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1m6A mRNA modification

'm6A mRNA modification' 에 대한 통합검색결과 21건입니다.

한빛사21건

최신순
관련도순

- Thi Kim Hang Nguyen(전남대학교)
- 강훈승(전남대학교)
Reading m6A marks in mRNA: A potent mechanism of gene regulation in plants
- J. Integr. Plant Biol. 04 October 2024 | https://doi.org/10.1111/jipb.13781
- 2024.10
- 생명과학
- 이혜민(University of Texas MD Anderson Cancer Center)
VHL governs m6A modification and PIK3R3 mRNA stability in clear cell renal cell carcinomas
- J. Clin. Invest. Apr 15 2024, 134 (8) e179560 | https://doi.org/10.1172/JCI179560
- 2024.04
The m6A reader ECT1 drives mRNA sequestration to dampen salicylic acid-dependent stress responses in Arabidopsis
- Plant Cell Dec 02 2023, koad300 | https://doi.org/10.1093/plcell/koad300
- 2023.12
- 생명과학
- Umme Amara(전남대학교)
- 강훈승(전남대학교)
FLK is an mRNA m6A reader that regulates floral transition by modulating the stability and splicing of FLC in Arabidopsis
- Mol. Plant. Volume 16, Issue 5, 1 May 2023 | https://doi.org/10.1016/j.molp.2023.04.005
- 2023.05
- 생명과학
- 강훈승(Jiangsu Normal University, 전남대학교)
N6-methyladenosine RNA methylation modulates liquid?liquid phase separation in plants
- Plant Cell Published: 10 April 2023 | https://doi.org/10.1093/plcell/koad103
- 2023.04
- 생명과학
김형석

가톨릭대학교 의과대학 (현, 고신대학교)

