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'Lipidomics' 에 대한 통합검색결과 18건입니다.

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민은기

서울과학기술대학교

대사체(metabolite)는 화학물질이 유발하는 독성의 표현형(phenotype)과 가장 가까운 단계에 있는 1000 Da 이하의 생체분자입니다. 대사체를 활용한 오믹스 분석은 주로 분석 기법에 따라 대사체학(metabolomics)과 지질체학(lipidomics)으로 구분되며, 다중오믹스 분석으로 적용될 수 있습니다. 대사체학은 주로 친수성 대사체를, 지질체학은 다양한 지질종을 식별하는 데 특화되어 있습니다.
- J. Hazard. Mater.
- 2024.12.11
Applying newly suggested simultaneous analysis of metabolomics and lipidomics into perfluorooctanesulfonate-derived neurotoxicity mechanism in zebrafi
- J. Hazard. Mater. Nov 28 2024, 484 S0304-3894(24)03293-X | https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2024.136712
- 2024.11
- 생명과학
함아롬

Columbia University Irving Medical Center

자폐스펙트럼장애(Autism Spectrum Disorder, 이하 ASD)는 타인과 사회적 상호작용의 장애, 의사소통의 장애, 반복적인 행동을 특징으로 하는 발달 장애의 일종으로 발병원인으로는 유전적 요인과 환경적 요인 등이 복합적으로 영향을 미치는 것으로 보고되어 있습니다. 미국 질병통제예방센터(CDC)의 발표에 따르면, 자폐스펙트럼장애의 유병률은 미국은 36명 중 1명 꼴로 ASD로 진단이 되는 것으로 알려져 있고 ASD의 유병률은 전세계적으로 매년 빠르게 증가하고 있지만, 정확한 발병 메커니즘이 밝혀지지 않아 승인된 치료제가 아직 없는 실정입니다.
- Mol. Psychiatr.
- 2024.10.14
- 조태호(Indiana University School of Medicine)
- 노광식(Indiana University School of Medicine)
Circular-SWAT for deep learning based diagnostic classification of Alzheimer‘s disease: application to metabolome data.
- EBioMedicine Oct 06 2023, 97 S2352-3964(23)00386-9 | https://doi.org/10.1016/j.ebiom.2023.104820
- 2023.10
- 생명과학
Lipid remodeling of adipose tissue in metabolic health and disease.
- Exp. Mol. Med. Sep 01 2023, | https://doi.org/10.1038/s12276-023-01071-4
- 2023.09
- 의약학
- Nguyen Hoang Anh(서울대학교 약학대학)
- 권성원(서울대학교 약학대학)
Unveiling potentially convergent key events related to adverse outcome pathways induced by silver nanoparticles via cross-species omics-scale analysis
- J. Hazard. Mater. 2023 Aug 2;459:132208 | https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2023.132208
- 2023.08
- 의약학
- 김기현(한양대학교)
Heavy metals and arsenic stress in food crops: Elucidating antioxidative defense mechanisms in hyperaccumulators for food security, agricultural susta
- Sci. Total Environ. 2023 May 20;874:162327 | https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2023.162327
- 2023.05
- 오영택(Columbia University Medical Center, 현 University of Miami )
  Interview
Integrative multi-omics networks identify PKCδ and DNA-PK as master kinases of glioblastoma subtypes and guide targeted cancer therapy
- Nat. Cancer 2023 Feb;4(2):181-202 | https://doi.org/10.1038/s43018-022-00510-x
- 2023.02
- 의약학
Caenorhabditis elegans deep lipidome profiling by using integrative mass spectrometry acquisitions reveals significantly altered lipid networks
- J. Pharm. Anal. Volume 12, Issue 5, October 2022, Pages 743-754 | https://doi.org/10.1016/j.jpha.2022.06.006
- 2022.10
- 의약학
- 윤종혁(한국뇌연구원)
- 서영석(한국뇌연구원)
Brain lipidomics: From functional landscape to clinical significance
- Sci. Adv. 16 Sep 2022 Vol 8, Issue 37 | DOI: 10.1126/sciadv.adc9317
- 2022.09
- 생명과학
- 박경민(Harvard Medical School)
Endothelial Cells Induced Progenitors Into Brown Fat to Reduce Atherosclerosis
- Circ. Res. Originally published1 Jun 2022 | https://doi.org/10.1161/CIRCRESAHA.121.319582
- 2022.06
우종민

Pacific Northwest National Laboratory, 현 University of North Carolina at Greensboro

