Integrative Multi-omics > 통합검색 | BRIC

통합검색

한빛사

내가 찾은 검색어

1Integrative Multi-omics

'Integrative Multi-omics' 에 대한 통합검색결과 19건입니다.

한빛사19건

최신순
관련도순

- 성연주(Washington University School of Medicine)
TOPMed imputed genomics enhances genomic atlas of the human proteome in brain, cerebrospinal fluid, and plasma
- Sci. Data Apr 16 2024, 11 (1) | https://doi.org/10.1038/s41597-024-03140-3
- 2024.04
- 의약학
Integrative multi-omics analysis reveals different metabolic phenotypes based on molecular characteristics in thyroid cancer
- Clin. Cancer Res. Dec 13 2023, | https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-23-2025
- 2023.12
- 의약학
Prioritization of therapeutic targets for dyslipidemia using integrative multi-omics and multi-trait analysis
- Cell Rep. Med. Published:August 14, 2023 | https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2023.101112
- 2023.08
- 의약학
Integrative multi-omics reveals analogous developmental neurotoxicity mechanisms between perfluorobutanesulfonic acid and perfluorooctanesulfonic acid
- J. Hazard. Mater. 2023 May 25;457:131714 | https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2023.131714
- 2023.05
- 생명과학
오영택

Columbia University Medical Center, 현 University of Miami

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 Glioblastoma Multiforme (GBM)은 악성 뇌종양으로 치사율이 굉장히 높은 암입니다. 또한 방사선 치료법 또는 화학 약물 치료법와 같은 관습적인 치료 이외에 새로운 치료법을 개발하기위해 많은 연구진이 노력해오고 있지만 Heterogeneity라는 특성때문에 어려운 것이 현실입니다. 이에 따라서 많은 연구진이 GBM을 좀 더 쉽게 접근하기 위한 classification 연구를 진행해왔지만 임상적인 접근을 했을 때 이와 맞지 않는 결과를 보여왔습니다. 이에 따라 이전 논문 (Nature Cancer. 2021; DOI: 10.1038/s43018-020-00159-4.)에서 단순히 gene expression뿐만 아니라 single cell sequencing을 통해 환자 예후와 cell signaling activity를 추가하여 새로운 GBM classification (Metabolic axis and Neurodevelopmental axis)을 구축하였습니다. 본 논문에서는 proteomics를 기반으로 새로운 치료 표적을 개발하는 기법(Substrate PHosphosite-based Inference for Network of KinaseS; SPHINKS)을 구축하고 환자 유래 세포주(Patient derived organoids; PDOs)를 이용하여 이를 검증하는 연구를 진행했습니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. 본 연구는 Columbia University Medical Center의 Institute for Cancer Genetics department에서 Antonio Iavarone 교수님과 Anna Lasorella 교수님 연구실에서 진행하였습니다. Bioinformatics 연구를 진행하는 팀과 Experimental functional validation 연구를 진행하는 팀으로 구성되어 있으며 다양한 GBM에 관한 연구를 진행해오고 있습니다. 현재 전체 연구실이 University of Miami의 Sylvester Comprehensive Cancer Center 부서로 이동하여 새로운 연구 기법을 적용하여 임상적인 접근이 용이한 연구를 진행하고 있습니다. 3. 연구 활동 하시면서 평소 느끼신 점 또는 자부심, 보람 대학원에 입학하면서 처음 악성 뇌종양이라는 질병을 접하게 되었고 발병률은 낮지만 치료가 힘들다는 부분에서 연구의 필요성을 느끼게 되었습니다. 특히 뇌라는 영역에 대한 연구를 진행함에 있어서 새로운 연구 기법 개발도 진행할 수 있다는 부분에 매력을 느끼며 이 때문에 다양한 협업이 가능하는 점은 앞으로 질병 연구를 하는 사람이 가져야하는 중요한 자
- Nat. Cancer
- 2023.03.20
- 오영택(Columbia University Medical Center, 현 University of Miami )
  Interview
Integrative multi-omics networks identify PKCδ and DNA-PK as master kinases of glioblastoma subtypes and guide targeted cancer therapy
- Nat. Cancer 2023 Feb;4(2):181-202 | https://doi.org/10.1038/s43018-022-00510-x
- 2023.02
- 의약학
Patient-derived cell-based pharmacogenomic assessment to unveil underlying resistance mechanisms and novel therapeutics for advanced lung cancer
- J. Exp. Clin. Cancer Res. 2023 Jan 30;42(1):37 | https://doi.org/10.1186/s13046-023-02606-3
- 2023.01
- 생명과학
장우영

