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'network biology' 에 대한 통합검색결과 286건입니다.

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서호균

경북대학교, (주)자이엔

인류는 플라스틱 오염과 세기(世紀)적인 전쟁 중입니다. 유엔환경총회(UNEA 5.2)의 ‘국제 플라스틱 협약’은 2024년 11월 25일 부산에서 마지막 5차 회의가 열렸지만, 각국 이해관계의 첨예한 대립으로 성안에 실패했습니다. 쟁점은 생산량 감축의 강제성입니다. 개인적인 견해로는 감축이 힘들다고 보고 있습니다. 왜냐하면 이들의 재료는 사실상 인류 활동 (운송 등) 에너지를 생성하고 남은 ‘부산물’이기 때문입니다
- Science
- 2025.01.09
Control of Cellular Differentiation Trajectories for Cancer Reversion
- Adv. Sci. Dec 11 2024, | https://doi.org/10.1002/advs.202402132
- 2024.12
- 생명과학
명유찬

The University of Queensland

최근 신약 개발 동향을 살펴보면, 대형 제약회사의 전임상 연구 중 Pharmacokinetics (PK) 와 독성 평가단계에서 가장 많은 약물 후보물질들이 리스트에서 제외된다고 합니다. 결국, 후보물질 스크리닝 단계에서 물질의 효능만을 살펴보는 것이 아니라 PK 및 독성 예측값을 사용하여 후보 물질의 개발성 (developability)을 전반적으로 평가하는 것이 신약 개발 성공률을 높이는 방법이 될 것입니다.
- Nucleic Acids Res.
- 2024.05.07
- 서유신(Columbia University)
A systems biology-based identification and in vivo functional screening of Alzheimer’s disease risk genes reveal modulators of memory function
- Neuron April 30, 2024 | https://doi.org/10.1016/j.neuron.2024.04.009
- 2024.04
- 왕승현(KAIST)
  Interview
- 이도헌(KAIST)
Community cohesion looseness in gene networks reveals individualized drug targets and resistance
- Brief. Bioinform. 15 April 2024 | https://doi.org/10.1093/bib/bbae175
- 2024.04
- 바이오·의료융합
왕승현

KAIST

정밀의료에서는 개별환자의 특성에 맞는 차별화된 치료와 관리를 제공함으로써 그 치료 효과를 극대화하고자 합니다. 이는 모든 환자들에게 동일한 치료방법을 제공했던 기존 의료 시스템의 한계를 극복하고자 하는 것인데요. 이에 기존의 획일화된 치료법에서 벗어나 정밀의료로 나아가기 위한 첫번째 단계는 개개인의 질병 상태를 객관적으로 측정하고 평가할 수 있는 바이오마커의 발굴입니다.
- Brief. Bioinform.
- 2024.04.24
Haribalan Perumalsamy

한양대학교

In this study, we overcome some of the traditional approaches to analyze the toxicity of nanomaterials that are used for various biomedical applications. In particular, many approaches on toxicity assessment of AgNPs have been previously studied using in vitro or in vivo analysis. However, there has been limited study on ex vivo toxicity evaluation, notably on human primary peripheral blood mononuclear cells (hPBMCs), which could be a feasible alternative approach to study leukocytes population.
- J. Nanobiotechnol.
- 2024.03.22
이효형

서울대학교, Icahn School of Medicine at Mount Sinai

Psoriasis is a chronic, T-cell-mediated inflammatory skin disease with a Th17-skewed immune phenotype. Regulatory T cells (Tregs) play a key role in suppressing the inflammatory immune response and inducing immune homeostasis and self-tolerance. While the role of Tregs in the pathogenesis of psoriasis has been proposed, the exact mechanisms of action and the molecular characterization of skin-homing psoriatic Tregs has not yet been well explored.
- EBioMedicine
- 2024.02.16
- 라제쉬쿠마르파닥(중앙대학교)
- 김준모(중앙대학교)
Veterinary systems biology for bridging the phenotype-genotype gap via computational modeling for disease epidemiology and animal welfare
- Brief. Bioinform. Jan 22 2024, 25 (2) bbae025 | https://doi.org/10.1093/bib/bbae025
- 2024.01
- 생명과학
Nhat Truong Pham

성균관대학교

Hello, I’m Nhat Truong Pham, a first-year Ph.D. student working under Prof. Balachandran Manavalan at the Computational Biology and Bioinformatics Laboratory (CBBL-SKKU: https://balalab-skku.org/), Department of Integrative Biotechnology at Sungkyunkwan University. First of all, I’m grateful to the Biological Research Information Center (BRIC) for providing me with this exceptional opportunity
- Brief. Bioinform.
- 2023.12.15
- 백민경(서울대학교)
Accurate prediction of protein?nucleic acid complexes using RoseTTAFoldNA
- Nat. Methods 23 November 2023 | https://doi.org/10.1038/s41592-023-02086-5
- 2023.11
- 생명과학
- 김한준(고려대학교 약학대학)
Gelatin methacryloyl and laponite bioink for 3D bioprinted organotypic tumor modeling
- Biofabrication 2023 Jun 22 | doi: 10.1088/1758-5090/ace0db
- 2023.06
- 의약학
전효은

