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1Metabolic engineering

'Metabolic engineering' 에 대한 통합검색결과 266건입니다.

한빛사266건

- 이상민(한국화학연구원)
- 백승호(한국화학연구원)
Engineering of Yarrowia lipolytica as a platform strain for producing adipic acid from renewable resource
- Bioresour. Technol. Nov 04 2023, S0960-8524(23)01348-2 | https://doi.org/10.1016/j.biortech.2023.129920
- 2023.11
- 생명과학
Genome-wide identification of overexpression and downregulation gene targets based on the sum of covariances of the outgoing reaction fluxes
- Cell Syst. Available online 6 November 2023 | https://doi.org/10.1016/j.cels.2023.10.005
- 2023.11
- 생명과학
Biosynthesis of l-histidine from marine biomass-derived galactans in metabolically engineered Corynebacterium glutamicum
- Bioresour. Technol. Nov 02 2023, S0960-8524(23)01391-3 | https://doi.org/10.1016/j.biortech.2023.129963
- 2023.11
- 생명과학
- 고숭천(성균관대학교)
  Interview
- 우한민(성균관대학교)
CRISPR-dCas13a system for programmable small RNAs and polycistronic mRNA repression in bacteria
- Nucleic Acids Res. Nov 28 2023, gkad1130 | https://doi.org/10.1093/nar/gkad1130
- 2023.11
- 생명과학
Transcriptome profiles of Streptomyces clavuligerus strains producing different titers of clavulanic acid
- Sci. Data Nov 16 2023, 10 (1) 804 | https://doi.org/10.1038/s41597-023-02727-6
- 2023.11
- 생명과학
- Tayyab Islam(UNIST)
- 박성훈(UNIST)
Metabolic engineering of Escherichia coli for enhanced production of 1,3-butanediol from glucose.
- Bioresour. Technol. Available online 1 October 2023 | https://doi.org/10.1016/j.biortech.2023.129814
- 2023.10
Biosensor-guided discovery and engineering of metabolic enzymes
- Biotechnol. Adv. Available online 9 September 2023, 108251 | https://doi.org/10.1016/j.biotechadv.2023.108251
- 2023.09
- 생명과학
- 이상엽(KAIST)
Protein engineering and iterative multimodule optimization for vitamin B6 production in Escherichia coli.
- Nat. Commun. Aug 31 2023, 14 (1) 5304 | https://doi.org/10.1038/s41467-023-40928-0
- 2023.08
- 생명과학
- 김미진(Memorial Sloan Kettering Cancer Center)
Micro-engineering and nano-engineering approaches to investigate tumour ecosystems
- Nat. Rev. Cancer 2023 Jun 23 | https://doi.org/10.1038/s41568-023-00593-3
- 2023.06
- 바이오·의료융합
조재성

