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1Molecular subtype

'Molecular subtype' 에 대한 통합검색결과 83건입니다.

한빛사83건

- 임도현(Kyoto University)
Structural insights into the agonists binding and receptor selectivity of human histamine H4 receptor
- Nat. Commun. Oct 20 2023, 14 (1) 6538 | https://doi.org/10.1038/s41467-023-42260-z
- 2023.10
- 생명과학
- 남도현(성균관대학교 의과대학, 삼성의료원)
Identifying predictors of glioma evolution from longitudinal sequencing.
- Sci. Transl. Med. Oct 04 2023, 15 (716) | https://doi.org/10.1126/scitranslmed.adh4181
- 2023.10
- 의약학
Combined inhibition of Bcl-2 family members and YAP induces synthetic lethality in metastatic gastric cancer with RASA1 and NF2 deficiency
- Mol. Cancer Published: 20 September 2023 | https://doi.org/10.1186/s12943-023-01857-0
- 2023.09
- 생명과학
- 천종호(서울대학교 보라매병원)
- 이한별(서울대학교 의과대학, 서울대학교병원)
Locoregional Recurrence Patterns in Patients With Different Molecular Subtypes of Breast Cancer.
- JAMA Surg. Aug 01 2023, 158 (8) | https://doi.org/10.1001/jamasurg.2023.2150
- 2023.08
- 의약학
- 김재승(University of Toronto)
Transcriptomic classes of BCR-ABL1 lymphoblastic leukemia
- Nat. Genet. 2023 Jul;55(7):1186-1197 | https://doi.org/10.1038/s41588-023-01429-4
- 2023.07
- 생명과학
김진성

서울대학교 의과대학, 현 University of California, San Francisco

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 2021년 노벨생리의학상을 통해 대중에 잘 소개되었던 것처럼, Transient Receptor Potential (TRP) 채널은 전압 뿐만 아니라 온도, 물리적 자극, 산화환원전위 등에 의해 활성이 조절된다고 알려진 흥미로운 이온채널입니다. TRP superfamily에는 TRPA, TRPC, TRPM, TRPML, TRPV, TRPP의 6가지 subfamily가 있으며, 각 subfamily는 1~8개의 subtype을 포함하고 있습니다. 모두 합하여 스무개 남짓의 TRP gene product가 인체에 발현되는 것으로 알려져 있는데요, 각 TRP channel이 담당하는 기능에 대해서는 잘 알려진 것도 있고, 아직까지 잘 모르는 바도 많습니다. 예컨대 TRPV1과 TRPM8은 피부 혹은 감각신경절에서 온도를 감지하거나 통증 신호를 매개하는데 중요한 역할을 담당하는 것으로 잘 알려져 있지만, TRPV2, 3, 4, TRPM4, 5 등이 정확히 어떤 기능을 담당하는지는 여전히 명료하지 않습니다. TRP 유전자는 초파리의 광각수용기전을 연구하면서 처음 발견되었습니다. 초파리에서 최초로 발견된 이 유전자는 초파리의 학명을 따서 dtrp 유전자로 불리우게 되었는데요. 이후 포유동물에서는 유사한 유전자가 없을지 탐색하는 작업이 이루어졌고, 1991년 dtrp 와 염기서열 유사도가 높은 유전자를 인체내에서 발굴하게 됩니다. 당시에는 Htrp-1, hTRP1 등으로 불리었는데 추후 TRPC1으로 명명법이 정리되게 됩니다. 아마도 인체 내에서 발견된 여러 TRP 유전자 중 dtrp 에 가장 흡사한, 가장 정형적인 (canonical) subfamily라고 여겨져 이런 명명이 된 것으로 생각됩니다. TRPM, V, A, P 등은 모두 TRPC 이후에 후속적으로 발굴된 subfamily라고 할 수 있겠습니다. 인체에서 가장 처음 발굴된 TRP subfamily 였기에 TRPC는 과연 어떤 생리학적 기능을 담당할지 궁금한 점이 많았습니다. 가장 많은 연구가 이루어진 기관은 소화기 위장관 (gastrointestinal tract)이었는데요, 일반적으로 부교감신경 활성 이후 보여지는 소화기 위장관의 수축/운동성 항진이 TRPC4, 6 채널을 통해 상당부분 매개된다는 근거가 약 30여년에 걸쳐 축적되었습니다. 연접후 부교감신경이 표적 기관에 유리하는 신경전달물질은 아세틸콜린이므로, 위장관 평활근의 세포막에 있는 아세틸콜린수용체가 활성화 된 이후에 어떤 기작인가에 의해서 평활근의 흥분 및/혹은...
- Nat. Commun.
2023.05.15
2023.05.15
- 배민선(인하대학교병원)
Impact of Molecular Subtype Definitions on AI Classification of Breast Cancer at MRI
- Radiology 2023 Apr;307(1):e223041 | https://doi.org/10.1148/radiol.223041
- 2023.04
- 의약학
A TEAD2-driven endothelial-like program shapes basal-like differentiation and metastasis of pancreatic cancer
- Gastroenterology Published: March 10, 2023 | https://doi.org/10.1053/j.gastro.2023.02.049
- 2023.03
- 생명과학
Refining classification of cholangiocarcinoma subtypes via proteogenomic integration reveals new therapeutic prospects
- Gastroenterology 2023 Mar 8;S0016-5085(23)00237-8 | https://doi.org/10.1053/j.gastro.2023.02.045
- 2023.03
- 의약학
유혜빈