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 RNA 변형 (RNA modification)은 전사 후 스플라이싱이나 교정, 변형 등에 의해서 RNA 자체 안정성을 조절하여 세포의 운명을 결정하는 등 생체 내 매우 정교하고 복잡한 과정을 조절합니다. 과거에는 주로 rRNA나 tRNA에 주로 발생하는 것으로 알려졌으나, 생명과학기술이 발달하며 mRNA나 lncRNA, 심지어 miRNA에서도 화학 변형이 알려지고 있고, 최근에는 후성전사체 (Epitranscriptome)라는 용어로 새롭게 떠오르는 학문으로 주목받고 있습니다. 대표적인 RNA의 변형으로는 N 6 -methyladenosine (m 6 A), 5-methylcytidine (m 5 C), pseudouridine (Ψ), 2′-O-methylcytidine (Cm), N 7 -methylguanosine (m 7 G) 등이 알려져 있으며, adenosine의 탈아미노화로 인한 inosine 교정 (Adenosine-to-Inosine, A-to-I editing) 또한 가장 잘 알려진 RNA 변형 기전 중 하나입니다 (그림 1). 제가 연구한 논문에서 다룬 A-to-I 교정은 주로 ADAR (Adenosine Deaminase Acting on double-stranded RNA)라는 탈아미노화 효소에 의해서 일어납니다. ADAR 효소는 ADAR1, ADAR2, ADAR3 세 가지로 나누어지는데 TCGA의 간암 빅데이터와 저희 연구실에서 확립한 다단계 간질환 환자 빅데이터를 분석하여 확인했을 때, ADAR1이 비정상적인 유전자 증폭 현상에 의해서 단백질 발현이 증가되고 이렇게 증가된 ADAR1은 더욱 간암을 촉진시킨다 라는 사실을 확인할 수 있었습니다. 간암 발생에서 ADAR1은 AZIN1 단백질을 암호화하는 mRNA의 비정상적 A-to-I 교정 유발 인자로 가장 잘 알려져 있었습니다. 저는 당시 miRNA 연구를 활발하게 하고 있는 중이었고, miRNA의 프로세싱 과정 중 이중가닥을 형성하기 때문에 ADAR의 이름 뜻처럼 RNA 이중가닥에 부착하며 간암에서 증가되어 있는 ADAR1이 miRNA의 A-to-I 교정을 유도할 것이라는 가설을 세웠습니다. 교정이 일어난 miRNA를 찾는 과정은 제가 잘 이해할 수 없는 복잡한 컴퓨터 알고리듬을 필요로 했기 때문에 시작부터 그 과정들은 험난했지만, 마침내 miR-3144-3p라는 miRNA의 seed region에 ADAR1에 의한 A-to-I 교정이 일어난다는 사실을 확인할 수 있었습니다. A-to-I 교정이 일어난 miRNA의 후보들의 결과물을 처음 보았을 때는 그 개수가 많지 않았고 miRNA의 A-to-I 교정 비율 (editing rate)도 높지 않았
- Exp. Mol. Med.
- 2023.01.06
- 부성호(고려대학교)
- 김윤기(KAIST)
m1A and m6A modifications function cooperatively to facilitate rapid mRNA degradation
- Cell Reports Volume 40, Issue 10, 6 September 2022, 111317 | https://doi.org/10.1016/j.celrep.2022.111317
- 2022.09
- 생명과학
UPF1 promotes rapid degradation of m6A-containing RNAs
- Cell Reports Volume 39, Issue 8, 24 May 2022, 110861 | https://doi.org/10.1016/j.celrep.2022.110861
- 2022.05
- 생명과학
- 양승원(University of Chicago)
METTL14 facilitates global genome repair and suppresses skin tumorigenesis
- Proc. Natl. Acad. Sci. USA August 31, 2021 118 (35) e2025948118; https://doi.org/10.1073/pnas.2025948118
- 2021.08
- 생명과학
- 양승원(University of Chicago)
METTL14 facilitates global genome repair and suppresses skin tumorigenesis
- Proc. Natl. Acad. Sci. USA August 31, 2021 118 (35) e2025948118; https://doi.org/10.1073/pnas.2025948118
- 2021.08
- 생명과학
- 이지훈(University of Texas Health Science Center at San Antonio)
- 홍주영(University of Texas Health Science Center at San Antonio)
Regulation of telomere homeostasis and genomic stability in cancer by N6-adenosine methylation (m6A)
- Sci. Adv. 28 Jul 2021: Vol. 7, no. 31, eabg7073 | DOI: 10.1126/sciadv.abg7073
- 2021.07
- 생명과학
- 조성윤(Weill Cornell Medicine, Cornell University)
  Interview
- 이진아(Weill Cornell Medicine, 현 University of California, Irvine)
mTORC1 promotes cell growth via m6A-dependent mRNA degradation
- Mol. Cell Available online 22 March 2021 | https://doi.org/10.1016/j.molcel.2021.03.010
- 2021.03
- 의약학
RNA demethylation by FTO stabilizes the FOXJ1 mRNA for proper motile ciliogenesis
- Dev. Cell Published: March 23, 2021 | DOI:https://doi.org/10.1016/j.devcel.2021.03.006
- 2021.03
- 생명과학
- 김건우(University of California, San Diego)
Hepatitis B virus X protein recruits methyltransferases to affect cotranscriptional N6-methyladenosine modification of viral/host RNAs
- Proc. Natl. Acad. Sci. USA January 19, 2021, 118 (3): e2019455118 | https://doi.org/10.1073/pnas.2019455118
- 2021.01
- 생명과학
Molecular Mechanisms Driving mRNA Degradation by m6A Modification
- Trends Genet. Available online 18 January 2020 | https://doi.org/10.1016/j.tig.2019.12.007
- 2020.01
- 생명과학
- 윤기준(University of Pennsylvania)
[Preview]Epitranscriptomes in the Adult Mammalian Brain: Dynamic Changes Regulate Behavior
- Neuron Volume 99, Issue 2, p243-245, 25 July 2018 | DOI: https://doi.org/10.1016/j.neuron.2018.07.019
- 2018.07
- 생명과학
윤기준

