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'R-loop' 에 대한 통합검색결과 35건입니다.

한빛사35건

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김상인

기초과학연구원, 현 University of Pennsylvania

진핵 생물은 선형 염색체를 가지고 있으며, 그 끝부분은 TTAGGG 반복서열로 구성된 텔로미어 (Telomere)라고 합니다. 텔로미어는 특이한 T-loop 구조를 형성하여 염색체의 끝 부분을 DNA 이중나선 절단 (DNA Double-strand break)으로 인식되지 않도록 보호하고, 다른 염색체와의 결합을 방지하는 등의 중요한 기능을 합니다. DNA 복제는 5’에서 3’의 한쪽 방향으로만 진행되며, 선도 가닥 (Leading strand)과 달리 지연 가닥 (Lagging strand)은 짧고 불연속적 조각인 오카자키 절편 (Okazaki fragment)으로 합성됩니다.
- Nucleic Acids Res.
- 2024.09.24
- 최희진(National Institutes of Health (NIH))
RNA helicase D1PAS1 resolves R-loops and forms a complex for mouse pachytene piRNA biogenesis required for male fertility
- Nucleic Acids Res. Aug 20 2024, gkae712 | https://doi.org/10.1093/nar/gkae712
- 2024.08
REXO5 promotes genomic integrity through regulating R-loop using its exonuclease activity
- Leukemia Published: 30 July 2024 | https://doi.org/10.1038/s41375-024-02362-z
- 2024.07
- 바이오·의료융합
- 이서윤(한림대학교)
- 김재진(한림대학교)
PCAF promotes R-loop resolution via histone acetylation
- Nucleic Acids Res. Jun 28 2024, gkae558 | https://doi.org/10.1093/nar/gkae558
- 2024.06
- 생명과학
- 이재은(서울대학교)
  Interview
- 이현숙(서울대학교)
Disruption of G-quadruplex dynamicity by BRCA2 abrogation instigates phase separation and break-induced replication at telomeres
- Nucleic Acids Res. Apr 08 2024, gkae251 | https://doi.org/10.1093/nar/gkae251
- 2024.04
- 생명과학
이재은

서울대학교

텔로미어는 세포의 염색체 끝단을 보호하기 위해 존재하는 방패이자, 세포 분열 횟수를 제한하여 암화 되는 것을 막는 중요한 역할을 합니다. 무한한 세포증식을 하는 암세포는 이러한 텔로미어의 한계를 극복하는 것이 필수적인데 약 10-15%의 암세포는 텔로머라아제 (telomerase)라는 효소 대신 재조합으로 텔로미어를 합성합니다.
- Nucleic Acids Res.
- 2024.04.18
Impaired binding affinity of YTHDC1 with METTL3/METTL14 results in R-loop accumulation in myelodysplastic neoplasms with DDX41 mutation
- Leukemia Mar 21 2024, | https://doi.org/10.1038/s41375-024-02228-4
- 2024.03
- 의약학
황원찬

UNIST

골수이형성증후군 (myelodysplastic syndrome, MDS)은 골수에 존재하는 조혈세포에서 혈액세포 형성이상과 말초혈액에서 정상 혈액세포들이 줄어드는 악성질환이다. 증상은 매우 느리게 발생하며 환자에 따라 약간의 빈혈만 있거나 혈구감소에 따른 합병증 또는 급성백혈병으로 진행되어 사망하게 되는 질환이다. 정확하게 원인은 밝혀져 있지는 않으나 Somatic 또는 Germline으로 발생된 돌연변이에 의해 유전자 불안정성 축적이 질환을 가속화하는 것으로 알려져 있다.
- Leukemia
- 2024.03.28
윤정현

아주대학교 의과대학

전체 인간의 유전체 중 약 75%가 transcription 될 수 있고 그 중 약 2% 이하가 protein coding gene입니다. Transcription이 활발하게 일어나는 유전체는 DNA break에 취약하다고 알려져 있습니다. 이러한 DNA break을 올바르게 복구하지 못하게 되면, 유전체 염기서열의 돌연변이 및 손실이 발생되고 각종 암과 같은 질병이 될 가능성이 높아집니다.
- Nucleic Acids Res.
- 2024.03.05
김수빈

UNIST

DNA는 체내 생명활동의 근간이 되는 물질로, 복제 (replication)을 통해 유전정보를 다음 세대로 전달합니다. DNA 복제는 생명활동 영위와 유전에 필수적인 과정이지만, DNA 복제과정 도중 전사가 일어난다면 DNA 복제체 (replisome)와 RNA 전사체 (transcriptome) 사이에 충돌이 일어나서 DNA 복제가 멈출 수 있습니다.
- Nucleic Acids Res.
- 2023.12.12
- 김수빈(UNIST)
  Interview
- 이자일(UNIST)
Direct visualization of replication and R-loop collision using single-molecule imaging
- Nucleic Acids Res. Nov 22 2023, gkad1101 | https://doi.org/10.1093/nar/gkad1101
- 2023.11
- 생명과학
- 송홍선(DGIST)
- 기영훈(DGIST)
OTUD5 limits replication fork instability by organizing chromatin remodelers
- Nucleic Acids Res. Sep 15 2023, gkad732 | https://doi.org/10.1093/nar/gkad732
- 2023.09
- 생명과학
Translocating RNA polymerase generates R-loops at DNA double-strand breaks without any additional factors.
- Nucleic Acids Res. Aug 28 2023, gkad689 | https://doi.org/10.1093/nar/gkad689
- 2023.08
- 생명과학
이헌구

