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1mRNA splicing regulation

'mRNA splicing regulation' 에 대한 통합검색결과 32건입니다.

한빛사32건

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관련도순

- Thi Kim Hang Nguyen(전남대학교)
- 강훈승(전남대학교)
Reading m6A marks in mRNA: A potent mechanism of gene regulation in plants
- J. Integr. Plant Biol. 04 October 2024 | https://doi.org/10.1111/jipb.13781
- 2024.10
- 생명과학
- 서준배(Iowa State University)
  Interview
A super minigene with a short promoter and truncated introns recapitulates essential features of transcription and splicing regulation of the SMN1 and
- Nucleic Acids Res. Jan 12 2024, gkad1259 | https://doi.org/10.1093/nar/gkad1259
- 2024.01
- 생명과학
서준배

Iowa State University

척수근위축증(Spinal Muscular Atrophy, SMA 은 Survival Motor Neuron(SMN1) 유전자의 돌연변이에 의해 SMN 단백질 결핍과 SMN2 유전자의 엑손(exon) 7의 손실에 의한 SMN 단백질 기능을 상실한 단백질(SMNΔ7) 발현 때문에 발생하는 유아 유전병입니다. SMN1 유전자가 결핍되어도 SMN2 유전자 엑손 7의 포함 유무에 따라 정상적인 기능을 하는 SMN 단백질이 발현할 수 있습니다.
- Nucleic Acids Res.
- 2024.01.17
- Umme Amara(전남대학교)
- 강훈승(전남대학교)
FLK is an mRNA m6A reader that regulates floral transition by modulating the stability and splicing of FLC in Arabidopsis
- Mol. Plant. Volume 16, Issue 5, 1 May 2023 | https://doi.org/10.1016/j.molp.2023.04.005
- 2023.05
- 생명과학
The implications of alternative pre-mRNA splicing in cell signal transduction
- Exp. Mol. Med. 2023 Apr;55(4):755-766 | https://doi.org/10.1038/s12276-023-00981-7
- 2023.04
- 생명과학
- 양재성(Centre for research in agricultural Genomics (CRAG))
Matrix-screening reveals a vast potential for direct protein-protein interactions among RNA binding proteins
- Nucleic Acids Res. Published: 16 June 2021 | https://doi.org/10.1093/nar/gkab490
- 2021.06
- 생명과학
- 염규현(University of California, Los Angeles)
Tracking pre-mRNA maturation across subcellular compartments identifies developmental gene regulation through intron retention and nuclear anchoring
- Genome Res. Published in Advance April 8, 2021 | 10.1101/gr.273904.120
- 2021.04
권오성

IBENS(Institut de Biologie de l'?cole Normale Sup?rieure)

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 mRNA의 translation은 central dogma의 최종 단계로 수많은 RNA binding protein과 translation factor들에 의해 정밀하게 조절됩니다. 정량적인 translation regulation도 중요하지만, 제가 관심있게 연구한 것은 어떤 mRNA가 어디에서 번역이 되는 지와 그것이 과연 어떻게 그리고 왜 그곳에서 번역이 되는가 였습니다. 기존의 mRNA localization은 주로 early embryo나 oocyte에서 발견되었으며, cell fate decision에 관여하는 것으로 많이 알려져 있었습니다. 이 중 가장 유명한 예 중 하나인 oskar mRNA는 Drosophila oocyte에 posterior pole에 위치하게 되는데, 이는 첫번째 exon-exon junction에 위치한 Exon junction complex (EJC)가 중요한 역할을 한다고 알려져 있습니다. EJC는 mRNA splicing 과정 중 exon-exon junction의 upstream에 assembly되어 splicing regulation, mRNA export, translation enhancement, 그리고 nonsense mediated mRNA decay 등 다양한 기능을 가지고 있는데, EJC에 의한 mRNA localization은 이전까지 Drosophila oskar mRNA 단 하나만 밝혀져 있었습니다. 생리학적으로는 EJC core protein이 사람과 쥐의 뇌에서 neural stem cell division과 분화에 중요하다고 알려져 있었습니다. 제가 합류하기 전, 저희 연구실의 박사과정 학생이 mouse neural stem cell에서 EJC 단백질들을 관찰한 결과 centrosome 주변에 EJC core protein들이 축적되어 있다는 것을 우연히 발견하게 되었고, 제가 합류한 뒤 공동 연구팀이 Centrosome과 관련된 600개가 넘는 mRNA들을 smFISH screening으로 확인한 결과 2개의 mRNA, 즉 BICD2 와 NIN mRNA가 centrosome 주위에 위치하는 것을 발견했습니다. 이 연구와 함께 잠시 참여한 공동 연구로 523개의 mRNA 위치를 살펴본 결과 기존의 알려진 대로 translation이 저해된 상태에서 RNA binding protein이 mRNA를 이동시키기 보다는 대부분의 특정 위치에 존재하는 mRNA들은 translation 의존적으로 transport 됨을 알게 되었고 (A Dual Protein-mRNA Localization Screen Reveals Compartmentalized Translation and Widespread Co-translational RNA Targeting. Dev cell), 이를 centrosome에 존재하는 NIN 과 BICD2 mRNA에서 확인한 결과 BICD2 mRNA는 translation에 의해서만 이동되지
- Nat. Commun.
- 2021.03.08
이승재