충남대학교

기존의 연구에서 transcription factor인 FoxO1이 14-3-3ζ와의 결합을 통해 FoxO1의 nuclear export가 유도되면서 FoxO1의 transcriptional activity가 통제되고 염증반응이 조절된다는 것이 밝혀져 있었습니다. 본 연구에서는 이러한 염증반응의 통제과정에 TDAG51이 14-3-3ζ와 경쟁하며 FoxO1에 결합함으로써 FoxO1의 nuclear export를 저지하고 transcriptional activity를 promotion하는데 역할 하는 것을 밝혀냈습니다.
- EMBO J.
- 2023.06.07
- 김민규(University of Texas Health Science Center San Antonio)
A multi-scale map of protein assemblies in the DNA damage response
- Cell Syst. 2023 May 16;S2405-4712(23)00116-3 | https://doi.org/10.1016/j.cels.2023.04.007
- 2023.05
- 천영욱(University of Maryland Medical Center)
Impaired Reorganization of Centrosome Structure Underlies Human Infantile Dilated Cardiomyopathy
- Circulation 2023 Mar 27 | https://doi.org/10.1161/CIRCULATIONAHA.122.060985
- 2023.03
오영택

Columbia University Medical Center, 현 University of Miami

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 Glioblastoma Multiforme (GBM)은 악성 뇌종양으로 치사율이 굉장히 높은 암입니다. 또한 방사선 치료법 또는 화학 약물 치료법와 같은 관습적인 치료 이외에 새로운 치료법을 개발하기위해 많은 연구진이 노력해오고 있지만 Heterogeneity라는 특성때문에 어려운 것이 현실입니다. 이에 따라서 많은 연구진이 GBM을 좀 더 쉽게 접근하기 위한 classification 연구를 진행해왔지만 임상적인 접근을 했을 때 이와 맞지 않는 결과를 보여왔습니다. 이에 따라 이전 논문 (Nature Cancer. 2021; DOI: 10.1038/s43018-020-00159-4.)에서 단순히 gene expression뿐만 아니라 single cell sequencing을 통해 환자 예후와 cell signaling activity를 추가하여 새로운 GBM classification (Metabolic axis and Neurodevelopmental axis)을 구축하였습니다. 본 논문에서는 proteomics를 기반으로 새로운 치료 표적을 개발하는 기법(Substrate PHosphosite-based Inference for Network of KinaseS; SPHINKS)을 구축하고 환자 유래 세포주(Patient derived organoids; PDOs)를 이용하여 이를 검증하는 연구를 진행했습니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. 본 연구는 Columbia University Medical Center의 Institute for Cancer Genetics department에서 Antonio Iavarone 교수님과 Anna Lasorella 교수님 연구실에서 진행하였습니다. Bioinformatics 연구를 진행하는 팀과 Experimental functional validation 연구를 진행하는 팀으로 구성되어 있으며 다양한 GBM에 관한 연구를 진행해오고 있습니다. 현재 전체 연구실이 University of Miami의 Sylvester Comprehensive Cancer Center 부서로 이동하여 새로운 연구 기법을 적용하여 임상적인 접근이 용이한 연구를 진행하고 있습니다. 3. 연구 활동 하시면서 평소 느끼신 점 또는 자부심, 보람 대학원에 입학하면서 처음 악성 뇌종양이라는 질병을 접하게 되었고 발병률은 낮지만 치료가 힘들다는 부분에서 연구의 필요성을 느끼게 되었습니다. 특히 뇌라는 영역에 대한 연구를 진행함에 있어서 새로운 연구 기법 개발도 진행할 수 있다는 부분에 매력을 느끼며 이 때문에 다양한 협업이 가능하는 점은 앞으로 질병 연구를 하는 사람이 가져야하는 중요한 자
- Nat. Cancer
- 2023.03.20
김남희

