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1Isocitrate dehydrogenase 2

'Isocitrate dehydrogenase 2' 에 대한 통합검색결과 21건입니다.

한빛사21건

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- 문혜현(울산대학교 의과대학, 서울아산병원)
- 박지은(울산대학교 의과대학, 서울아산병원)
Prospective Longitudinal Analysis of Physiologic MRI-based Tumor Habitat Predicts Short-term Patient Outcomes in IDH-wildtype Glioblastoma
- Neuro-Oncology Oct 25 2024, noae227 | https://doi.org/10.1093/neuonc/noae227
- 2024.10
- 의약학
- 강경미(서울대학교병원)
MRI Scoring Systems for Predicting Isocitrate Dehydrogenase Mutation and Chromosome 1p/19q Codeletion in Adult-type Diffuse Glioma Lacking Contrast En
- Radiology May 2024, 311 (2) | https://doi.org/10.1148/radiol.233120
- 2024.05
Generative AI in glioma: ensuring diversity in training image phenotypes to improve diagnostic performance for IDH mutation prediction
- Neuro-Oncology Jan 22 2024, noae012 | https://doi.org/10.1093/neuonc/noae012
- 2024.01
- 바이오·의료융합
최규성

서울대학교병원

뇌교종(glioma)은 가장 흔한 원발성 뇌종양이고, 그 중 조직병리학적으로 악성도가 가장 높은 교모세포종(Glioblastoma)이라는 질병은 지난 20년간 환자의 median survival로 대변되는 치료 성적이 15개월에서 별반 나아지지 않는 매우 어려운 질환입니다. 2021년 뇌종양의 WHO classification이 바뀌면서 성인형 미만성 뇌교종(adult-type diffuse glioma)의 분류 기준이 기존과 달리, 이소시트르산 탈수소효소 (isocitrate dehydrogenase; 이하 IDH)의 유전자 변이와 1p/19q codeletion의 유무에 따라 재분류되게 되었으며, 이로써 더 예후를 잘 설명하게 되었습니다.
- Neuro-Oncology
- 2023.11.20
11C-Acetate PET/CT Detects Reactive Astrogliosis Helping Glioma Classification
- Clin. Nucl. Med. Epub 2022 Jul 26. Oct 1;47(10):863-868. | doi: 10.1097/RLU.0000000000004341
- 2022.07
- 의약학
Molecular and radiopathologic spectrum between HCC and intrahepatic cholangiocarcinoma
- Hepatology First published: 05 February 2022 | https://doi.org/10.1002/hep.32397
- 2022.02
- 의약학
- 한용권(경북대학교 의과대학)
- 박권무(경북대학교 의과대학)
Oxidative stress following acute kidney injury causes disruption of lung cell cilia and their release into the bronchoaveolar lavage fluid and lung in
- Redox Biol. Volume 46, October 2021, 102077 | https://doi.org/10.1016/j.redox.2021.102077
- 2021.10
- 생명과학
- 정찬(University of Michigan)
  Interview
Integrated Metabolic and Epigenomic Reprograming by H3K27M Mutations in Diffuse Intrinsic Pontine Gliomas
- Cancer Cell Available online 13 August 2020 | https://doi.org/10.1016/j.ccell.2020.07.008
- 2020.08
- 생명과학
최윤성

