한빛사416건

• • 오정주(고려대학교)

  • 고영진(고려대학교)

  • 이창민(연세대학교)

  Automated quantification of lipid contents of Lipomyces starkeyi using deep-learning based image segmentation

  • Bioresour. Technol. Nov 16 2023, S0960-8524(23)01443-8 | https://doi.org/10.1016/j.biortech.2023.130015

  • 2023.11
  • 생명과학

• • 박수연(성균관대학교 의과대학)

    Interview

  • 고관수(성균관대학교 의과대학)

  Conversion to colistin susceptibility by tigecycline exposure in colistin-resistant Klebsiella pneumoniae and its implications to combination therapy

  • Int. J. Antimicrob. Agents Oct 24 2023, S0924-8579(23)00291-1 | https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2023.107017

  • 2023.10
  • 의약학

• • Saroj Raj Kafle(충북대학교)

  • 김범수(충북대학교)

  A holistic approach for process intensification of nicotinamide mononucleotide production via high cell density cultivation under exponential feeding

  • Bioresour. Technol. Available online 21 October 2023, 129911 | https://doi.org/10.1016/j.biortech.2023.129911

  • 2023.10
  • 생명과학

• • 이우호(서강대학교)

  • 이갑열(서강대학교)

  Transcription Factor Id1 Plays an Essential Role in Th9 Cell Differentiation by Inhibiting Tcf3 and Tcf4

  • Adv. Sci. Oct 22 2023, | https://doi.org/10.1002/advs.202305527

  • 2023.10
  • 생명과학

• • 전수지(University of California, Riverside)

  Targeted Delivery of Sucrose-Coated Nanocarriers with Chemical Cargoes to the Plant Vasculature Enhances Long-Distance Translocation

  • Small Oct 15 2023, | https://doi.org/10.1002/smll.202304588

  • 2023.10

• • Nhuan T Do(한국표준과학연구원)

  • 이선영(한국표준과학연구원)

  • 이윤서(한국표준과학연구원)

  • 손진경(한국표준과학연구원)

  • 김세화(한국표준과학연구원)

  Time-sequential fibroblast-to-myofibroblast transition in elastin-variable 3D hydrogel environments by collagen networks

  • Biomater. Res. Oct 17 2023, 27 (1) | https://doi.org/10.1186/s40824-023-00439-x

  • 2023.10
  • 바이오·의료융합

• • 차지현(충남대학교)

  • 홍성진(충남대학교)

  • 김종성(서울대학교)

  Identification of Mid-Polar and Polar AhR Agonists in Cetaceans from Korean Coastal Waters: Application of Effect-Directed Analysis with Full-Scan Scr

  • Environ. Sci. Technol. Oct 03 2023, | https://doi.org/10.1021/acs.est.3c04311

  • 2023.10
  • 생명과학

• • 이종은(NIH)

  A metabolomic investigation of serum perfluorooctane sulfonate and perfluorooctanoate.

  • Environ. Int. Volume 180, October 2023, 108198 | https://doi.org/10.1016/j.envint.2023.108198