KAIST

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 암은 대표적 만성 난치성 질환으로 현대인의 생명연장의 가장 큰 걸림돌입니다. 특히 조기 발견을 놓쳐 여러 장기로 암이 전이될 경우, 그 치명률은 높아집니다. 이 문제를 해결하기 위해 수많은 연구자들이 암세포의 전이능력을 제거하려는 시도를 해왔으나 암세포의 높은 가소성으로 인해 중간상태의 불안정한 암세포 상태가 되면서 오히려 전이능과 악성도가 높아져 치료에 어려움이 많았습니다. 본 연구에서는 복잡한 EMT를 지배하는 유전자 조절 네트워크의 수학모델을 개발하고 유전체 데이터 분석, 대규모 컴퓨터 시뮬레이션 분석, 그리고 복잡계 네트워크 제어기술을 적용해 전이능력과 약물저항성을 상실한 상피세포 상태로 역전시킬 수 있는 세 개의 핵심 분자 타깃을 발굴하였고, 그 타깃들의 효과를 폐암세포에서 수행한 분자세포실험을 통해 증명했습니다. 특히 이 과정에서 중간상태의 불안정한 암세포 상태(EMT 하이브리드 세포 상태)를 피하는 동시에 전이능력이 제거되고 항암 화학요법치료가 잘 되는 상피세포 상태로 온전히 역전하는데 성공함으로써 암 환자의 예후를 증진할 수 있는 새로운 치료전략을 제시했습니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. 제가 소속되어 있는 카이스트 바이오및뇌공학과의 시스템생물학 및 바이오영감공학 연구실은 전자공학/전산/수학 등의 원리를 생명과학에 응용하여 복잡한 생명현상의 숨겨진 동작원리를 시스템 차원에서 규명하고, 생명현상을 체계적으로 제어하는 융합연구를 추구하고 있습니다. 특히 다양한 생명현상의 숨겨진 메커니즘을 파악하기 위해 세포 내 유전자 조절 네트워크의 수학모델을 정립한 후, 컴퓨터 시뮬레이션 분석, 복잡계 네트워크 분석 등을 수행하고, 그 결과를 분자세포생물학 실험으로 검증하는 시스템생물학 기반의 융합원천기술을 다수 개발해 왔습니다. 한편 Bio-IT 융합연구를 추구하는 연구실이기 때문에 다양한 전공(전기 및 전자공학, 생명과학, 전산, 수학, 바이오및뇌공학 등)의 사람들이 함께 연구하고 있으며, 다른 전공자들과의 협업이 매우 빈번합니다. 그렇기 때문에 여러 사람들이 소규모 그룹을 조직하여 같은 문제를 함께 풀어나가거나 자유로운 분위기 속에서 선배와 후배들이 활발한 디스커션을 할
- Cancer Res.
- 2023.02.14
A cell fate reprogramming strategy reverses epithelial-to-mesenchymal transition of lung cancer cells while avoiding hybrid states
- Cancer Res. January 11 2023 | https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-22-1559
- 2023.01
- 생명과학
차준하

연세대학교

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 단일세포 전사체 데이터는 전사체를 세포별로 시퀀싱 할 수 있는 기술로써, 현재 암 면역학, 발생학, 신경생물학 등 다방면의 생물학 분야에서 활용되고 있는 핵심 데이터입니다. 단일세포 데이터는 높은 활용성에 비해 분석 종류가 협소한 편인데, 바로 데이터의 spurious transcription burst와 sparsity로 인해 분석하기가 상당히 까다롭기 때문입니다. 특히 네트워크 생물학 관점에서, 단일세포 데이터를 통한 세포 타입 특이적 유전자 네트워크 모델링하는 것은 굉장히 어렵기 때문에 현재까지는 자주 활용되지 못하고 있습니다. 네트워크 생물학은 기존 질병 연구에서 성공적으로 도입되어 개체단위에서 어떤 유전자가 질병과 관련 있는지에 대한 정보를 줄 수 있었습니다. 이것을 확장해 세포타입 단위로 우리가 알 수 있다면 효울적인 약 개발에 이바지하여 정밀 의학에 굉장한 도움이 될 것으로 예측이 됩니다. 단일세포 전사체 데이터만을 활용하여 네트워크를 모델링을 새로 하지 않고, 기존에 여러 데이터를 통해 만든 신뢰도 높은 reference interactome을 활용하여, 세포안에서 이 interactome의 일부가 유전자 네트워크를 형성할 것이라는 가정하에 scHumanNet이라는 소프트웨어를 개발하게 되었습니다. 이 연구는 저희 연구실에서 기존에 개발한 reference interactome HumanNet을 업데이트하는 과정에서 이인석 교수님께서 프로젝트를 고안하셨고, 하버드 의대와 Brigham and Women’s Hospital 소속, Evergrande Center의 Martin Hemberg 교수님의 공동지도 하에 연구가 끝까지 진행될 수 있었습니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. 위 연구는 연세대학교 이인석 교수님의 생명정보학 연구실과 Harvard Medical School 및 Brigham and Women’s Hospital의 Martin Hemberg 교수님 연구실의 공동 연구로 이루어졌습니다. 이인석 교수님의 연구실에서는 네트워크 생물학을 포함한 생명정보학 분야에서 다양한 연구주제를 가지고 활발하게 연구를 이어나가고 있습니다. 특히 단일세포 데이터를 접목한 암 연구와 장내미생물 WGS 데이터를 통한 질병 연구가 크게 두 개의 연구팀이 연구실의 주축을 이루고 있습니다. Dry lab이기에, 연구실 구성원은 전부 컴퓨터 분석을 전문으로 하고있고, 따
- Nucleic Acids Res.
- 2023.01.17
- 황효정(University of Illinois at Urbana-Champaign)
  Interview
- 권태준(울산과학기술원 (UNIST))
Regulation of RNA localization during oocyte maturation by dynamic RNA-ER association and remodeling of the ER
- Cell Reports Volume 41, Issue 11, 13 Dec 2022, 111802 | https://doi.org/10.1016/j.celrep.2022.111802
- 2022.12
- 의약학