한빛사810건

• • 홍지원(아주대학교 의과대학)

  • 진효준(아주대학교 의과대학)

  • 최미란(아주대학교 의과대학)

  • 임수빈(아주대학교 의과대학)

  Matrisomics: Beyond the extracellular matrix for unveiling tumor microenvironment

  • Biochim. Biophys. Acta-Rev. Cancer Sep 04 2024, S0304-419X(24)00109-4 | https://doi.org/10.1016/j.bbcan.2024.189178

  • 2024.09
  • 생명과학
• 

  안지송

  KAIST

  유전체 연구는 주로 암 조직에서 수행되어 왔지만, 정상 조직에서의 체세포 돌연변이 연구가 암의 근본적인 발생 기전을 이해하는 데 점점 더 중요해지고 있습니다. 우리 몸의 수많은 체세포는 세포분열을 거듭하며 체세포 돌연변이를 축적하고, 이로 인해 한 사람의 체세포들 사이에 미세한 유전체 서열 차이가 존재하는 ‘somatic mosaicism’ 현상이 발생합니다.

  • Nat. Genet.
  • 2024.08.26

• • 오진우(Johns Hopkins University)

  Gapped-kmer sequence modeling robustly identifies regulatory vocabularies and distal enhancers conserved between evolutionarily distant mammals

  • Nat. Commun. Published: 31 July 2024 | https://doi.org/10.1038/s41467-024-50708-z

  • 2024.07
  • 생명과학
• 

  김장근

  Weill Cornell Medicine

  인터뷰를 통해 2024년 Nature Portfolio를 통해 출판된 Space Omics and Medical Atlas (SOMA) across orbits 논문 패키지를 소개할 수 있게 되어 기쁩니다. SOMA across orbits는 25개 이상 국가, 100개 이상 연구기관이 협력하여 우주비행에 의한 세포, 조직, 개체, 및 시스템적인 변화와 이의 대응방안에 대한 44개의 논문으로 구성되어 있습니다.

  • Nat. Microbiol.
  • 2024.06.20
• 

  설동헌

  연세대학교 의과대학 안과학교실

  안과 분야에서 차세대염기서열분석 (next generation sequencing, NGS)이 보편적으로 진단과정에 적용되면서 그간 정확한 진단명을 찾지 못한 수많은 환자들의 진단명을 알 수 있을 것 같았지만, 실제로 유전성 망막 질환 분야에서 NGS검사로 인해 정확하게 진단이 가능했던 경우는 50-70%에 불과하였습니다. 즉, 나머지 30-50%의 환자들은 targeted panel NGS, 전장유전체시퀀싱 (genome sequencing, GS)까지 수행하였음에도 불구하고 원인을 찾지 못한 채 살아가야 했습니다.

  • JAMA Netw. Open
  • 2024.06.10

• • 고건환(한국생명공학연구원)

  • 이재호(한국생명공학연구원)

  • 심영미(한국생명공학연구원)

  • 황승우(한국생명공학연구원)

  • 박지환(한국생명공학연구원)

  • 김판규(한국생명공학연구원)

  • 김선영(한국생명공학연구원)

  • 이병욱(한국생명공학연구원)

  KoNA: Korean Nucleotide Archive as A New Data Repository for Nucleotide Sequence Data

  • Genom. Proteomics Bioinformatics May 09 2024, 22 (1) qzae017 | https://doi.org/10.1093/gpbjnl/qzae017

  • 2024.05

• • 강주은(Vanderbilt University School of Medicine)

  Genome-Wide Association Study of Treatment-Resistant Depression: Shared Biology With Metabolic Traits

  • Am. J. Psychiat. May 15 2024, | https://doi.org/10.1176/appi.ajp.20230247

  • 2024.05

• • 조영석(University of Michigan)

  • James J. Moon(University of Michigan)

  Novel strategies for modulating the gut microbiome for cancer therapy

  • Adv. Drug Deliv. Rev. May 15 2024, 210 S0169-409X(24)00154-6 | https://doi.org/10.1016/j.addr.2024.115332

  • 2024.05
  • 의약학

• • 김헌석(한양대학교)

  • 김용섭(울산대학교 의과대학, AMIST, 서울아산병원)

  Recent advances in CRISPR-based functional genomics for the study of disease-associated genetic variants

  • Exp. Mol. Med. 01 April 2024 | https://doi.org/10.1038/s12276-024-01212-3

  • 2024.04
  • 생명과학

• • 성연주(Washington University School of Medicine)

  TOPMed imputed genomics enhances genomic atlas of the human proteome in brain, cerebrospinal fluid, and plasma

  • Sci. Data Apr 16 2024, 11 (1) | https://doi.org/10.1038/s41597-024-03140-3

  • 2024.04
  • 의약학

• • 고서린(한국생명공학연구원)

    Interview

  • 이상희(한국생명공학연구원)

  • 구현진(한국생명공학연구원)

  • 김용민(한국생명공학연구원)

  • 권석윤(한국생명공학연구원)

  • 신아영(한국생명공학연구원)

  High-quality chromosome-level genome assembly of Nicotiana benthamiana

  • Sci. Data Apr 16 2024, 11 (1) | https://doi.org/10.1038/s41597-024-03232-0

  • 2024.04
  • 생명과학
• 

  오진우

  Johns Hopkins University

  저는 박사 과정 동안, 미국 내에서 조직된 ENCODE (Encyclopedia of DNA Elements)라는 컨소시엄을 통해 gene regulatory element의 시퀸스 구조와 생물학적 역할을 분석하는 연구를 수행해 왔습니다. 질병과 연관된 상당수의 유전체 변이가 regulatory element에 분포되어 있는 만큼, 다양한 regulatory element의 구조와 역할을 밝혀내는 것은 많은 유전질환들을 진단하고 치료하는데 중요합니다.