연세대학교

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 췌장암은 암 중에서도 진단 이후 평균 생존 기간이 1년 정도밖에 되지 않는 치명적인 질병입니다. 현재 췌장암 치료는 수술에 의한 물리적 절제와 화학 요법에 의한 치료에 의존하고 있는데요. 이러한 치료법은 치료제에 대한 저항성과 암의 재발이 빠르게 증가하는 등 제한적인 효과를 나타내기 때문에, 새로운 접근의 치료법 개발이 필요합니다. 또한, 췌장암 환자는 유전자 발현 양상에 따라서 classical과 basal-like subtype으로 나뉘는데, 그 중에서도 basal-like subtype의 환자들은 치료제 저항성을 더 많이 나타내고 암 전이가 높아서 환자의 예후가 좋지 않습니다. 환자 맞춤형 치료가 대두되고 있는 최근 동향에 따르면, 췌장암에서 subtype 연구는 암치료에서 매우 중요한 부분입니다. 다만 실제 인간 세포주 및 환자들의 경우에는 매우 다양한 유전자 발현 양상을 띄기 때문에 subtype을 명확히 구분하는 것은 현실적으로 어려움이 있고, 이러한 이유로 아직까지 subtype에 대한 깊은 연구가 부족한 실정입니다. 저희는 이러한 문제를 해결하기 위해 다양한 세포주들을 이용하여 균일하게 basal-like subtype으로 변환시킨 뒤 다양한 실험들을 진행할 수 있도록 ‘세포주 변환 모델 (molecular subtype conversion model)‘을 확립하였습니다. 변환된 암세포들은 비부착성 성장, 이동 능력 등에서 더 공격적인 특성을 띄었고 마우스 실험에서도 암전이가 더 잘 일어나는 것을 확인했습니다. 또한, 차세대 염기서열 분석 (NGS, Next Generation Sequencing)을 통해 basal-like subtype으로의 변환이 크로마틴 및 유전자 발현 변화에 의한 것이며, TEAD2가 특정 인핸서 지역을 활성화시킴으로써 basal-like subtype을 유지한다는 것을 증명하였습니다. 더 나아가서, TEAD2와 함께 CD109-JAK-STAT 경로를 활용하여 basal-like 암세포들이 생존하고 전이하는 데에 기여한다는 것을 밝혔습니다. 위 연구를 통해 basal-like subtype을 유지하는 TEAD2-CD109-JAK-STAT 경로와 기전을 새롭게 밝혔고, 이는 실제 췌장암 환자에서 subtype을 진단할 수 있는 바이오마커 및 subtype에 따른 환자 맞춤형 치료에 기여할 것으로 기대됩니다. 그림 1. Subtype conversion model에 의해 reprogramming된 Basal-like 암세포의 특성
- Gastroenterology
2023.03.20
2023.03.20
Patient-derived cell-based pharmacogenomic assessment to unveil underlying resistance mechanisms and novel therapeutics for advanced lung cancer
- J. Exp. Clin. Cancer Res. 2023 Jan 30;42(1):37 | https://doi.org/10.1186/s13046-023-02606-3
- 2023.01
- 생명과학
Integrative analysis of multiple genomic data from intrahepatic cholangiocarcinoma organoids enables tumor subtyping
- Nat. Commun. 2023 Jan 16;14(1):237 | https://doi.org/10.1038/s41467-023-35896-4
- 2023.01
- 의약학
이찬섭