  • 2023.10
• 

  박시훈

  고려대학교, 현 Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research

  구조 예측으로 기존 X-선 결정학으로 해결할 수 없었던 어려운 단백질 복합체 구조를 예측하고 결정화가 어려운 막단백질의 구조를 고해상도로 규명할 수 있게 되었습니다. 이외에도 X선 자유 에너지 레이저 (XFEL)의 개발로 분자 단위의 효소 활성을 펨토초 시간 단위로 관찰할 수 있게 되었습니다. 이번 연구에서는 단백질 X-선 결정학 (X-ray Crystallography), 극저온 전자현미경을 이용한 토모그래피 (CryoET)와 서브 토모그램 평균화 (Subtomogram averaging, 그림3), 소각 엑스선 산란 (SAXS), 가교결합 질량분석 (Cross-linking Mass spectrometry), 알파폴드 구조 예측 등의 다양한 구조생물학적 기법이 사용되었습니다. 이외에도 생화학, 분자생물학, 생물정보학, 세포생물학 등의 다른 분야의 기법들 역시 사용되었으며 이러한 협업을 통해 생명 현상을 이해하려는 연구가 현재 활발히 진행되고 있습니다. 그림3. Dynamo 프로그램을 이용한 리포솜 상에 결합한 TRIM72의 서브 토모그램의 추출. - 표적 단백질 분해 기법과 유비퀴틴 연결효소 유비퀴틴 연결효소에 대한 연구는 표적 단백질 분해 기법 (Targeted proteolysis)의 발전과 더불어 현재 전성기를 달리고 있습니다. 2000년대 초반, 유비퀴틴 연결효소와 분해할 표적 단백질이 서로 결합할 수 있도록 도와주는 화합물 (PROTAC)을 사용하면 원하는 단백질을 제거할 수 있다는 개념이 처음으로 제시되었습니다 (Sakamoto et al., PNAS 2001, 그림4). 이 방법의 가장 큰 장점은 기존의 활성 부위 억제제로 저해할 수 없는 타겟 단백질을 원천적으로 제거하여 효과적으로 타겟의 활성을 차단할 수 있다는 것입니다. 현재 많은 제약회사들의 PROTAC 제제들이 임상 시험 중에 있으며 앞으로도 더욱 활발히 연구될 것으로 기대됩니다. 그림 4. PROTAC 기반의 타겟 단백질 제거 약물의 작동 메커니즘.( https://blogs.bcm.edu/2020/09/03/from-the-labs-novel-protac-has-a-two-front-improvement/ ) 이와 더불어 근래에 등장한 분자접착제 (Molecular glue)의 개념은 이미 알려진 유비퀴틴 연결효소와 기질 단백질 간의 결합을 강화시키는 방향으로 연구되고 있습니다. 이 방법은 세포 내 단백질 결합을 그대로 이용하기 때문에 부작용이 적을 것으로 예상되며, 분자접착제의 크기와 구조가 Rule of five (RO5)를 만족하기 때문에 생체 내 약물...

  • Nat. Struct. Mol. Biol.

  2023.10.16

  2023.10.16

• • 변은진(성균관대학교)

  • 강혜민(한국해양과학기술원, UST)

  Effects of microplastics and phenanthrene on gut microbiome and metabolome alterations in the marine medaka Oryzias melastigma.

  • J. Hazard. Mater. Sep 23 2023, 461 S0304-3894(23)01903-9 | https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2023.132620

  • 2023.09
  • 생명과학

• • 이준엽(The University of Sydney)

  The major TMEM106B dementia risk allele affects TMEM106B protein levels, fibril formation, and myelin lipid homeostasis in the ageing human hippocampu

  • Mol. Neurodegener. Sep 19 2023, 18 (1) 63 | https://doi.org/10.1186/s13024-023-00650-3

  • 2023.09
  • 생명과학

• • Godagama Gamaarachchige Dinesh Suminda(제주대학교)

    Interview

  • 이동선(제주대학교)

  • 손영옥(제주대학교)

  In vitro and in vivo investigations on arsenic-induced cartilage degeneration in osteoarthritis.

  • J. Hazard. Mater. Sep 21 2023, 461 S0304-3894(23)01853-8 | https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2023.132570

  • 2023.09
  • 생명과학

• • 김정희(Johns Hopkins University)

  RaMALDI: Enabling simultaneous Raman and MALDI imaging of the same tissue section.

  • Biosens. Bioelectron. Available online 12 August 2023 | https://doi.org/10.1016/j.bios.2023.115597

  • 2023.08

• • 김민(University of Copenhagen)

  Maternal vitamin D-related metabolome and offspring risk of asthma outcomes

  • J. Allergy Clin. Immunol. Available online 8 August 2023 | https://doi.org/10.1016/j.jaci.2023.06.030

  • 2023.08

• • 고영미(Emory University)

  Exposome epidemiology for suspect environmental chemical exposures during pregnancy linked to subsequent breast cancer diagnosis

  • Environ. Int. Vol 178, Aug 2023, 108112 | https://doi.org/10.1016/j.envint.2023.108112

  • 2023.08

• • 박가은(서울대학교 의과대학)

    Interview

  • 장우영(경희대학교)

  • 김서연(고려대학교)

    Interview

  • 신찬영(건국대학교 의과대학)

  • 안준용(고려대학교)

  • 김민식(대구경북과학기술원)

  • 이용석(서울대학교 의과대학)