경희대학교

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 오믹스 연구에는 유전학, 전 자체, 단백체, 대 사체를 포함한 다양한 연구가 진행된다. 지금까지 단백체, 대 사체와 관련된 다양한 생물학적 샘플에 질량 분석기를 사용하여 광범위하게 연구에 참여했다. 다양한 유형의 질량 분석기가 있지만 분자 네트워크 발견 및 바이오마커 발굴 실험에서는 주로 오비 트랩(Orbitrap) 기반 질량 분석기를 사용되고 있다. 질량분석을 통한 질병 진단에서 멀티와 믹스 및 유전 단백체에 대한 생화학 또한 의류 기관에서 큰 관심을 갖고 있으며, 단백체, 유전체, 대 사체 같은 오믹스 기술의 발전으로 유용한 바이오마커의 발굴이 가속화되고 있다. 질량분석 단백체 실험은 다양하게 있지만 대표적으로 다양한 다른 생물학적 샘플 (KO, mutation, time-point) 을 화학적인 Tandem mass tag (TMT) 또는 SILAC 을 이용하여 상대적 정량화를 통해 다양한 단백질의 발연 차이를 알아볼 수 있다. 자폐스펙트럼 장애에 대한 유전체 연구가 많이 알려졌음에도 아직까지 치료를 위해 어떠한 붐 자 마커 또는 네트워크를 중요한지 모른다. 본 연구를 다 중요 믹스 연구 데이터 통합을 통해 중요한 분자 혹은 네트 쿼크를 발굴하고 싶은 게 연구의 목적이었다. 자폐스펙트럼 장애 (ASD)는 이를 시기에 발생하며, 신경 발달 장애의 하나로, 사회적인 상호작용화 의사소통, 흥미나 행동 및 제한적이고, 반복적인 특성 행동이 주로 되는 나타나는 증상이다. 본 연구는 자폐스펙트럼 장애의 모델인 Cntnap2 KO 생쥐의 mPFC 조직을 통해 단백체 및 대 사체 분석을 질량분석법을 화룡 허여 수행하였다. 더 나아가 단백-대사 체 통합 분석을 진행하였으며 이 분석으로 수집된 데이터와 학계에 보고되었던 환자의 오믹스 데이터와 Cntnap2 돌연변이의 올가 노이드 단일 세포 데이터 비교 분석을 통하여, 흥분성 뉴런에서 물지 대사와 시냅스 등의 네트워크에 문제가 발생함을 확인했다. 본 연구에서 다 중요 믹스 데이터를 통합 분석 기술을 개발하였으며 (생취 단백체, 생쥐 대 사체, 환자 대 사체 및 지질 체, 환자 전 자체, Cntnap2 환자 유래 오거 노이드 단일 세포 데이터) 이를 통해 자폐스펙트럼 장애 환자의 치료를 위한 타깃 세포 및 분자 네트워크를 발굴할였다. 자폐증 스펙트럼 환자에게 보일 수 있는 분자 네트
- Mol. Psychiatr.
- 2022.11.16
Cntnap2-dependent molecular networks in autism spectrum disorder revealed through an integrative multi-omics analysis
- Mol. Psychiatr. Published 17 October 2022 | https://doi.org/10.1038/s41380-022-01822-1
- 2022.10
- 생명과학
김준표