KAIST

표적 유전자의 mRNA 상보적으로 결합함으로써 리보솜의 번역 과정을 막아 표적 유전자의 발현을 효과적으로 억제 하는 도구입니다. 그러나 대장균과 같은 몇몇 그람 음성균 외에 그람 양성균포함한 다양한 박테리아 균주들에게 적용이 어려웠습니다. 따라서 새로운 범용 플랫폼을 개발하고자 미생물 데이터베이스를 검토하고 그중 가장 높은 유전자 억제능을 보여준 Bacillus subtilis 박테리아 유래 sRNA 시스템을 최종 선정하고, 다양한 그람 음성균 및 그람 양성균 박테리아에서 성공적으로 작동함을 증명하며 이 시스템의 범용성을 검증하였습니다. 개발한 시스템을 이용해 여러 병원 균과 산업용 박테리아에 적용하여 도구의 활용성을 입증하였습니다. 이렇게 대장균을 포함한 몇몇 모델 박테리아 외에 제어하기 어려웠던 다양한 균주들을 제어 할수 있게 됨으로써 앞으로 대사공학과 바이오메디컬 공학 분야에 발전에 큰 도움이 될 것으로 전망됩니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. 이번 연구는 KAIST 생명화학공학과의 이상엽 교수님께서 이끌고 계시는 대사및분자생물공학 연구실 (Metabolic and Biomolecular Engineering National Research Laboratory, MBEL) 에서 이루어 졌습니다. 본 연구실은 포닥, 석박사 과정 학생, 연구원 합쳐서 약 40명 정도가 함께하는 큰 규모의 랩이고, 많은 연구비와 연구 인프라가 잘 셋업 되어있는 연구실입니다. 시스템대사공학이라는 분야를 개척하고 선도하는 연구실이고, 특히 미생물중 박테리아를 시스템대사공학을 통해 미생물 세포 공장을 만드는 연구실입니다. 큰 틀에서는 현재 화학적으로 생산되는 모든 화합물들을 친환경적인 박테리아 발효기법으로 재생가능한 원료로 부터 만들겠다는 비전으로 연구를 진행하고 있습니다. 3. 연구 활동 하시면서 평소 느끼신 점 또는 자부심, 보람 이번 연구를 통해서 다양한 박테리아를 다룰 수 있는 기회가 생겨서 많은 보람을 느끼게 되었던 것 같습니다. 보통은 한 연구실에서 대장균, 바실러스, 코리네박테리움 등과 같은 모델 균주를 다루거나, 새로 동정한 박테리아 한 균종을 집중해서 연구개발을 하는 것이 일반적입니다. 이번 연구를 통해서 여러 박테리아를 다루고, 또 각각 박테리아에서 공통적인 분자생물학적 도구를 적용하는데 있어서 큰 보람을 느꼈습니다. 석사1년차때
- Nat. Commun.
2023.05.01
2023.05.01
- 정병렬(한양대학교)
- 진언선(한양대학교)
Genome engineering via gene editing technologies in microalgae
- Bioresour. Technol. 2023 Apr;373:128701 | https://doi.org/10.1016/j.biortech.2023.128701
- 2023.04
- Charles Jo(Boston University)
Unlocking the magic in mycelium: Using synthetic biology to optimize filamentous fungi for biomanufacturing and sustainability
- Mater. Today Bio Volume 19, April 2023, 100560 | https://doi.org/10.1016/j.mtbio.2023.100560
- 2023.04
Targeted and high-throughput gene knockdown in diverse bacteria using synthetic sRNAs
- Nat. Commun. Published: 24 April 2023 | https://doi.org/10.1038/s41467-023-38119-y
- 2023.04
- 생명과학
Metabolic engineering for sustainability and health
- Trends Biotechnol. 2023 Mar;41(3):425-451 | https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2022.12.014
- 2023.03
- 생명과학
CRISPRi-mediated tunable control of gene expression level with engineered single-guide RNA in Escherichia coli
- Nucleic Acids Res. 2023 Mar 31;gkad234 | https://doi.org/10.1093/nar/gkad234
- 2023.03
- 생명과학
장홍제

UC San Diego

인간 망막 조직 및 동물 장기까지 다양한 유형의 샘플에 적용했습니다. 특히, 단일 지질 방울과 세포막을 시각적으로 분리했습니다. HEK 세포 실험에서는 단백질, 지질 및 미토콘드리아 막 채널의 공존 이미지를 측정했습니다. SRS 현미경을 사용하여 단백질 및 지질 신호를 감지하고 형광 단백질로 미토콘드리아 막을 표시하여 일반적으로 공존하는 막 구성요소와 분리된 막 구성요소를 구분했습니다. 인간 망막 조직에서는 망막 표면의 막세포를 관찰했습니다. 공간 해상도가 개선되어 디콘볼루션 후 세포의 막 구성요소를 시각화할 수 있었습니다. 과다한 포도당 조건에서 Drosophila 뇌 이미지에서는 식이 조절 지질 대사 변화를 측정했습니다. 지질 대사 활동이 증가했습니다. 정확한 크기 정보를 기반으로 두 가지 식이 조건에서 지질 방울의 에너지 변동도 측정했습니다. 해상도 개선으로 인해 지질 방울 내 신규 합성 지질의 불균일한 분포가 측정되었습니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. UC San Diego Bioengineering department에서는 Bioinformatics와 함께 tissue engineering과 Biomechanics, 그리고 그 밖의 다양한 기술을 융합한 폭넓은 연구를 진행하고 있습니다. 현재 저는 Lingyan Shi 교수님 연구실에서 박사후 연구원으로 일하고 있으며, 이 곳에서 Raman scattering을 이용한 hyperspectral imaging을 효율적으로 응용할 방법을 연구중이며, spectrum에 대한 이론적인 분석을 바탕으로 Raman 현미경의 정확도와 활용 범위를 넓히는 작업을 진행하고 있습니다. 3. 연구 활동 하시면서 평소 느끼신 점 또는 자부심, 보람 현재 제가 속한 Bioengineering department의 연구 분야를 소개할 때 사람들이 항상 많이 사용하는 단어가 interdisciplinary입니다. 저는 화학을 공부하기 시작해서 물리화학과 현미경을 공부하고, 박사과정에서는 물리와 이미지 분석 알고리즘을 공부했습니다. 그리고 지금은 그 모든 내용을 통합할 수 있는 분과에서 연구를 진행하고 있습니다. 앞으로도 필요에 따라서 연구 배경을 넓혀갈 것이며, 그런 의지를 가지고 있다는 점에서 항상 자부심을 느낍니다. 4. 이 분야로 진학하려는 후배들 또는 유학준비생들에게 도움이 되는 말씀을 해 주신다면 A-PoD의 이름을 정할 때, 처음..
- Nat. Methods
2023.03.29
2023.03.29
Machine learning-guided prediction of potential engineering targets for microbial production of lycopene
- Bioresour. Technol. Volume 369, February 2023 | https://doi.org/10.1016/j.biortech.2022.128455
- 2023.02
- 생명과학
- 박상우(Cornell University)
Recombinant mucin biotechnology and engineering
- Adv. Drug Deliv. Rev. Volume 193, February 2023, 114618 | https://doi.org/10.1016/j.addr.2022.114618
- 2023.02
- 생명과학
Programmable synthetic biology tools for developing microbial cell factories
- Curr. Opin. Biotechnol. Volume 79, Feb 2023, 102874 | https://doi.org/10.1016/j.copbio.2022.102874
- 2023.02
- 생명과학
강창근

