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1Exoribonuclease

'Exoribonuclease' 에 대한 통합검색결과 14건입니다.

한빛사14건

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- 김완태(University of Texas, Austin)
Selective 8-oxo-rG stalling occurs in the catalytic core of polynucleotide phosphorylase (PNPase) during degradation
- Proc. Natl. Acad. Sci. USA Nov 12 2024, 121 (46) | https://doi.org/10.1073/pnas.2317865121
- 2024.11
- 생명과학
Crosstalk between PARN and EGFR-STAT3 Signaling Facilitates Self-Renewal and Proliferation of Glioblastoma Stem Cells.
- Cancer Res. Sep 25 2023 | https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-22-3965
- 2023.09
- 생명과학
- 이현지(GIST)
  Interview
- 이광록(GIST)
RNase H is an exo- and endoribonuclease with asymmetric directionality, depending on the binding mode to the structural variants of RNA:DNA hybrids
- Nucleic Acids Res. Published: 12 November 2021 | https://doi.org/10.1093/nar/gkab1064
- 2021.11
- 생명과학
- 임정현(전북대학교, Columbia University)
Noncoding RNA processing by DIS3 regulates chromosomal architecture and somatic hypermutation in B cells
- Nat. Genet. Published: 01 February 2021 | https://doi.org/10.1038/s41588-020-00772-0
- 2021.02
- 허두원(The Rockefeller University)
A stress?induced tyrosine?tRNA depletion response mediates codon?based translational repression and growth suppression
- EMBO J. 21 December 2020, e106696 | https://doi.org/10.15252/embj.2020106696
- 2020.12
이준희

KAIST

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 알코올성 간질환은 지방간에서 간암에 이르기까지 다양한 스펙트럼을 가지는 질환으로 전세계적으로 만성간질환의 가장 흔한 원인으로 알려져 있고, 알코올성 간염, 간경화, 간암으로 진행되어 morbidity와 mortality를 유발할 수 있는 중요한 질환으로 우리나라는 과거에 비해 점차 증가 추세에 있는 최근 각광 받고 있는 질환이기도 합니다. 알코올성 간질환의 발생 기전은 다양한 Risk factor와 다양한 원인이 존재해 아직까지 제대로 된 발생 기전이 알려져 있지 않습니다. 특히 간질환의 초기 단계인 지방간에서 간섬유화 단계는 비가역적이 아닌 가역적인 단계로 이 시기에 제대로 된 치료가 무엇보다 중요합니다. 저희 연구팀은 알코올성 간질환의 급성기 모델인 만취 모델(Binge drinking model)을 이용해 초기 알코올성 지방간의 발생기전을 밝히고자 연구를 진행했습니다. 급성기 알코올성 지방간은 간내 대식세포인 Kupffer cell의 Toll-like receptor 3(TLR3)를 통해 염증성 cytokine인 Interleukin-1β를 분비하게 되고 염증성 면역반응을 통해 지방간이 발생하게 된다고 보고되고 있고 TLR3의 ligand인 double-stranded RNA(dsRNA)는 주로 바이러스 감염에 의한 것으로 알려져 있었지만, 알코올 섭취와 같은 비감염성 질환에서 미토콘드리아 유래 dsRNA가 TLR3의 self-ligand가 될 수 있음을 본 연구를 통해 새롭게? 밝혀냈습니다. 미토콘드리아의 DNA는 prokaryote의 특징을 가지는 plasmid 형태의 DNA로 bidirectional transcription을 통해 dsRNA가 형성될 여지가 생기는데, 정상상태에서는 발생되는 mitochondrial dsRNA(mtdsRNA)가 세포에 해(害)가 되기 때문에, helicase나 exonuclease에 의해 분해됩니다. 하지만 폭음(Binge drinking) 시, 3' to 5' exoribonuclease인 Polynucleotide phosphorylase(PNPase)가 억제되어 세포 내 mtdsRNA가 축적이 되고, 축적된 dsRNA가 간세포 유래 exosome을 통해 인접한 Kupffer cell내로 전달되어 TLR3의 self-ligand가 됨을 확인했습니다. 이를 통해 급성기 알코올성 간질환의 치료 시 mtdsRNA와 exosome이 치료타겟이 될 수 있고, 더 나아가 알코올성 간질환 뿐만 아니라 주로 선천면역이 관여하는 자가면역성 질환에도 적용이 될 수 있는 미토콘드리아 DNA 유래 dsRNA가 TLR3의 self-ligand가
- Hepatology
- 2019.12.27
- 손동주(Georgia Institute of Technology and Emory University)
- 조한중(이화여자대학교, Emory University and Georgia Institute of Technology)
The atypical mechanosensitive microRNA-712 derived from pre-ribosomal RNA induces endothelial inflammation and atherosclerosis
- Nat. Commun. 4, Article number: 3000, Published online:18 December 2013, doi: 10.1038/ncomms4000
- 2013.12
- 의약학
- 손동주(Georgia Institute of Technology and Emory University)
- 조한중(이화여자대학교, Emory University and Georgia Institute of Technology)
The atypical mechanosensitive microRNA-712 derived from pre-ribosomal RNA induces endothelial inflammation and atherosclerosis
- Nat. Commun. 4, Article number: 3000, Published online:18 December 2013, doi: 10.1038/ncomms4000
- 2013.12
- 의약학
- 장정호(Columbia University, 현 대구대학교)
A Mammalian Pre-mRNA 5 End Capping Quality Control Mechanism and an Unexpected Link of Capping to Pre-mRNA Processing
- Mol. Cell Volume 50, Issue 1, 104-115, 21 March 2013| 10.1016/j.molcel.2013.02.017
- 2013.03
- 장정호(Columbia University)
  Interview
Dxo1 is a new type of eukaryotic enzyme with both decapping and 5′-3′ exoribonuclease activity
- Nat. Struct. Mol. Biol. 19, 1011–1017 (2012) | Published online 09 September 2012 | doi:10.1038/nsmb.2381
- 2012.09
장정호