서울대학교병원

대신 이와 유사 기능을 가지는 MCL1 혹은 BFL1 단백질 (BCL2 family 단백질들)이 활성화되어 베네토클락스의 치료 효과가 감소하기 때문에, 이를 극복하기 위한 연구가 활발히 이루어지고 있습니다. 본 연구에서는 BCL2 family의 조절에 관여하는 유전자들을 선별하는 알고리즘을 개발하였고 해당 유전자들의 발현량 정보를 이용해 BCL2 family signatures (BFSigs)라는 새로운 biomarker를 계산하였습니다. BFSig를 활용하면 베네토클락스의 치료 효과를 높은 정확도로 예측할 수 있음을 증명하였습니다. 또한, BFSig를 기반으로 AML 환자를 3가지 아형 (subtype)으로 분류할 수 있고, 아형별로 환자마다 BCL2, MCL1 그리고 BFL1 중 어떤 단백질을 치료제의 표적으로 할지 판별할 수 있음을 제시합니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. 본 연구는 서울대학교 병원 혈액학 연구실 ( https://snuheme.org/main )에서 윤성수 교수님, 고영일 교수님과 정밀의료센터 윤홍석 교수님의 지도하에, 이성영 교수님과 함께 수행되었습니다. 본 연구실에서는 기본적으로 혈액암의 clonal evolution 및 약물 저항성과 연관된 molecular carcinogenesis의 규명하기 위한 연구를 수행합니다. 그리고, 다양한 혈액 질환 환자의 유전체 데이터를 생산하고 후보 유전자 및 변이를 발굴하며, functional validation 수행을 통한 정밀의학 실현을 목적으로 합니다. 폭넓은 공공 데이터뿐 아니라 다양한 환자 시료로부터 얻은 데이터까지 최고 수준의 large-scale 연구 수행의 기회가 있으며, 임상 의사분들의 지도하에 실제 임상적 의미가 큰 연구를 수행할 수 있습니다. 또한, 본 연구실은 dry와 wet lab으로 구성되어 있어, dry-wet 공동 연구의 귀중한 경험을 할 수 있습니다. 3. 연구 활동 하시면서 평소 느끼신 점 또는 자부심, 보람 임상에서 활동하시는 윤성수 교수님과 고영일 교수님의 지도 덕분에, 학문적 의미가 있는 연구뿐 아니라 임상적 니즈(needs)가 있는 연구를 수행할 기회가 많았습니다. 그러다 보니 제 연구 결과가 미래에는 실제 환자의 진단 혹은 치료에 활용될 수 있다는 점이 연구 활동 중에 항상 마음 깊이 새겨져 있었습니다. 덕분에 맡은 연구를 더욱 책임감 있게 수행할 수 있었고 결과에 대한 자부심 또한 느낄 수 있었습니다. 비록 누구에게는 힘들 수 있는...
- Genome Med.
2022.11.14
2022.11.14
CD39 + tissue-resident memory CD8 + T cells with a clonal overlap across compartments mediate antitumor immunity in breast cancer
- Sci. Immunol. 26 Aug 2022 Vol 7, Issue 74 | https://doi.org/10.1126/sciimmunol.abn8390
- 2022.08
- 의약학
Clinical, Pathologic, and Molecular Prognostic Factors in Patients with Early-Stage EGFR-Mutant NSCLC
- Clin. Cancer Res. Accepted: July 13, Volume 28, Issue 19 1 October 2022 | https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-22-0879
- 2022.07
- 의약학
- 박주동(차의과학대학교)
  Interview
- 박경순(차의과학대학교)
ELK3 modulates the antitumor efficacy of natural killer cells against triple negative breast cancer by regulating mitochondrial dynamics
- J. Immunother. Cancer Online issue publication July 20, 2022 | http://dx.doi.org/10.1136/jitc-2022-004825
- 2022.07
- 생명과학
- 한장희(서울대학교)
  Interview
- 김현석(연세대학교)
Snail acetylation by autophagy-derived acetyl-coenzyme A promotes invasion and metastasis of KRAS-LKB1 co-mutated lung cancer cells
- Cancer Commun. First published: 15 July 2022 | https://doi.org/10.1002/cac2.12332
- 2022.07
- 의약학
Synaptotagmin 11 scaffolds MKK7-JNK signaling process to promote stem-like molecular subtype gastric cancer oncogenesis
- J. Exp. Clin. Cancer Res. Published 29 June 2022 | https://doi.org/10.1186/s13046-022-02420-3
- 2022.06
- 생명과학
- 성지용(연세대학교 의과대학, 기초과학연구원)
  Interview
- 정재호(연세대학교 의과대학)
Prognosis-related gene signature is enriched in cancer-associated fibroblasts in the stem-like subtype of gastric cancer
- Clin. Transl. Med. First published: 26 June 2022 | https://doi.org/10.1002/ctm2.930
- 2022.06
- 의약학
전영식