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 연구 소개, 동향, 및 전망 질량분석기 (Mass spectrometry) 를 이용한 단백체학 (Proteomics) 은 생물학 연구에서 부터 기초의학, 임상의학 연구에 이르기까지 많은 분야에서 높은 신뢰도를 가지고 만개 이상의 단백질을 동시에 상대/절대정량을 할 수 있는 기술입니다. 최근에 들어 단일세포 간의 단백체 차이를 보고자 하는 single-cell proteomics (scProteomics) 연구의 필요성이 대두 되었지만, 증폭이 불가능한 단백질 수준에서의 세포 내 단백질 동정 및 정량 연구를 하기 위해서 민감도를 향상시킬수 있는 기술의 개발이 필요하였습니다. 이에 본 연구에서는 nanoPOTS robot을 이용한 기존의sample prep 방법에 더하여 LC-FAIMS-MS를 이용한 TIFF (Transferring Identification based on FAIMS Filtering) 질량분석기법의 개발을 통해 각 단일세포의 단백질들을 동정 및 정량성 결과를 향상시켰을 뿐만 아니라, 상업적 구입이 가능한 CellenONE system을 도입하여 향후 다른 연구실에서도 수십 수백 개의 단일세포들을 동시에 단백체 분석을 할 수 있는 가능성을 제시하였습니다. 특히 이 연구에서는 자체 개발된 nested-nanowell (N2) chip상에서 cell sorting, digestion 및 TMT labeling에 이르기까지 모든 시료준비 과정을 한번에 진행하여 각 단일세포의 단백질들을 최대한 로스없이 추출하고 분석할 수 있는 workflow를 제시하였습니다. 앞으로 이러한 기술을 가지고 단세포들 간의 proteome heterogeneity 차이를 정량적으로 연구하여 단일세포 분자기능 및 특정조건에서 서로 다른 세포 유형 간 분자의 정량적 변화를 심층적으로 들여다볼 수 있을 것이라 기대합니다. 연구과정중의 에피소드 본 연구를 위해서는 수십 nano-liter volume의 시료를 공기중으로 증발없이 다루어야 합니다. 하지만 건조한 기후 조건을 가진 미국 서북부 지역에서, 또한 매우 건조한 겨울날씨 속에서 이는 저에게 굉장히 큰 도전이였습니다. 그렇기에 수많은 실패를 겪어가며 건조한 환경가운데서도 single-cell 을 다루는 기술을 터득하였을때 그 기쁨은 이루 말할 수 없었습니다. 또한 이 프로젝트는 COVID-19이 터지기 직전에 시작이 되어 연구기간의 대부분이 코로나 기간과 맞물리며 제한된 실험실 출입 및 자택근무등 여러가지 어려운 상황가운데 진행이
- Cell Syst.
- 2022.06.09
- 김아영(서울대학교)
- 김상건(동국대학교)
Ablation of USP21 in skeletal muscle promotes oxidative fibre phenotype, inhibiting obesity and type 2 diabetes
- J. Cachexia Sarcopenia Muscle First published: 15 September 2021 | https://doi.org/10.1002/jcsm.12777
- 2021.09
- 의약학
Large-scale lipidomic profiling identifies novel potential biomarkers for prion diseases and highlights lipid raft-related pathways
- Vet. Res. Published: 21 July 2021, 52, Article number: 105 | https://doi.org/10.1186/s13567-021-00975-1
- 2021.07
- 의약학
이동규