서울시립대학교

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 대사공학 (Metabolic engineering) 분야에서는 고부가가치 화학물질의 친환경 바이오 기반 생산을 위해 미생물의 복잡한 대사 회로를 재구성하여 미생물 세포를 하나의 생산 공장으로 개조하는 연구를 합니다. 이 분야는 최근 합성생물학 (Synthetic biology)과 유전체 편집 기술의 발전에 힘입어 빠르게 성장하고 있지만, 수 천개에 달하는 유전자들과 그것들의 복잡한 네트워크를 어떻게 이해하고 유전자 조작의 효과를 정확히 예측 할 것인가에 대한 문제는 이 분야의 고질적인 문제로 여겨져 왔습니다. 전통적인 방식으로는 특정 유전자를 조작하여 돌연변이 미생물 균주를 제작하여 그 효과를 확인하고, 또 그 다음 돌연변이를 제작하여 효과를 확인하는 식의 시행착오를 반복하는 것으로 매우 많은 시간과 노력이 들어가는 이른바 노가다가 필요한 작업이었습니다. 이번 연구에서는 미생물로 라이코펜을 생산하는 대사 회로를 최적화 하는 데 소요되는 시간과 노력을 최대한 단축하기 위해 머신러닝 기반 모델을 활용하여 어떤 유전자를 조작하는 것이 최대의 효과를 낼 수 있을지를 예측하고자 하였습니다. 그 과정에서 환경 분야 모델링 연구를 하고 계신 차윤경 교수님 연구실과 협업을 하게 되었고, 서로가 서로의 분야를 전혀 모르는 상태에서 연구를 시작하게 되었습니다. 서로의 분야를 전혀 모르는 상태에서 매주 공동 세미나를 통해 스터디하면서 배워가면서 조금씩 이해도가 높아지고 아이디어도 나오기 시작했습니다. 그 과정에서 유전자 발현량에 따른 라이코펜 생산성 데이터를 활용하여 다층 퍼셉트론(Multilayer perceptron) 모델과 유전 알고리즘(Genetic algorithm)을 학습시키면 효과적인 예측을 할 수 있다는 사실을 알아낼 수 있었고, 모델로부터 예측된 최적의 설계로 균주 개량을 실시하여 라이코펜 생산성을 기존 연구에서는 달성 할 수 없었던 수준으로 대폭 향상시킬 수 있었습니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. 본 연구는 서울시립대학교 환경공학부 친환경미생물공학 연구실에서 지도교수님이신 최용준 교수님 지도 하에 수행하였으며, 물환경관리연구실 차윤경 교수님과의 협업으로 완성될 수 있었습니다. 저희 친환경미생물공학 연구실은 대사공학연구뿐만 아니라...
- Bioresour. Technol.
2023.02.24
2023.02.24