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1Single-cell multiomics

'Single-cell multiomics' 에 대한 통합검색결과 10건입니다.

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- 정효빈(연세대학교)
Structural variant and nucleosome occupancy dynamics postchemotherapy in a HER2+ breast cancer organoid model
- Proc. Natl. Acad. Sci. USA Mar 04 2025, 122 (9) | https://doi.org/10.1073/pnas.2415475122
- 2025.03
- 정효빈(연세대학교)
Single-cell multiomics analysis reveals dynamic clonal evolution and targetable phenotypes in acute myeloid leukemia with complex karyotype
- Nat. Genet. 25 November 2024 | https://doi.org/10.1038/s41588-024-01999-x
- 2024.11
김봉준

University of Texas MD Anderson Cancer Center

폐는 공기중에 직접적으로 노출되어 있어, 다양한 박테리아, 바이러스, 또는 여러 환경 인자 (NO2, O3, 미세먼지, 담배연기 등)로 인해 미세한 손상을 입을 수 있습니다. 손상된 폐는 줄기/전구 (stem/progenitor) 세포들에 의해 재생 (regeneration) 되어 기능을 회복하지만, 전구 세포들이 제 기능을 하지 못하면 폐는 재생되지 않고 섬유화 (Fibrosis) 등의 질병이 발생할 수 있습니다.
- Nat. Commun.
- 2024.10.31
Context-aware single-cell multiomics approach identifies cell-type-specific lung cancer susceptibility genes
- Nat. Commun. 12 September 2024 | https://doi.org/10.1038/s41467-024-52356-9
- 2024.09
- 생명과학
Multiomics profiling of buffy coat and plasma unveils etiology-specific signatures in hepatocellular carcinoma
- Clin. Mol. Hepatol. Volume 30(3); Jul 2024 | https://doi.org/10.3350/cmh.2024.0042
- 2024.07
- 의약학
Advances in single-cell omics and multiomics for high-resolution molecular profiling
- Exp. Mol. Med. Mar 05 2024, | https://doi.org/10.1038/s12276-024-01186-2
- 2024.03
- 생명과학
Tracking antigen-specific TCR clonotypes in SARS-CoV-2 infection reveals distinct severity trajectories
- J. Med. Virol. Nov 2023, 95 (11) | https://doi.org/10.1002/jmv.29199
- 2023.11
- 의약학
이홍우

서울대학교

유전체의 3차원 구조는 유전자 발현 조절과 매우 밀접하게 연관되어 있습니다. 다양한 동물에서 topologically associating domain(TAD)이라고 불리는 주요한 3차원 폴딩 구조의 기능적 단위가 밝혀졌고, CTCF 단백질과 cohesin 복합체가 TAD 형성에 주요한 기여를 한다는 것이 알려졌습니다. 그러나, 식물에서는 이러한 CTCF 단백질이 보존되어 있지 않아,
- Nucleic Acids Res.
- 2023.09.15
Characterization of altered molecular mechanisms in Parkinson’s disease through cell type?resolved multiomics analyses
- Sci. Adv. 14 Apr 2023 Vol 9, Issue 15 | https://doi.org/10.1126/sciadv.abo2467
- 2023.04
- 생명과학
차준하

연세대학교

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 단일세포 전사체 데이터는 전사체를 세포별로 시퀀싱 할 수 있는 기술로써, 현재 암 면역학, 발생학, 신경생물학 등 다방면의 생물학 분야에서 활용되고 있는 핵심 데이터입니다. 단일세포 데이터는 높은 활용성에 비해 분석 종류가 협소한 편인데, 바로 데이터의 spurious transcription burst와 sparsity로 인해 분석하기가 상당히 까다롭기 때문입니다. 특히 네트워크 생물학 관점에서, 단일세포 데이터를 통한 세포 타입 특이적 유전자 네트워크 모델링하는 것은 굉장히 어렵기 때문에 현재까지는 자주 활용되지 못하고 있습니다. 네트워크 생물학은 기존 질병 연구에서 성공적으로 도입되어 개체단위에서 어떤 유전자가 질병과 관련 있는지에 대한 정보를 줄 수 있었습니다. 이것을 확장해 세포타입 단위로 우리가 알 수 있다면 효울적인 약 개발에 이바지하여 정밀 의학에 굉장한 도움이 될 것으로 예측이 됩니다. 단일세포 전사체 데이터만을 활용하여 네트워크를 모델링을 새로 하지 않고, 기존에 여러 데이터를 통해 만든 신뢰도 높은 reference interactome을 활용하여, 세포안에서 이 interactome의 일부가 유전자 네트워크를 형성할 것이라는 가정하에 scHumanNet이라는 소프트웨어를 개발하게 되었습니다. 이 연구는 저희 연구실에서 기존에 개발한 reference interactome HumanNet을 업데이트하는 과정에서 이인석 교수님께서 프로젝트를 고안하셨고, 하버드 의대와 Brigham and Women’s Hospital 소속, Evergrande Center의 Martin Hemberg 교수님의 공동지도 하에 연구가 끝까지 진행될 수 있었습니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. 위 연구는 연세대학교 이인석 교수님의 생명정보학 연구실과 Harvard Medical School 및 Brigham and Women’s Hospital의 Martin Hemberg 교수님 연구실의 공동 연구로 이루어졌습니다. 이인석 교수님의 연구실에서는 네트워크 생물학을 포함한 생명정보학 분야에서 다양한 연구주제를 가지고 활발하게 연구를 이어나가고 있습니다. 특히 단일세포 데이터를 접목한 암 연구와 장내미생물 WGS 데이터를 통한 질병 연구가 크게 두 개의 연구팀이 연구실의 주축을 이루고 있습니다. Dry lab이기에, 연구실 구성원은 전부 컴퓨터 분석을 전문으로 하고있고, 따
- Nucleic Acids Res.
- 2023.01.17

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