연세대학교 의과대학, 현 한국과학기술연구원

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 간의 원발성 암종은 크게 간세포암 (hepatocellular carcinoma, HCC) 과 간내 담관암 (intrahepatic cholangiocarcinoma, iCCA)으로 나눌 수 있습니다. HCC 중 일부 암에서는 iCCA와 유사한 분자유전학적 특징을 보이는 아형이 보고되었으며, 혼합 간세포담관암 (combined hepatocellular-cholangiocarcinoma)에서는 HCC와 iCCA의 분화를 동시에 보입니다. 이러한 특징은 간의 원발성 암종인 HCC와 iCCA 사이의 중간 특성을 보이는 아형 (subtype)이 존재할 가능성을 보이나, 정확한 분자병리학적 소견은 아직까지 명확하게 밝혀지지 않았습니다. 저희 연구팀은 2000년부터 2018년까지 세브란스병원에 수술받은 간세포암, 간내 담관암 총 137명의 조직을 선별 및 RNA-sequencing 진행 후 전사체 (transcriptome)를 활용한 consensus clustering을 통해 총 4개의 subtype (예: LC1-LC4)을 분류하고 유전적-병리학적 특징들을 조사하였습니다. 결과적으로, 간내 담관암과 유사한 유전자 발현 패턴을 보이는 LC2 그룹은 LC1에 비해 불량한 예후, 높은 TP53 유전자변이, HNF4-SLCO1B1 유전자 발현감소에 의한 담즙산 uptake가 감소되는 특징을 보여주며, 영상의학적으로 MRI 검사에서 rim-APHE (rim arterial-phase hyperenhancement) 패턴 나타냈습니다. 간내 담관암은 간세포암과 비슷한 특징을 보이는 LC3와 전형적인 간내 담관암 특징을 보이는 LC4로 분류하였습니다. LC3는 병리학적으로 소담관암 (small duct, SD)이 대부분이 였으며, 높은 대사/면역관련 유전자의 발현과 IDH1/2 변이를 보였습니다. 이와 반대로, LC4 그룹에는 소담관암과 대담관암 (large duct, LD)이 둘 다 포함하며, LC4-SD는 빈번한 FGFR2 유전자의 fusion 특징, LC4-LD은 cell cycle 관련 유전자의 발현 및 KRAS 유전자 그룹의 변이 차이를 보여줬습니다. 이런 결과를 통해 진단 및 치료에 응용이 가능하도록 간세포암과 간내 담관암이 보이는 분자적-병리학적 스펙트럼에 대한 이해를 높였으며 같은 간세포암, 간내 담관암이라도 좀 더 공격적인 특징을 보이는 아형이 존재하며 이는 영상의학적으로 구분이 가능하다는 점을 제시했다고 생각합니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. 제가 연구를 진행하였던 연세대학교 의과대학...
- Hepatology
2022.04.04
2022.04.04