Mass General Hospital / Harvard Medical School

자폐성 스펙트럼 질병 Autism Spectrum Disorders (ASD) 은 다양한 원인에 의해서 발생할 수 있으며, 대부분 여러 유전자들의 복합적인 이상에 의해 발생합니다. 제가 연구하는 Fragile X syndrome (FXS) 은 자폐성 스펙트럼 질병 중 하나로, 뇌 발달에 중요한 역할을 하는 FMR1이라는 단 하나의 유전자가 발현이 되지 않아 생기는 질병으로 남성 3000명 중 한명,
- Cell
- 2023.07.10
- 박정언(Cornell University)
Multiple adaptations underly co-option of a CRISPR surveillance complex for RNA-guided DNA transposition
- Mol. Cell Volume 83, Issue 11, 1 June 2023 | https://doi.org/10.1016/j.molcel.2023.05.005
- 2023.06
- 생명과학
- 이헌구(Mass General Hospital / Harvard Medical School)
  Interview
Site-specific R-loops induce CGG repeat contraction and fragile X gene reactivation
- Cell 19 May 2023 | https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.04.035
- 2023.05
- 생명과학
- 박정언(Cornell University)
Structures of the holo CRISPR RNA-guided transposon integration complex
- Nature 2022 Nov 28 | https://doi.org/10.1038/s41586-022-05573-5
- 2022.11
- 생명과학
소아영

Universite Paris-Saclay, University of Texas, Austin

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 DNA는 모든 생물의 세포에서 유전 정보를 저장하고 전달하는 중요한 생체 분자입니다. 그렇기 때문에 매우 안정적으로 보존되어야 합니다. 하지만 여러 요소에 의하여 손상을 입고 repair가 제대로 되지 않는다면 genomic instability 뿐만 아니라 cancer를 유도할 수도 있습니다. 세포들은 여러 DNA repair mechanism을 가지고 있는데 상황에 적절한 repair mechanism의 선택은 genetic stability에 결정적입니다. 저희 랩에서는 이러한 mechanism들을 2-step competition model을 제안하며 설명하였습니다. 1. DNA Double-Strand Beak(DSB) 후, Canonical Non-Homologous End-Joining(C-NHEJ)에 의한 repair vs. Resection 2. Resection 후, Gene Conversion(GC) vs. Single-Strand Annealing(SSA) 혹은 Alternative End-Joining(A-EJ)에 의한 repair 여기에서 우리는 RAD51이 second step을 조절하여 non-conservative repair(SSA/A-EJ)를 방지하는 mechanism을 연구했습니다. GC의 key protein인 RAD51 또는 BRCA2를 억제하면 SSA와 A-EJ를 모두 stimulation하지만 C-NHEJ는 자극하지 않아 2-step competition model을 검증합니다. 세 가지 다른 Dominant Negative RAD51(DN-RAD51)은 GC를 억제하고 SSA/A-EJ를 자극했습니다. 그러나 네 번째 DN-RAD51은 GC를 효과적으로 억제함에도 불구하고, SSA/A-EJ를 억제했습니다. 살아있는 세포에서 SSA/A-EJ를 자극하는 3개의 DN-RAD51은 손상된 chromatin에 효율적으로 load되지 못하고 endogenous RAD51의 결합을 억제하는 반면, SSA/A-EJ를 억제하는 네 번째 DN-RAD51은 손상된 chromatin에 효율적으로 load됩니다. 따라서, RAD51에 의한 SSA/A-EJ 억제에는 GC를 촉진하는 능력보다 DNA에 대한 RAD51의 결합이 필요합니다. 우리는 RAD51이 endonuclease-induced DSB의 resection을 제한하지 않았지만, in vitro에서 상보적 single strand DNA(ssDNA)의 자발적 및 RAD52-induced annealing을 방지한다는 것을 보여주었습니다. 따라서 RAD51은 GC의 promotion과 무관하게 ssDNA binding을 통해 비보존적 DSB repair로부터 genome integrity를 보호하여 DSB repair 경로의 선택을 control합니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. 연구를 진행했던 소속기
- Nucleic Acids Res.
- 2022.02.22
Mg2+-dependent conformational rearrangements of CRISPR-Cas12a R-loop complex are mandatory for complete double-stranded DNA cleavage
- Proc. Natl. Acad. Sci. USA December 7, 2021, 118 (49) : e2113747118 | https://doi.org/10.1073/pnas.2113747118
- 2021.12
- 생명과학
Quantitative assessment of engineered Cas9 variants for target specificity enhancement by single-molecule reaction pathway analysis
- Nucleic Acids Res. Published: 23 September 2021 | https://doi.org/10.1093/nar/gkab858
- 2021.09
- 생명과학