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1Enhancer reprogramming

'Enhancer reprogramming' 에 대한 통합검색결과 13건입니다.

한빛사13건

- 유성용(Cedars-Sinai Medical Center)
ONECUT2 acts as a lineage plasticity driver in adenocarcinoma as well as neuroendocrine variants of prostate cancer
- Nucleic Acids Res. Jun 27 2024, gkae547 | https://doi.org/10.1093/nar/gkae547
- 2024.06
- 생명과학
- 김효민(POSTECH)
  Interview
- 노태영(이화여자대학교)
Forkhead box protein D2 suppresses colorectal cancer by reprogramming enhancer interactions
- Nucleic Acids Res. 2023 May 9;gkad361 | https://doi.org/10.1093/nar/gkad361
- 2023.05
- 생명과학
김효민

POSTECH

후생유전학 연구는 기본적으로 DNA 서열을 변경하지 않고 유전자 발현의 가역적 변화가 어떻게 발생하는지 이해하는 데 중점을 둡니다. 더 나아가, 조직 내에서 성체 줄기 세포의 운명과 분화를 지배하는 후생유전학적 변형을 조사함으로써 암의 발달과 진행에 대한 중요한 단서를 발견할 수도 있습니다. 이 접근 방법은 주요 분자기전과 잠재적인 치료 표적을 식별할 수 있는 가능성을 가지고 있습니다.
- Nucleic Acids Res.
- 2023.05.26
- 양보배(연세대학교 의과대학)
- 김형표(연세대학교 의과대학)
CTCF controls three-dimensional enhancer network underlying the inflammatory response of bone marrow-derived dendritic cells
- Nat. Commun. 2023 Mar 8;14(1):1277 | https://doi.org/10.1038/s41467-023-36948-5
- 2023.03
- 생명과학
A TEAD2-driven endothelial-like program shapes basal-like differentiation and metastasis of pancreatic cancer
- Gastroenterology Published: March 10, 2023 | https://doi.org/10.1053/j.gastro.2023.02.049
- 2023.03
- 생명과학
유혜빈

연세대학교

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 ?췌장암은 암 중에서도 진단 이후 평균 생존 기간이 1년 정도밖에 되지 않는 치명적인 질병입니다. 현재 췌장암 치료는 수술에 의한 물리적 절제와 화학 요법에 의한 치료에 의존하고 있는데요. 이러한 치료법은 치료제에 대한 저항성과 암의 재발이 빠르게 증가하는 등 제한적인 효과를 나타내기 때문에, 새로운 접근의 치료법 개발이 필요합니다. 또한, 췌장암 환자는 유전자 발현 양상에 따라서 classical과 basal-like subtype으로 나뉘는데, 그 중에서도 basal-like subtype의 환자들은 치료제 저항성을 더 많이 나타내고 암 전이가 높아서 환자의 예후가 좋지 않습니다. 환자 맞춤형 치료가 대두되고 있는 최근 동향에 따르면, 췌장암에서 subtype 연구는 암치료에서 매우 중요한 부분입니다. 다만 실제 인간 세포주 및 환자들의 경우에는 매우 다양한 유전자 발현 양상을 띄기 때문에 subtype을 명확히 구분하는 것은 현실적으로 어려움이 있고, 이러한 이유로 아직까지 subtype에 대한 깊은 연구가 부족한 실정입니다. ?저희는 이러한 문제를 해결하기 위해 다양한 세포주들을 이용하여 균일하게 basal-like subtype으로 변환시킨 뒤 다양한 실험들을 진행할 수 있도록 ‘세포주 변환 모델 (molecular subtype conversion model)‘을 확립하였습니다. 변환된 암세포들은 비부착성 성장, 이동 능력 등에서 더 공격적인 특성을 띄었고 마우스 실험에서도 암전이가 더 잘 일어나는 것을 확인했습니다. 또한, 차세대 염기서열 분석 (NGS, Next Generation Sequencing)을 통해 basal-like subtype으로의 변환이 크로마틴 및 유전자 발현 변화에 의한 것이며, TEAD2가 특정 인핸서 지역을 활성화시킴으로써 basal-like subtype을 유지한다는 것을 증명하였습니다. 더 나아가서, TEAD2와 함께 CD109-JAK-STAT 경로를 활용하여 basal-like 암세포들이 생존하고 전이하는 데에 기여한다는 것을 밝혔습니다. ?위 연구를 통해 basal-like subtype을 유지하는 TEAD2-CD109-JAK-STAT 경로와 기전을 새롭게 밝혔고, 이는 실제 췌장암 환자에서 subtype을 진단할 수 있는 바이오마커 및 subtype에 따른 환자 맞춤형 치료에 기여할 것으로 기대됩니다. ? ? ? 그림 1. Subtype conversion model에 의해 reprogramming된 Basal-like 암세포의 특성
- Gastroenterology
- 2023.03.20
Elongated nanoporous Au networks improve somatic cell direct conversion into induced dopaminergic neurons for Parkinson‘s disease therapy
- Acta Biomater. Volume 151, 1 October 2022, Pages 561-575 | https://doi.org/10.1016/j.actbio.2022.07.058
- 2022.10
- 의약학
- 고성진(University of Pittsburgh)
NOTCH-YAP1/TEAD-DNMT1 axis drives hepatocyte reprogramming into intrahepatic cholangiocarcinoma
- Gastroenterology Available online 10 May 2022 | https://doi.org/10.1053/j.gastro.2022.05.007
- 2022.05
Creation of bladder assembloids mimicking tissue regeneration and cancer
- Nature Published: 16 December 2020 | https://doi.org/10.1038/s41586-020-3034-x
- 2020.12
- 생명과학
- 김윤정(University of Texas at Dallas)
- 김태훈(University of Texas at Dallas)
Global transcriptional activity dynamics reveal functional enhancer RNAs
- Genome Res. Published in Advance October 23, 2018 | doi: 10.1101/gr.233486.117
- 2018.10
- 노재석(Cold Spring Harbor Laboratory)
  Interview
- 황창일(Cold Spring Harbor Laboratory, Lustgarten Foundation Pancreatic Cancer Research Laboratory)
Enhancer Reprogramming Promotes Pancreatic Cancer Metastasis
- Cell Available online 27 July 2017 | https://doi.org/10.1016/j.cell.2017.07.007
- 2017.07
- 생명과학
노재석