서울대학교

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 이 연구가 처음에 시작된 계기는 2014년도에 Scientific Reports에 게재된 "Non-invasive characterization of the adipogenic differentiation of human bone marrow-derived mesenchymal stromal cells by HS-SPME/GC-MS"의 discussion 파트를 작성할 때 였습니다. 해당 연구에서 중간엽줄기세포에서 지방세포로의 분화 시 방출되는 휘발성 지표물질로써 7종의 fatty acid methyl ester가 발견되었는데, 이들의 생합성의 유래를 명확히 밝힌 연구결과가 없다는 것과, 휘발성 물질의 대사 유래를 밝히는 마땅한 연구 방법이 없다는 것을 확인했습니다. 따라서 저분자 물질의 metabolic network를 생체유래휘발성물질 (biogenic volatile organic compounds)로까지 확장할 수 있는 기반기술을 개발해보자는 계획을 세웠었습니다. 그리고 4년전에 시작된 연구가 mass spectrometry-based imaging (MSI), isotope labeling을 적용한 fluxomics, HS-SPME에 기반한 volatile compound profiling을 모두 습득한 지금에서야 논문으로써 게재되었습니다. 휘발성물질은 metabolic pathway에 관련된 다양한 database에 연결고리가 존재하지 않아서 대사체학 연구에서 많이 활용되지 않았던 측면이 있었습니다. 그러나 이번 논문에 게재한 기술을 적용하게 된다면 다양한 생물종의 in vitro 실험을 통한 휘발성 물질로의 metabolic pathway 확장에 유용하게 활용될 것으로 보입니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁 드립니다. 저희 서울대학교 약품분석실은 질량분석기 (mass spectrometry) 기반 대사체학 (metabolomics), 지질체학 (lipidomics)의 methodology 개발과 이를 적용한 다양한 생체현상에 연관되는 대사기전의 변화를 관찰 및 추적하는 연구를 수행하고 있습니다. 지도교수님이신 약학대학 권성원 교수님께서는 보통의 실험실과는 다르게 굉장히 민주적이고 권위의식 없는 실험실을 만들고자 애쓰십니다. 학생을 위해 맛있는 음식도 직접 만들어오시고 빵도 구워오실 정도로 학생 친화적인 교수님이시며 항상 학생의 인권을 신경쓰시는 훌륭한 분이십니다. 그리고 항상 학생 스스로가 정보를 습득하고 연구를 주도하는 것이 중요함을 강조하십니다. 그래서 실험의 계획부터 논문의 게재까지의 모든 과정에 대해 학생 스스로
- ACS Central Sci.
- 2018.08.14
- 이호준(University of California, Berkeley)
Molecular profiling of Mycobacterium tuberculosis identifies tuberculosinyl nucleoside products of the virulence-associated enzyme Rv3378c
- Proc. Natl. Acad. Sci. USA published ahead of print February 10, 2014, doi:10.1073/pnas.1315883111
- 2014.02
- 최동식(포항공과대학교)
- 고용송(POSTECH)
Proteomics, transcriptomics and lipidomics of exosomes and ectosomes
- Proteomics Volume 13, Issue 10-11, pages 1554-1571, May 2013 | DOI: 10.1002/pmic.201200329
- 2013.05
- 생명과학
윤강섭

Arizona State University

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 현재 많은 국가에서 미세조류 (microalgae)를 활용한 바이오연료 (Biofuel)개발에 활발한 시도가 이루어지고 있습니다. 특히, 미국, 이스라엘 그리고 중국은 수송용 연료인 바이오디젤을 대량으로 정제하고 생산하는 상업화 기술에 집중하고 있습니다. 많은 미세조류는 바이오디젤의 원료물질인 오일성분 (TAGs: Triacylglycerols)을 특정환경조건하에서 50% 까지 축적 할 수 있습니다. 식물종자오일의 합성대사과정에 관여하는 유전자 및 효소의 분자생물생화학적 연구가 많이 진행되고 있는 반면, 미세조류에서는 이들 연구가 많이 미비한 수준에 있습니다. 많은 연구자들은 식물과 미세조류에서 유용한 오일성분을 경제적 수준으로 생산량을 증가시키기 위한 노력을 기울이고 있으나 아직까지는 산업적 수준에 미치지 못하는 실정에 있습니다. 이러한 문제점을 해결하기 위한 중요한 요인중의 하나는 오일대사경로상 (lipid metabolic pathway) 오일축적과 생산에 관여하는 효소연구가 필수라는 의견에 많은 연구자가 동의하고 있습니다. 이번에 소개된 논문은 모델미세조류인 Chlamydomonas의 오일합성에 관여하는 acyltransferase (Phospholipid:diacylglycerol acyltransferase; PDAT)효소의 생화학적 기능과 구조 및 lipidomics 대해 연구를 하였으며 특히 이 효소가 오일산업의 잠재적인 Biocatalyst(as lipase)로 활용될 수 있음을 보여주었다는 것에 의미가 있습니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁 드립니다. Arizona State University 현재 미국내에서 미세조류배양에 최적합 지역으로 꼽히는 Arizona 지역에 위치하고 있습니다. 제가 소속된 AzCATI(Arizona Center for Algae Technology and Innovation)는 Dr. Qiang Hu and Milton Sommerfeld박사를 중심으로 많은 연구자들이 조류 바이오 연료개발에 매진하고 있으며 우수한 연구시설들, 특히 외부 협력 기관들의 연구를 돕기 위한 시험용 대량배양 시설들을 갖추고 있습니다. 그림. Algae bioreactors indoors and outdoors in Arizona State University 3. 연구활동 하시면서 평소 느끼신 점 또는 자부심, 보람 연구과정 중에 다소 어렵게 일을 해결하는 경우가 많이 있었습니다. 때로는 일에 대한 회의도 있었지만 일에 대한 가능성을 퍼즐처럼 하나하나 맞추어가고
- Plant Cell
- 2012.10.11

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