Spatial OMICs > 통합검색 | BRIC

통합검색

한빛사

내가 찾은 검색어

1Spatial OMICs

'Spatial OMICs' 에 대한 통합검색결과 16건입니다.

한빛사16건

최신순
관련도순

은정우

아주대학교 의과대학

간세포암종(hepatocellular carcinoma, HCC)은 전 세계적으로 암 관련 사망률 3위에 해당하는 치명적인 질환입니다. 간암은 조기 발견이 어렵고, 진단 시점에서 이미 진행된 경우가 많아 치료가 제한적입니다. 하지만 더 큰 문제는 치료 이후에도 환자의 70~80%가 재발한다는 점입니다. 간암의 높은 재발률은 환자의 생존율을 낮추는 중요한 요인이며, 이를 효과적으로 예측할 수 있는 바이오마커가 절실히 필요합니다.
- Clin. Mol. Hepatol.
- 2025.02.10
임동민

부산대학교

현재 피부과학(dermatology)과 유전체학(genomics) 분야에서는 태아 발달 시 피부 세포의 이동 경로를 나타내는 블라쉬코 선(Blaschko’s lines)을 기반으로 발생하는 다양한 피부 질환에 대한 연구가 활발하게 진행되고 있습니다. 알프레드 블라쉬코(Alfred Blaschko)가 1901년에 처음 기술한 이 선은 일부 선형 피부질환에서 뚜렷하게 드러나며, 특히 lichen striatus (LS)와 같은 질환에서 그 특징이 명확하게 나타납니다.
- J. Am. Acad. Dermatol.
- 2025.02.10
- 이주아(Northwestern University, 현 Boston University)
  Interview
- 안현주(충남대학교)
Deciphering mouse brain spatial diversity via glyco-lipidomic mapping
- Nat. Commun. 07 October 2024 | https://doi.org/10.1038/s41467-024-53032-8
- 2024.10
- 생명과학
HepScope: CNN-based single-cell discrimination of malignant hepatocytes
- J. Big Data 27 October 2024;11,149 | https://doi.org/10.1186/s40537-024-01024-2
- 2024.10
- 의약학
Matrisomics: Beyond the extracellular matrix for unveiling tumor microenvironment
- Biochim. Biophys. Acta-Rev. Cancer Sep 04 2024, S0304-419X(24)00109-4 | https://doi.org/10.1016/j.bbcan.2024.189178
- 2024.09
- 생명과학
- 박지원(Weill Cornell Medicine (Cornell University) and Harvard Medical School)
Spatial multi-omics of human skin reveals KRAS and inflammatory responses to spaceflight
- Nat. Commun. Jun 11 2024, 15 (1) 4773 | https://doi.org/10.1038/s41467-024-48625-2
- 2024.06
- 의약학
- 김장근(Weill Cornell Medicine)
Single-cell multi-ome and immune profiles of the Inspiration4 crew reveal conserved, cell-type, and sex-specific responses to spaceflight
- Nat. Commun. Jun 11 2024, 15 (1) | https://doi.org/10.1038/s41467-024-49211-2
- 2024.06
Mapping cancer biology in space: applications and perspectives on spatial omics for oncology
- Mol. Cancer Jan 30 2024, 23 (1) | https://doi.org/10.1186/s12943-024-01941-z
- 2024.01
- 바이오·의료융합
- 최종수(Baylor College of Medicine)
Spatial organization of the mouse retina at single cell resolution by MERFISH
- Nat. Commun. 2023 Aug 15;14(1):4929 | https://doi.org/10.1038/s41467-023-40674-3
- 2023.08
- 생명과학
박안나

한국생명공학연구원, 현 University of Michigan Medical School

현대 사회는 고령화와 생활 습관의 서구화로 인한 비만, 그로인한 대사성 질환이 증가하고 있는 추세입니다. 비만은 체내 에너지의 축적과 소비 사이의 불균형으로 발생하는데, 이에 대한 예방 및 치료적 개입에 중점을 두고 체내 에너지 항상성 조절의 주요한 역할을 하는 지방조직을 타켓으로 연구를 진행하였습니다.
- Nat. Commun.
- 2023.06.28
- 조훈용(University of North Carolina at Chapel Hill)
- 구현(University of Pennsylvania)
Selenomonas sputigena acts as a pathobiont mediating spatial structure and biofilm virulence in early childhood caries
- Nat. Commun. 22 May 2023 | https://doi.org/10.1038/s41467-023-38346-3
- 2023.05
- 박한얼(연세대학교, 서울대학교)
- 손창호(연세대학교)
Spatial Transcriptomics: Technical Aspects of Recent Developments and Their Applications in Neuroscience and Cancer Research
- Adv. Sci. 2023 Apr 7;e2206939 | https://doi.org/10.1002/advs.202206939
- 2023.04
- 의약학
- 박지원(Weill Cornell Medicine (Cornell University) and Rockefeller University)
Spatial omics technologies at multimodal and single cell/subcellular level
- Genome Biol. 2022 Dec 13;23(1):256 | https://doi.org/10.1186/s13059-022-02824-6
- 2022.12
- 의약학
박종찬

