell Biol. vol. 199 no. 1 65-76 | doi: 10.1083/jcb.201205015
- 2012.10
- 의약학
선우홍재

Cold Spring Harbor Laboratory, 현 Massachusetts General Hospital

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 진핵세포의 핵 내에는 지질막 없이 여러 단백질들이 모여서 Nuclear body라는 구조를 이루고 있습니다. 그 중 가장 대표적인 예는 인 (Nucleolus)을 들 수 있는데, 이러한 nuclear body의 구조, 형성, 유지에 대한 가장 기초적인 이해도 아직 많이 부족한 상태입니다. 또한 그들의 기능과 더불어 어떻게 형성되는지는 지난 10여년간 Nuclear organization 분야의 핵심 의문점 중 하나로 많은 연구가 진행되고 있습니다. 2008년 말 제 학위논문의 Genome Research 게재가 결정되고, 후속 연구를 위해서 아껴놓은 데이터를 기초로 하고 실험을 구상하고 있었습니다. 마침 Dundr 그룹에서 사이언스 (Science 322:1713-7)에 nuclear body 중 하나인 Cajal body가 대부분의 구성 단백질이나 심지어는 구성 RNA로부터도 형성될 수 있어, 특정한 seeding molecule이 없다고 발표하였습니다. 그 실험 방법은 박테리아의 lac operator (lacO)의 tandem array (256 copies)를 가지고 있는 stable HeLa cell line에서, DNA binding 단백질인 lac repressor (lacI)에 형광단백질과 Cajal body 구성 단백질을 결합한 형태 (예, lacI-YFP-coilin)로 세포 내에서 발현시킵니다. 그러면 이 단백질이 lacO에 수십 - 수백개 가량 결합해 있을 때, 다른 구성물질들을 불러들여 최종적으로 Cajal body로 형성될 수 있는가를 관찰, 해석한 것 입니다. 하지만 최초로 lacO에 결합한 단백질이 한 종류가 아니고 복합체일 가능성이 높다는, 기본 가설에 문제를 있음을 인지하 지도교수님과 여러 차례 토의를 하였습니다. 즉 Cajal body의 형성을 유도해 낸 A라는 분자가 lacO에 결합했을 때 단일 종류 분자라는 가정 하에 seeding molecule이라고 주장할 수 있습니다. 하지만, A가 lacO에 결합하는 순간에 벌써 ABCD의 복합체라면 (세포질 내에서 mRNA의 단백질로의 전역 후 핵 내로 이동하는 도중 다른 단백질등과 결합해서 복합체를 이룰 가능성), 그 중 어떤 분자도 진정한 seeding molecule인지 결론내릴 수 없다는 것입니다. 결국 문제는 단백질이 만들어지는 장소와 작동하는 곳의 공간적인 차이에서 발생하는데, 이 문제를 피하기 위해서 다른 nuclear body인 paraspeckle이 가장 적합한 실험 대상이 될 수 있다고 생각하였습니다. Paraspeckle은 비교적 최근에 발견된 nuclear body 중 하나
- Nat. Cell Biol.
- 2010.12.31
- 김상현(Scottish Crop Research Institute, 현재 명지대학교)
Aberrant mRNA Transcripts and the Nonsense-Mediated Decay Proteins UPF2 and UPF3 Are Enriched in the Arabidopsis Nucleolus
- Plant Cell Published on July 14, 2009; 10.1105/tpc.109.067736
- 2009.07
- 생명과학
- 윤차원(NICHD/NIH, 현재 Northwestern University Feinberg School of Medicine)
  Interview
Nucleolar protein B23/nucleophosmin regulates the vertebrate SUMO pathway through SENP3 and SENP5 proteases
- J. Cell Biol. Published online November 17, 2008
- 2008.11
윤차원

NICHD/NIH, 현재 Northwestern University Feinberg School of Medicine

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명 Small ubiquitin-like modifier proteins (SUMOs)에 의한 SUMOylation 은 protein modification mechanism 의 하나로서, 최근 SUMO substrate 의 계속적인 발견으로 인해 많은 관심을 받고 있는 분야입니다. Vertebrate 에서는 현재 SUMO-1,2,3 에 대한 연구가 활발히 이루어지고 있는데, 저희 실험실에서 SUMO-1 은 nucleoplasm, nuclear envelope, nucleolus, PML body, cytoplasm 에서 발현하고 있으며, 95% 의 homologue 를 가지고 있는 SUMO-2,3 는 주로 nucleoplasm 과 PML body 에서 발현한다는 것을 발표하였습니다. SUMO 의 active form 으로의 processing 과 SUMO 와 substrate 간의 deconjugation 에 직접적으로 관여하는 protein 이 바로 Ubiquitin-like protein/sentrin-specific proteases (Ulp/SENPs) 입니다. Vertebrate 의 경우 지금까지 SENP-1,2,3,5,6,7 이렇게 6 종류가 보고되고 있는데, 이들의 발현 위치는 SENP-1,2 가 주로 nuclear membrane 에, SENP-6,7 의 경우는 nucleoplasm, 그리고 제가 실험한 SENP-3,5 는 nucleolus (nucleolar SENP) 에서 발현되고 있습니다. 저의 관심은 왜 SUMO-2,3 가 SUMO-1 에 비하여 nucleolus 에서의 발현양이 현저히 줄어들어 있을까 하는 것이었는데, 그 원인으로 nucleolar SENP 의 기능을 추적하는 것이었습니다. 우선, RanGAP 을 이용한 deconjugation activity assay 와, HA-tagged vinyl sulfone 을 이용한 paralogue preferences assay 결과, nucleolar SENP 는 모두 SUMO-2 specific 하게 반응한다는 것을 알 수 있었습니다. 이 결과로 SUMO-2,3 가 SUMO-1 보다 interphase cell 에서 nucleolus 에서의 발현양이 현저히 줄어든 원인이 SUMO-2,3 specific 한 nucleolar SENP 때문이라 생각을 하게 되었고, RNAi system 으로 확인 한 결과, SENP-3,5 의 single knock down 으로는 보이지 않던 SUMO 의 nucleolar accumulation 이 SENP-3,5 double knock down 에 의해서 현저히 일어나는 것을 확인하였습니다. Nucleolar SENP 의 위치를 자세히 알아본 결과, nucleolus 의 compartment 중 granular component (GC) 에 있다는 것을 알게 되었고 Xenopus egg extract (XEE) system 을 사용하여 nucleolar SENP 와 B23 의 direct interaction 을 확인하였습니다. 이 후 B23 의 한 기능으로 알려진 rRNA processing 에 관해서 실험하
- J. Cell Biol.
- 2008.11.22
- 김상현(Scottish Crop Research Institute)
Interaction of a plant virus-encoded protein with the major nucleolar protein fibrillarin is required for systemic virus infection
- Proc. Natl. Acad. Sci. USA Published online before print June 18, 2007
- 2007.06
- 생명과학
- 김상현(Scottish Crop Research Institute)
Cajal bodies and the nucleolus are required for a plant virus systemic infection
- EMBO J. advance online publication 5 April 2007, doi: 10.1038/sj.emboj.7601674
- 2007.04
- 생명과학