Cold Spring Harbor Laboratory

1. 논문 관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명 본 논문에서 다룬 췌장암 (pancreatic cancer) 은 조기 진단에 어려움이 있고, 또 현재까지 치료방법 또한 다른 암들에 비해 상대적으로 제한되어 있는 대표적인 유전성 암입니다. 약 10 여년 전 췌장암 동물 모델이 처음 만들어진 후 현재까지 많은 연구들이 이루어져왔고, 또 향후 보다 나은 치료를 위한 수많은 기초 지식들이 제공되어 왔습니다. 반면, 췌장암이 전이되는 (metastasize) 원인 및 기작에 대한 이해는 상대적으로 제한되어 왔는데 그 대표적인 이유로는 췌장암 전이를 연구할 수 있는 적절한 실험 모델이 없었기 때문입니다. 하지만 2015 년 저희 연구소 David Tuveson 연구팀에 의해 소개된 pancreatic organoids culture 로 인해 (Boj and Hwang et al., Cell, 2015) 정상 췌장세포부터 말기 전이과정까지 전 과정의 세포를 in vitro 에서 배양하는 방법이 개발되고, 이를 바탕으로 생화학/분자생물학적으로 살펴 볼 수 있는 획기적인 계기가 마련되었습니다. 본 논문이 발표된 직후, 이전 연구를 주도하였던 황창일 박사님과 cancer epigenetics 를 연구하는 제가 공동 연구를 시작하였고, 약 2 년간의 공동 연구 끝에 지금 췌장암 전이를 설명하는 후성 유전학적인 변이 (epigenetic alteration) 를 본 논문에 소개할 수 있게 되었습니다. 이로 말미암아, 그동안 유전성 질환으로만 여겨지던 췌장암을 후성 유전학적인 질환으로도 살피게 되고, 나아가서는 현재 각광받는 epigenetic therapy 의 임상적인 응용을 타진해 볼 수 있는 계기가 되었으면 좋겠습니다. 2. 연구과정에서 생긴 에피소드 월드컵 열기가 한창이던 2002 년 학부 4 학년에 재학중이던 저는 서울의대 박웅양 교수님 실험실에 학부생 연구원으로 있었고 당시 황창일 박사님은 동 실험실에 석사 2 년차 과정에 계셨습니다. 저는 실험실에서 실험을 제외한 모든 활동. 농구, 회식등-에 약 6 개월 여간 적극적으로 참여하였고, 연구에 별 도움이 되지는 못했습니다. 이후 황창일 박사님은 미국에서 학위를 이어 가셨고 저 역시 석사/박사 학위를 동대학 윤홍덕 교수님 실험실에서 마쳤기에 약 10 여년간 그렇게 각자의 길을 태평양 건너에서 걷고 있었습니다. 우연히도 2012 년 저희가 이곳 Cold Spring Harbor Lab 에서 각자 다른 랩에서 Post-doc 을 시작하게 되었는데, ‘하필이면’ 같은 건물/같
- Cell
- 2017.07.31
- 김유리(University of Texas Southwestern Medical Center)
The MEF2D transcription factor mediates stress-dependent cardiac remodeling in mice
- J. Clin. Invest. Published December 13, 2007
- 2007.12

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