연세대학교, Duke-NUS medical school

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 뇌종양 중 glioma는 가장 흔한 원발성 뇌종양으로, 종류에 따라 다양한 예후를 보입니다. 이러한 다양한 예후를 설명하는 데 있어, IDH (isocitrate dehydrogenase) gene과 같은 분자유전학적 특성이 중요하다는 사실이 밝혀지면서, 2016년부터 뇌종양의 WHO classification에 IDH 유전자 변이 유무가 glioma 분류 기준으로 포함되었습니다. 본 연구는, 수술 전 brain MRI에 통상적으로 포함되는 conventional structure MRI에 CNN (convolutional neural network)을 적용하여 종양의 IDH 상태를 예측한 연구입니다. Conventional MRI 로 IDH 상태를 예측하는 딥러닝 연구는 과거 몇 편 발표된 바 있으나, 1) 예측 과정이 완전 자동화가 되지 않았거나, 2) 딥러닝 모델의 예측 정확도가 다른 병원 혹은 국가의 환자에서 어느정도 유지되는지 generalizability에 대한 external testing 이 되지 않았다는 점에서 한계가 있었습니다. 인력 및 딥러닝 모델 개발 여건의 부족을 고려하면, IDH 예측 모델의 임상 적용에 있어 “완전 자동화된 IDH 상태 예측모델을 큰 규모의 단일병원에서 개발하고, 이 모델을 다른 병원에서 도입해 쓴다.” 는 시나리오가 가장 현실적이라고 생각했습니다. 이를 위해 본 연구에서는, 3개 데이터셋 (세브란스병원, 서울대병원, The Cancer Imaging Archive)의 1,100명이 넘는 glioma 환자를 대상으로, 세브란스병원 데이터를 기반으로 완전 자동화된 IDH 상태 예측 모델을 트레이닝 한 후, 이를 세브란스병원 데이터 및 다른 두 데이터 셋에서 각각 internal, external testing을 하였습니다. 또한, 기존의 CNN이 이미지 픽셀값만을 이용하는 것과 달리, MRI상의 2차원 종양 부위 픽셀값 및 3차원적인 종양 위치 및 모양 정보를 모두 이용하여 예측 정확도를 높였습니다. 또한, Gradient-weighted Class Activation Mapping 기법으로, 딥러닝 모델이 IDH 상태 예측을 하는데 있어 종양 이미지의 어느 부분이 중요한지 해석하였습니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁 드립니다. 본 연구는 세브란스병원의 데이터를 주축으로 한 연구입니다. 세브란스병원 뇌종양센터에서는 신경외과, 영상의학과, 방사선종양학과, 종양내과, 병리학과 등 여러 과의 체계적인 협업이 이루어지며, 매주 월요일 오
- Neuro-Oncology
- 2020.08.18
Integrated pharmaco-proteogenomics defines two subgroups in isocitrate dehydrogenase wild-type glioblastoma with prognostic and therapeutic opportunit
- Nat. Commun. Published: 03 July 2020, 11, Article number: 3288 (2020) | https://doi.org/10.1038/s41467-020-17139-y
- 2020.07
- 의약학
- 최윤성(연세대학교, Duke-NUS medical school )
  Interview
Fully Automated Hybrid Approach to Predict the IDH Mutation Status of Gliomas via Deep Learning and Radiomics
- Neuro-Oncology Published: 24 July 2020 | https://doi.org/10.1093/neuonc/noaa177
- 2020.07
오세진