Indiana University

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 알츠하이머병은 제가 전공한 신경과의 여러 분야들중에 가장 연구가 활발한 편에 속합니다. 한국 뿐만 아니라 전세계적으로 알츠하이머병과의 전쟁에서 승리하기 위해 천문학적인 비용이 투여되고 있습니다. 그에 따라 다양한 뇌 영상 및 바이오마커 기술이 발전하며 진단적인 측면에 있어서는 많은 발전을 이루었지만 여전히 환자의 치료라는 측면에서는 제한이 많습니다. 특히 아직도 병인론적인 측면에서 밝혀지지 않은 것이 많아 유전학적 요인들에 많은 관심이 집중되고 있습니다. 유전자형과 관련된 연구는 이미 많은 연구가 이루어져서 연관된 SNP 들이 많이 밝혀졌기 때문에 이제는 transcriptomics, epigenomics 데이터를 이용한 연구 및 이런 다양한 데이터들을 통합하는 연구들이 많이 이루어지고 있습니다 저는 신경과 의사로서 임상의사들이 많이 진행하고 있는 뇌 영상 관련 연구들을 진행해 왔습니다. 비록 전임의 기간동안 R이나 Python 등을 어느정도는 공부했지만, 임상 연구에 사용하기 위함이었기 때문에 Intensive 하게 다루지는 못했습니다. 인디애나 대학교에 합류하면서 여러가지 툴들을 이용해서 Bioinformatics 연구를 진행하게 되면서 하나하나 배우는 과정이 어렵기도 했지만, 노광식 교수님의 지도에 더하여 Google/stack overflow 검색으로 하나씩 주어진 Task들을 해냈을 때의 성취감은 이루 말할 수 없었습니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. 저는 2019년부터 진행된 바이오메디컬 글로벌 인재양성사업에 선정되어 인디애나 대학교 Indiana Alzheimer’s Disease Research Center (IADRC) 에서 알츠하이머병 관련 bioinformatics 연구를 진행중인 노광식 교수님 lab 에 합류하였습니다. 본 Lab에서는 알츠하이머 연구의 다기관 국제 컨소시움인 ADNI의 Genetics core로 중요한 한 축을 담당하고 있습니다. 연구자 입장에서는 다양한 종류의 Multi-omics 데이터를 접해보고 직접 분석해볼 수 있어 좋은 연구에 대한 많은 기회를 얻을 수 있는 장점이 있습니다. 3. 연구 활동 하시면서 평소 느끼신 점 또는 자부심, 보람 연구를 하면서 고민이 되었던 부분은생물학이나생화학의 Background를 가지신 분들 만큼 기초 과학적인 접근을 하기 어렵고 Biostatistics나 컴
- Biol. Psychiatry
- 2022.10.11
- 박종찬(서울대학교 의과대학, University College of London)
  Interview
- 묵인희(서울대학교 의과대학)
Multi-Omics-Based Autophagy-Related Untypical Subtypes in Patients with Cerebral Amyloid Pathology
- Adv. Sci. First published: 13 June 2022 | https://doi.org/10.1002/advs.202201212
- 2022.06
- 의약학
Integrative multi-omics approach for mechanism of humidifier disinfectant-associated lung injury
- Clin. Transl. Med. First published: 04 November 2021 | https://doi.org/10.1002/ctm2.562
- 2021.11
- 의약학
- 허용진(고려대학교)
- 안준용(고려대학교)
Integrative multi-omics approaches in cancer research: from biological networks to clinical subtypes
- Mol. Cells 2021 Jul 31;44(7):433-443 | https://doi.org/10.14348/molcells.2021.0042
- 2021.07
- 생명과학
- 우현구(아주대학교 의과대학)
- 김윤준(서울대학교 의과대학)
Integrative analysis of genomic and epigenomic regulation of the transcriptome in liver cancer
- Nat. Commun. Published online:10 October 2017, 8, Article number: 839 | doi:10.1038/s41467-017-00991-w
- 2017.10
- 의약학
- 김민승(University of California, Davis)
Multi-omics integration accurately predicts cellular state in unexplored conditions for Escherichia coli
- Nat. Commun. Published online : 07 October 2016, 7, Article number: 13090 | doi:10.1038/ncomms13090
- 2016.10
- 정동준(Yale School of Public Health, Medical University of South Carolina)
Metabolic Regulation of Gene Expression by Histone Lysine β-Hydroxybutyrylation
- Mol. Cell Volume 62, Issue 2, p194-206, 21 April 2016, DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2016.03.036
- 2016.04
- 정동준(Yale School of Public Health, Medical University of South Carolina)
Metabolic Regulation of Gene Expression by Histone Lysine β-Hydroxybutyrylation
- Mol. Cell Volume 62, Issue 2, p194-206, 21 April 2016, DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2016.03.036
- 2016.04
- 윤성호(한국생명공학연구원)
- 김지현(한국생명공학연구원/연세대학교)
Comparative multi-omics systems analysis of Escherichia coli strains B and K-12
- Genome Biol. 2012, 13:R37 | doi:10.1186/gb-2012-13-5-r37
- 2012.05
- 생명과학
- 윤성호(한국생명공학연구원)
- 김지현(한국생명공학연구원/연세대학교)
Comparative multi-omics systems analysis of Escherichia coli strains B and K-12
- Genome Biol. 2012, 13:R37 | doi:10.1186/gb-2012-13-5-r37
- 2012.05
- 생명과학

1