University of Pennsylvania, Johns Hopkins University School of Medicine

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 Methylated RNA의 존재는 40여년 전부터 알려져 있었지만, mRNA에 일어나는 chemical modification이 mRNA의 biological function에 영향을 준다는 사실은 최근에 와서야 밝혀지고 각광을 받게 되었지요. 제게 mRNA 의 reversible chemical modification이 존재하고 다양한 기능이 있다는 사실은 크게 흥미로웠고, embryonic stem cell에서는 다른 group들에서 연구를 수행하였지만, nervous system에서는 아직 연구가 전혀 되어 있지 않았기 때문에 연구를 시작하게 되었습니다. m6A RNA modification은 RNA에 일어나는 100여 종류의 chemical modification 중에서 가장 흔하게 발견되는 modification 입니다. 다행스럽게도 m6A를 mRNA에 붙여주는 enzyme complex인 Mettl3와 Mettl14 protein의 존재가 몇 년 전에 알려지게 되었습니다. 그래서 저희 group은 embryonic neural stem cell에서 Mettl14 conditional knockout을 이용해, m6A modification 을 없앤 다음에 stem cell behavior와 전체 brain development의 변화를 관찰하기로 하였습니다. 1) 천천히 행동하는 neural stem cell Radial glial cell (RGC)은 embryonic brain development 동안 가장 주요한 neural stem cell 입니다. 긴 radial process를 지닌 이 세포들은 이 process를 이용해서 새로 만들어진 neuron들이 이동하기 때문에 과거에는 neuronal migration을 support하는 세포로 생각했었습니다. 이후에 이 radial glial cell들이 발달하는 대뇌에서 대부분의 neuron, astrocyte 그리고 oligodendrocyte들을 다 만들어낼 수 있는 origin이라는 것이 밝혀졌지요. RGC들은 여러 번의 세포분열을 통해서 daughter cell들을 생산해 내는데, 처음에는 deep layer neuron, upper layer neuron, 그리고 이후에는 astrocyte와 oligodendrocyte progenitor들을 순서대로 만들어내고, 아기가 태어난 이후에는 대부분의 brain region에서 depletion되게 됩니다. 이때 남게 되는 일부의 neural stem cell들을 우리가 adult neural stem cell이라고 부르지요. m6A RNA modification을 제거한 Mettl14 knockout mouse를 분석하면서 저희가 가장 놀라웠던 점은 정상 생쥐에서 이미 depletion 되어 있는 RGC들이 생후에도 계속 존재한다는 점이었어요. 외형상 Mettl14 knockout mouse의 brain은 생후에도 embryo에서
- Cell
- 2017.11.06
- 윤기준(University of Pennsylvania, Johns Hopkins University School of Medicine)
  Interview
Temporal Control of Mammalian Cortical Neurogenesis by m6A Methylation
- Cell Available online 28 September 2017 | https://doi.org/10.1016/j.cell.2017.09.003
- 2017.09
- 생명과학
- 최준호(Harvard Medical School, Boston Children’s Hospital)
  Interview
The m6A Methyltransferase METTL3 Promotes Translation in Human Cancer Cells
- Mol. Cell 62, 1-11, May 5, 2016, DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2016.03.021
- 2016.05
최준호

Harvard Medical School, Boston Children’s Hospital

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 본 연구는 현재 세계적으로 hot issue인 N6-methyladenosine (m6A) modification과 그 mRNA modification에 관련하는 m6A Methyltransferase METTL3 라는 단백질에 관련된 연구 입니다. m6A는 mRNA에서 양적으로 가장 많이 볼 수 있는 modification으로서 최근에 Cell 과 Nature 등 여러 논문에 발표되는 연구 소재 입니다. m6A modification에는 세포 핵에서 METTL3 와 METTL14 이라는 단백질이 관련한다고 보고가 되어 있습니다. 이번 연구에서는 METTL3 단백질이 세포질에서도 존재 하는 것을 밝히고 target mRNA들의 양적인 변화 없이 translation 증가에 관여한다는 논문 입니다. 또한 METTL3를 shRNA를 이용하여 knock down 시켰을 때 여러 cancer cell line들의 apoptosis가 증가하고 growth 또한 느려지는 것을 관찰할 수 있었습니다. mRNA의 expression, stability 그리고 translation을 연구하는 것은 세포가 제대로 성장하고 제 역할을 하는데 있어 가장 중요하고 기초가 되는 분야를 연구하는 것으로써 여러 다른 세부적인 분야 연구에 기초가 될 뿐만 아니라 신약 개발에도 현재 아주 중요한 연구 분야입니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁 드립니다. 이번 연구는 Boston children's Hospital (BCH)의 Richard Gregory 교수님 연구실에서 이루어 졌습니다. Richard Gregory 교수님은 BCH와 Harvard에 소속되어 계시고 miRNA biogenesis를 주로 연구 하신 세계적으로 널리 알려진 교수님이십니다. 최근에는 Embryonic Stem cell 과 Cancer cell에서의 RNA biology로 그 연구 분야를 확장 하셨는데 세부적으로는 miRNA biogenesis, non-coding RNA, mRNA stability and expression 등을 연구하십니다. 3. 연구활동 하시면서 평소 느끼신 점 또는 자부심, 보람 처음에는 이 분야가 적성에 맞는지 조차도 의심이 갔었습니다. 그만큼 지칠 때도 많고 어려움도 많았습니다. 이 실험실에 Post-doc으로 온지 만 2년이 다 되어 갑니다. 처음 1년간은 적응을 잘 못해서 실험실을 다른 곳으로 옮길까도 많이 고민하고 석,박사 지도 교수님이신 고려대학교의 김윤기 교수님께도 조언을 구하고 했었습니다. 김윤기 교수님께서 조금만 참고 적응을 해 나가면 좋은 결과가 있을 것이라고 말씀해 주셨던 것이 생각이 나네요. 1년쯤 지난 뒤 현
- Mol. Cell
- 2016.05.02