Columbia University

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 이번 논문에서 중점적으로 다룬 내용은 mRNA의 5'-end capping quality control에 관련된 단백질의 분자 구조와 새로운 활성의 발견에 관한 것입니다. 진핵 세포내 mRNA의 post-transcriptional modification 과정의 하나인 5'-end capping(5' end에 methylated guanine을 5'-5' 형태로 붙여 주는 과정)에 대해서는 기초 연구가 상당히 진행되었습니다. 하지만 이러한 과정에서 발생하는 error나 incomplete cap에 대한 세포내 처리 과정에 대해서는 아직도 많은 연구가 진행중입니다. 정상 세포와 다르게 nutritional stress에 처한 세포에서는 5' capping이 완벽하게 끝나지 않아 생긴 불완전한 cap, 즉 unmethylated cap이나 triphosphate 등의 중간체들이 생겨나는데 이러한 미숙한 mRNA는 재빨리 제거되어야 세포의 정상적인 활동이 유지될 수 있습니다. 제가 이곳에 join하기 전에 Rai1이라는 단백질이 이러한 unmethylated cap, 또는 triphosphated 5'-end를 인식해서 제거해주는 역할을 한다고 보고가 되었고, 이번에 제가 한 실험에서는 그 유사 단백질로 추정되었지만 전혀 연구가 안된 YDR370C가 unmethylated cap외에 정상적인 methylated cap도 제거해주는 활성을 지님을 발견했습니다. 더우기 이러한 작용이 심지어 정상 세포에서도 발견됨을 통해 5'-end capping은 어느 세포에서든 항상 완벽하게 진행되지 않고 quality control이 반드시 필요함을 밝혔습니다. 그리고 이번 연구의 또 다른 하이라이트는 이 단백질이 비단 5'-cap 뿐 아니라 mRNA 자체를 제거하는 5'-3' exoribonuclease 활성을 함께 지니고 있는 dual nuclease 라는 사실을 최초로 발견한 것입니다. 사실 이 활성은 다른 nuclease로 실험을 수행하는 중에 이 단백질을 negative control로 쓴 것이 오히려 가장 큰 활성을 보여 우연히 발견하게 된 것입니다. 그래서 yeast genetics를 통해 systematic하게 붙여졌던 YDR370C대신 Decapping exonuclease 1 이라는 의미로 새롭게 Dxo1이라고 이름을 부여하게 되었습니다. 처음에 이 프로젝트를 시작할 때는 Rai1과 유사한 단백질이라 큰 기대를 하지 않았고, 심지어 많은 노력을 들여 분자 구조를 얻었지만 예상했던대로 Rai1과 너무 유사해서 간단하게 마무리하려고 했었는데, 의외의 활성을 발견하면서, 공동 연구를 통한 in vivo study까지
- Nat. Struct. Mol. Biol.
- 2012.09.17
- 이광록(광주과학기술원, University of Illinois at Urbana-Champaign)
- 하택집(University of Illinois, Urbana-Champaign,Howard Hughes Medical Institute)
Elastic Coupling Between RNA Degradation and Unwinding by an Exoribonuclease
- Science Vol. 336 no. 6089 pp. 1726-1729, 29 June 2012 | DOI: 10.1126/science.1216848
- 2012.06
- 생명과학
- 장정호(Columbia University)
Structural and biochemical studies of the 5′→3′ exoribonuclease Xrn1
- Nat. Struct. Mol. Biol. 18, 270-276 (2011) | doi:10.1038/nsmb.1984
- 2011.02
- 김병훈(The University of Tennessee)
FIERY1 regulates light-mediated repression of cell elongation and flowering time via its 3‘(2‘),5‘-bisphosphate nucleotidase activity
- Plant J. Volume 58 Issue 2, Pages 208 - 219
- 2009.04

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