  • Nat. Methods
  • 2024.04.09

• • 윤바울(GIST)

  • 정수웅(경희대학교)

  • 박지환(GIST)

  Single-cell lineage tracing approaches to track kidney cell development and maintenance

  • Kidney Int. Mar 28 2024, S0085-2538(24)00244-8 | https://doi.org/10.1016/j.kint.2024.01.045

  • 2024.03
  • 생명과학
• 

  최은경

  University of Florida, 현 Lawrence Berkeley National Laboratory

  Nitrogen cycle은 지구 내 대기권, 수권, 지권, 생물권 사이 질소의 분포를 조절하며, 이러한 순환이 제대로 작동하기 위해서는 미생물의 역할이 매우 중요합니다. 20세기 ammonia를 대량으로 생산하는 합성 방법 (Haber-Bosch Process)이 개발되면서 농업 생산량의 비약적인 발전을 이루었지만, 인류로 인한 nitrogen pollutant들이 생태계로 과도하게 유입되고 있습니다. 이로 인해 토양, 강, 해양의 acidification이 발생하고, 온실가스인 nitrous oxide의 폭발적인 배출로 인한 기후변화가 가속화되고 있습니다.

  • Nat. Microbiol.
  • 2024.02.20

• • 이한송(부산대학교 의과대학)

    Interview

  • 박소희(인실리코젠)

  • 윤주현(아주대학교)

  • 김윤학(부산대학교)

  • 장전엽(아주대학교 의과대학)

  Deciphering head and neck cancer microenvironment: Single-cell and spatial transcriptomics reveals human papillomavirus-associated differences

  • J. Med. Virol. Jan 2024, 96 (1) | https://doi.org/10.1002/jmv.29386

  • 2024.01
  • 의약학
• 

  최승훈

  국가마우스표현형분석사업단, 서울대학교 수의과대학

  코로나19 팬데믹 발생으로 지난 2020년부터 많은 감염자와 사망자가 발생했습니다. 그로 인해 SARS-CoV-2와 관련된 다양한 연구들이 진행되었습니다. 하지만 기존의 코로나19와 관련된 연구는 주로 실제 염증조직이 아닌 환자의 PMBC에 중점을 둔 연구가 주로 진행되었거나, 햄스터 및 페럿 등의 기존 동물 모델에서는 실제 환자에서 나타나는 감염증세의 재현이 힘들다는 문제가 있었습니다.

  • EBioMedicine
  • 2024.01.19
• 

  구하림

  국립암센터/고려대학교

  교모세포종 (glioblastoma, GBM)은 가장 악성 종양 중의 하나로 다변적인 유전자 변이와 광범위한 종양 발생 생물 경로로 인하여, 매우 예후가 좋지 않은 뇌종양으로 알려져 있습니다. 타 암종보다 방사선 및 항암제의 치료에 대한 반응성이 낮아 치료가 어려우며, 재발의 빈도 매우 높습니다. 이와 같은 배경으로 교모세포종의 종단연구(Longitudinal analysis)의 중요성은 오래전부터 대두되어 왔으며, 2015년 외국에서는 Glioma Longitudinal AnalySiS(GLASS) 협의체가 구성되어 교모세포종 종단연구의 중요성을 강조해왔습니다.

  • Cancer Cell
  • 2024.01.18

• • 송슬기(서울대학교 의과대학, CNIO (Spanish National Cancer Research Center))

  • 고영일(서울대학교 의과대학, 서울대학교병원)

  • 김석현(서울대학교 의과대학)

  • 김현욱(KAIST)

  • 고정민(서울대학교 의과대학 소아청소년과)

  • 이세훈(성균관대학교 의과대학, 삼성서울병원)

  • 윤성수(서울대학교 의과대학, 서울대학교병원)

  • 박솔잎(CNIO (Spanish National Cancer Research Center))

  Systematic analysis of Mendelian disease-associated gene variants reveals new classes of cancer-predisposing genes

  • Genome Med. 2023 Dec 25;15(1):107

  • 2023.12
  • 바이오·의료융합

• • 조형훈(Broad Institute of MIT and Harvard, Yale School of Medicine)

  Reconstruction of private genomes through reference-based genotype imputation

  • Genome Biol. 06 December 2023 | https://doi.org/10.1186/s13059-023-03105-6

  • 2023.12

• • 맹주헌(Washington University in St. Louis)

  Using long-read CAGE sequencing to profile cryptic-promoter-derived transcripts and their contribution to the immunopeptidome

  • Genome Res. Dec 08 2023, | https://doi.org/10.1101/gr.277061.122

  • 2023.12