  Dysregulation of the Wnt/β-catenin signaling pathway via Rnf146 upregulation in a VPA-induced mouse model of autism spectrum disorder

  • Exp. Mol. Med. 01 August 2023 | https://doi.org/10.1038/s12276-023-01065-2

  • 2023.08
  • 생명과학

• • 장유진(인제대학교 의과대학, 상계백병원)

    Interview

  • 허진원(울산대학교 의과대학 서울아산병원)

  A targeted metabolomics approach for sepsis-induced ARDS and its subphenotypes

  • Crit. Care 2023 Jul 5;27(1):263 | https://doi.org/10.1186/s13054-023-04552-0

  • 2023.07
  • 의약학

• • 정은아(숙명여자대학교)

    Interview

  • 강교빈(숙명여자대학교)

  Qualitative metabolomics-based characterization of a phenolic UDP-xylosyltransferase with a broad substrate spectrum from Lentinus brumalis

  • Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2023 Jul 11;120(28):e2301007120 | https://doi.org/10.1073/pnas.2301007120

  • 2023.07
  • 의약학
• 

  정은아

  숙명여자대학교

  1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 진균은 식물의 대표적인 분해자의 역할을 하며, 식물은 이러한 진균을 비롯해 여러 주변 환경으로부터 자신을 지키기 위해서 항진균 효능을 가진 화합물을 생산하고 체내에 저장하고, 이러한 화합물은 식물이 죽은 뒤에도 여전히 남아있게 됩니다. 목재부후균은 이와 같은 죽은 식물을 분해하여 양분을 얻는 대표적인 부후균으로, 식물이 가지고 있는 다양한 화학 구조의 화합물을 대사할 수 있는 능력이 필요하게 됩니다. 이를 토대로 다양한 기질에 작용할 수 있는 기질 선택성 (broad substrate specificity)을 가진 효소의 발굴을 기대할 수 있습니다. 본 연구에서 목재부후균 22 종을 대상으로 배양액에 첨가한 다양한 구조의 식물 유래 화합물의 구조 변화를 대사체 분석을 통해 대부분의 균주에서 대사가 일어남을 확인하였습니다. 그중 다수의 화합물에 오탄당을 결합시키는 겨울구멍장이버섯 (Lentinus brumalis)를 선발하였습니다. 그리고 이 균주에 대해서 전장유전체 및 전사체 분석을 하였고, 해당 균주로부터 화합물에 당을 부착하는 당 전이 효소를 분리하고 이를 포함하는 형질전환 대장균을 제작하여 발현시켰습니다. UGT66A1으로 명명한 이 효소는 다른 당에 비해 자일로스에 더 높은 선호도를 가지고 있으며, 식물 성분뿐 아니라 합성 약물인 ezetimibe, levothyroxine, raloxifene에도 자일로스 결합을 촉진하였습니다. 추가적인 효소공학적 개량을 거치면 유용한 생체 촉매로 활용할 수 있을 것으로 기대됩니다. 이번 연구는 그동안 자연계에서 찾기 어려웠던 효소를 대사체 및 유전체 마이닝을 통해 발굴하고 활성을 확인해, 단시간 내에 미생물이 가지고 있는 효소의 반응성과 기질 특이성을 밝혀내고, 더불어 생체 촉매의 풀(pool)을 확장했다는 점에서 큰 의미가 있습니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. 저는 숙명여자대학교 천연물 화학 연구실에서 강교빈 교수님 지도하에 공부 및 연구를 진행하고 있습니다. 저희 연구실에서는 NMR 및 MS 등의 첨단 분석기술을 활용하여 식물 및 진균과 같은 천연 소재로부터 소분자 화합물 위주의 연구를 수행하고 있으며, computational technique을 활용하여 대규모의 대사체학 데이터를 효율적으로 분석하는 기술을 보유하고

  • Proc. Natl. Acad. Sci. USA

  2023.07.12

  2023.07.12

• • 송민호(건국대학교)

  • 이지호(건국대학교)

  Dynamic modeling of pesticide residue in proso millet under multiple application situations

  • Environ. Pollut. 2023 Jun 8;121993 | https://doi.org/10.1016/j.envpol.2023.121993

  • 2023.06
  • 생명과학