Sloan Kettering Institute

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 mRNA의 3’UTR은 단백질로 번역되지 않는 부분이지만, RNA의 발현 조절 혹은 localization 등에 영향을 미친다고 알려져 있습니다. 가장 쉬운 예로 miRNA는 3’UTR의 상보적인 서열에 결합하여 target 유전자의 발현을 조절합니다. 하지만 동일한 ORF를 갖는 유전자라고 하더라도, 다양한 길이의 3’UTR을 갖는 isoform들이 존재합니다. 흥미롭게도, 다양한 3’UTR isoform들은 tissue에 특이적으로, context 특이적인 발현 패턴을 보입니다. 일반적으로 cancer cell에서는 짧은 3’UTR을 갖는 isoform이 많고, neural tissue에서는 특별히 긴 3’UTR을 갖는 isoform이 발현합니다. 어떻게 이런 현상이 발생하는 것일까요? 이러한 pattern을 만드는 특별한 기작이 있을까요? 3’UTR의 기능이 무엇이길래, 생명체가 이러한 특이적인 3’UTR pattern을 만들어 내는 것일까요? 이 논문에서 저희는 전반적인 neuronal extended 3’UTR을 생성하는데 중요한 역할을 하는 trans-acting factor를 발굴하고 관련 기작을 확인하였습니다. ELAV는 초파리를 연구하시는 분들에게는 매우 친숙한 유전자 입니다. 가장 유명한 neuronal marker지만, 30년이 넘는 시간 동안 유전자의 transcriptome을 조절하는 필수적인 기능은 확실히 밝혀지지 못하였습니다. 저희는 이 논문에서, ELAV/Hu RNA 결합 단백질인 ELAV, FNE, RBP9이 3’UTR extension을 야기하는데 필수적인 역할을 하며, 흥미롭게도 ELAV가 같은 family member인 FNE의 특정 micro-exon의 splicing에 직접적으로 영향을 주어 FNE의 subcellular localization을 조절함을 확인하였습니다. 즉, 중요한 core 단백질이 유사한 기능을 갖는 family 단백질의 cassette exon splicing 조절을 통해 기능적인 rescue를 유도한다는 새로운 컨셉을 제시하였습니다. 또한 이 연구와 동시에 follow up study로 ELAV/Hu 단백질이 3’UTR의 길이 뿐만 아니라, 여러 neuronal alternative splicing event (alternative last exon, cassette exon splicing)을 조절함을 확인하였습니다. 논문은 현재 review중에 있으며, preprint는 아래의 링크에서 확인하실 수 있습니다. 함께 읽어보시면 좋을 것 같습니다. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.09.21.305912v1 저는 이 논문의 공동1저자로 생명정보학 분
- Mol. Cell
- 2020.10.15
Molecular Mechanisms Driving mRNA Degradation by m6A Modification
- Trends Genet. Available online 18 January 2020 | https://doi.org/10.1016/j.tig.2019.12.007
- 2020.01
- 생명과학
- 이연진(University of California Berkeley)
Coordinate regulation of alternative pre-mRNA splicing events by the human RNA chaperone proteins hnRNPA1 and DDX5
- Genes Dev. Published in Advance July 24, 2018, doi: 10.1101/gad.316034.118
- 2018.07
- 조용석(University of Texas Southwestern Medical Center at Dallas)
Regulation of Yki/Yap subcellular localization and Hpo signaling by a nuclear kinase PRP4K
- Nat. Commun. Published online: 25 April 2018, 9, Article number: 1657 | doi:10.1038/s41467-018-04090-2
- 2018.04
- 이진아(Weill Cornell Medicine)
Post-transcriptional Regulation of De Novo Lipogenesis by mTORC1-S6K1-SRPK2 Signaling
- Cell Available online 16 November 2017 | DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2017.10.037
- 2017.11
- 의약학
- 오정민(University of Pennsylvania School of Medicine)
U1 snRNP telescripting regulates a size–function-stratified human genome
- Nat. Struct. Mol. Biol. Published online 02 October 2017 | doi:10.1038/nsmb.3473
- 2017.10
- 생명과학
- 정호성(연세대학교)
Dynamic Axonal Translation in Developing and Mature Visual Circuits
- Cell 166, 1-12, June 30, 2016 | doi:10.1016/j.cell.2016.05.029
- 2016.06
- 의약학
- 정호성(연세대학교)
Dynamic Axonal Translation in Developing and Mature Visual Circuits
- Cell 166, 1-12, June 30, 2016 | doi:10.1016/j.cell.2016.05.029
- 2016.06
- 의약학
Splicing-independent loading of TREX on nascent RNA is required for efficient expression of dual-strand piRNA clusters in Drosophila
- Genes Dev. April 1, 2016 30: 840-855 | doi: 10.1101/gad.276030.115
- 2016.04
- 생명과학
- 이나라(Yale University School of Medicine)
EBV noncoding RNA EBER2 interacts with host RNA-binding proteins to regulate viral gene expression
- Proc. Natl. Acad. Sci. USA Published online before print March 7, 2016 | doi: 10.1073/pnas.1601773113
- 2016.03
- 이규완(University of California, Berkeley)
- 이평세(University of California at Berkeley)
Quantitative imaging of single mRNA splice variants in living cells
- Nat. Nanotechnol. Published online 20 April 2014 | doi:10.1038/nnano.2014.73
- 2014.04
- 바이오·의료융합
- 윤제현(National Institutes of Health)
Posttranscriptional Gene Regulation by Long Noncoding RNA
- J. Mol. Biol. Volume 425, Issue 19, 9 October 2013, Pages 3723–3730 | doi:10.1016/j.jmb.2012.11.024
- 2013.10
- 생명과학