서울대학교 의과대학, University College of London

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 - 알츠하이머병과 같은 퇴행성 뇌질환의 경우, 다양한 원인이 작용하여 발생하는 Polygenic disease인 경우가 많습니다. 이는 질병의 대표적인 형질 (Phenotype)을 조절하려는 노력을 넘어서서, 그 안에 존재하는 환자의 하위 군집 (아형)을 발견하고 그 원인을 규명하는 것이 매우 중요함을 시사합니다. 즉, 환자의 아형을 밝히는 것은 해당 질병의 환자 맞춤형 치료를 위한 약물 개발을 위해서 필수라고 생각합니다. 이에 최근 연구들은, 단순한 Conventional drug discovery전략에서 벗어나 Computational methods와 Biological approach를 결합한 Bio-convergence (생물융합) 연구를 통해 조금 더 systemic하게 질병의 원인을 파악하려는 노력을 하고 있습니다. 본 연구는 170명의 알츠하이머병 환자를 대상으로 비지도 다중 오믹스 분석 (Unsupervised Multi-Omics Analysis)을 통해 환자의 아형을 발견하고, 종적 추적연구를 통해 그 원인을 찾아내어 뇌 오가노이드, 미세아교세포, 실제 환자 뇌 전사체 데이터 등을 통해 검증을 진행하였습니다. 이는 알츠하이머병 연구에서도 Bio-convergence 기법을 활용한 환자 맞춤형 정밀의학 신약개발 연구가 가능함을 보여주는 단적인 예라고 생각합니다. - 본 연구는 Multi-modal 데이터의 생산 (한국) - 데이터의 처리 및 분석 (영국)으로 나누어 진행된 한-영간 Collaboration 연구입니다. 본 연구자는 양국의 지도교수님과 함께 본 연구를 총 관할하며 제 1저자로써 모든 연구를 앞장서서 진행해왔습니다. 2019년 초부터 영국, 포르투갈, 한국 등에서의 출장 및 미팅을 시작으로, 영국측 지도교수님 이신 Prof. Sir. John Hardy의 초청으로 University College London에서 Post-doc Fellow로 일하며 연구를 진행하였었습니다. 물론 코로나로 어려운 시기에 영국에 있다 보니 아름다운 영국이란 나라를 즐길 시간은 다소 부족하였지만, 그만큼 연구에 몰두하여 좋은 성과를 낼 수 있었다고 생각합니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. - University College London (UCL)은 런던의 중심부에 위치한 세계대학순위 8위의 명문 대학교입니다. Professor John Hardy, Karen Duff, Bart De Strooper, Nick Fox, Henrik Zetterberg와 같은 치매 연구의 세계적인 대가
- Adv. Sci.
- 2022.08.01
조춘석

University of Michigan Medical School

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 몸속 장기들은 각기 다른 기능을 담당하는 다양한 세포군으로 이루어져있는데, 이러한 세포군의 공간적인 위치는 그들의 독특한 기능과 깊이 연관되어 있습니다. Single cell RNA-sequencing (scRNA-Seq)은 개별 세포의 발현된 RNA의 총합 (전사체, transcriptome)을 밝혀서 cell subpopulation을 분류하고 특징지을 수 있는 좋은 분석법이지만, 분석과정 중 single cell isolation을 위해 필수적으로 해야 하는 tissue dissociation을 거치면서 spatial location에 대한 정보는 잃어버리게 됩니다. paracrine같은 세포간의 신호전달과 세포간 상호작용에 필수적인 spatial information을 잃어버림으로 장기나 조직의 기능을 세포수준에서 완전히 이해하지 못하게 됩니다. 공간전사체학 (spatial transcriptomics)은 scRNA-seq으로 확인한 mRNA프로파일을 통해 여러 세포군을 식별하고, 이것들의 위치를 2차원 조직 위에 물리적으로 지정하는 분석방법입니다. 먼저 슬라이드 위에 Spatial information을 얻기 위해 이미 알고 있는 특정 조합의 염기서열 (위치바코드, spatial barcode)을 지닌 mRNA-capturing probe를 심고, 여기에 분석할 조직을 올린 후 조직의 mRNA들을 probe에 상보적으로 결합시킵니다. 이후 reverse transcription과 여러 번의 PCR을 통해, 이 mRNA의 cDNA library를 합성/증폭하고, RNA-sequencing을 통해 전체 RNA transcript를 얻은 후, spatial barcode 정보로 조직위의 위치를 확인하게 되면 2차원적 조직에서 어떠한 세포들이 어떠한 mRNA를 가지고 있는지 알게 됩니다. 이러한 spatial barcoding을 위해 현재 microprinting, microbeads, microfluidic devices의 방법을 쓰고 있지만 기술적인 한계로 인해 해상도가 낮은 문제가 있습니다. 많이 쓰는 10X Genomics의 VISIUM의 경우 100micron이나 되고, 이후 계속해서 Slide-Seq, HDST, DBiT-Seq 등의 좋은 방법들이 개발되고 있지만, 여전히 해상도는 낮은 편입니다. 이러한 해상도 문제를 해결하기 위해 저희가 개발한 Sequence-Scope (Seq-Scope) 방법은, 이미 Next-Generation Sequencing을 위해 상용화된 illumina sequencing platform을 이용해 random barcode oligomer를 solid-phase amplification을 통해 증폭하여 cluster를 만들기에 이것들의 간격이 0.5~0.8micron
- Cell
- 2021.06.25
Spatial and temporal diversity of glycome expression in mammalian brain
- Proc. Natl. Acad. Sci. USA First published November 2, 2020 | https://doi.org/10.1073/pnas.2014207117
- 2020.11

1