연세대학교 의과대학

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 교모세포종 (GBM)은 환자의 중간 생존기간이 15개월 정도의 수술 후 재발률과 사망률이 높은 성인 뇌종양입니다. 또한, 활용 가능한 환자의 예후 마커와 치료제가 극히 제한적인 상황입니다. 이러한 상황을 타개하기 위해, TCGA 연구로 대표되는 대규모 유전/전사체 기반 연구가 진행되었고 이를 통해 주요 발암 돌연변이와 잠재적 치료 표적 등이 발굴되었습니다. 하지만, 수 많은 연구결과에도 불구하고 임상에서 유의미한 진전은 미미한 실정입니다. 이것의 근본적 원인으론, 유전/전사체 분석만으로는 약의 표적인 종양 내 단백체 상태를 예측하는데 한계가 있기 때문입니다. 이번 연구에서는 앞의 문제를 극복하고자 50례의 뇌종양에대한 유전체, 전사체, 전장 (全長) 단백체 및 인산화 단백체 데이터와 환자 종양에서 암세포 (patient derived cell)를 얻어 60종의 표적항암제 감수성 데이터를 통합 분석했습니다. 이 연구를 통해 2개의 단백체 뇌종양 아형들 (Glioblastoma proteomic cluster, GPC)을 파악했고 이들의 가장 큰 차이는 전사체 데이터로는 파악이 어려운 대사 관련 단백질 발현에 있음을 밝혀냈습니다. 그리고, 이 두 아형은 기원세포가 다름을 제시하였고 Single-cell분석을 통해 2가지 아형이 종양 내에 모두 존재하며 이들의 비율에 따라 전체 종양 (bulk-tumor)의 특성이 결정됨을 밝혔습니다. 환자 생존마커의 경우, TCGA분석에서 GBM에대해 271개의 유전자가 환자 예후마커로 제시 됐습니다. 하지만, 이들 중 오직 3개만 저희 단백체 데이터에서 유의미한 환자 생존 마커로 나왔습니다. 이 3개 중 PHGDH는 가장 유의미한 마커였고 분자생물학 실험을 통해 PHGDH가 GBM의 침습성 (invasiveness)을 억제한다는 사실을 밝혔습니다. 또한, PHGDH 발현이 낮은 GBM은 mTORC1/2 저해제인 AZD2014에대해 민감하다는 것을 밝혀 악성 GBM에대해 AZD2014가 효과적인 치료제가 될 수 있음을 보고 했습니다. 이와 같이, 저희 논문에서는 4개의 고차원 데이터들의 통합 분석을 통해, 유전체 분석만으로는 풀리기 어려운 난제들이 단백체 데이터의 활용으로 해결될 가능성이 있음을 보여주고 있습니다. 따라서, 앞으로 연구 동향은 약물유전체학 (pharmaco-genomics) 분석에서 약물유전단백체학 (pharmaco-proteogenomics) 분석으로 옮겨
- Nat. Commun.
- 2020.07.07
최규성

KAIST

뇌교종(glioma)은 가장 흔한 원발성 뇌종양이고, 그 중 조직병리학적으로 악성도가 가장 높은 고등급 (grade IV)에 해당하는 다형성 교모세포종(Glioblastoma multiforme)이라는 질병은 지난 20년간 환자의 median survival로 대변되는 치료 성적이 별반 나아지지 않는 매우 어려운 질환입니다. 2016년 뇌종양의 WHO classification이 바뀌면서 뇌교종의 분류 기준이 기존과 달리,
- Neuro-Oncology
- 2019.10.04
Human glioblastoma arises from subventricular zone cells with low-level driver mutations
- Nature Published 01 August 2018 | https://doi.org/10.1038/s41586-018-0389-3
- 2018.08
- 의약학
- 최창호(University of Texas Southwestern Medical Center)
Prospective Longitudinal Analysis of 2-Hydroxyglutarate Magnetic Resonance Spectroscopy Identifies Broad Clinical Utility for the Management of Patien
- J. Clin. Oncol. Published online before print October 31, 2016 | DOI: 10.1200/JCO.2016.67.1222
- 2016.10
- 심은희(University of Alabama at Birmingham)
L-2-Hydroxyglutarate: An Epigenetic Modifier and Putative Oncometabolite in Renal Cancer
- Cancer Discov. September 2, 2014 | doi: 10.1158/2159-8290.CD-13-0696
- 2014.09
- 이성우(Dana-Farber Cancer Institute and Brigham and Women’s Hospital)
Transformation by the (R)-enantiomer of 2-hydroxyglutarate linked to EGLN activation
- Nature 483, 484–488 (22 March 2012) | doi:10.1038/nature10898
- 2012.02
- 이성우(Dana-Farber Cancer Institute and Brigham and Women’s Hospital)
Transformation by the (R)-enantiomer of 2-hydroxyglutarate linked to EGLN activation
- Nature 483, 484–488 (22 March 2012) | doi:10.1038/nature10898
- 2012.02
Chilling stress-induced proteomic changes in rice roots
- J. Plant Physiol. Volume 166, Issue 1, 1 January 2009, Pages 1-11 | https://doi.org/10.1016/j.jplph.2008.02.001
- 2009.01
Cytosolic NADP+-dependent isocitrate dehydrogenase status modulates oxidative damage to cells
- Free Radic. Biol. Med. Volume 32, Issue 11, 1 June 2002, Pages 1185-1196 | doi:10.1016/S0891-5849(02)00815-8
- 2002.06