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1Cancer epigenetics

'Cancer epigenetics' 에 대한 통합검색결과 79건입니다.

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김재범

서울대학교

오토파지는 영양 결핍, 감염, 노화, 암, 퇴행성 신경질환과 같은 신호에 반응하여 세포가 생존하고 항상성을 유지하는 데 필요한 필수적인 기작입니다. 세포가 영양 결핍 상태에 놓이면 오토파지를 통해 불필요한 구성 요소와 소기관을 분해하여 필요한 에너지원으로 재활용하고, 이를 통해 세포는 다양한 스트레스 상황을 극복할 수 있게 됩니다. 오토파지는 빠르게 스트레스에 대응하는 기작으로 알려져 있어, 지금까지 대부분의 연구는 세포질 내에서 오토파지 관련 단백질들이 어떻게 결합하고 작용하는지에 초점을 맞추어 왔습니다.
- Nat. Commun.
- 2024.10.18
- 심홍석(The University of Texas MD Anderson Cancer Center)
TERT activation targets DNA methylation and multiple aging hallmarks
- Cell Available online 21 June 2024 | https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.05.048
- 2024.06
- 김경현(University of Arkansas Medical Sciences)
The Loss of an Orphan Nuclear Receptor NR2E3 Augments Wnt/β-catenin Signaling via Epigenetic Dysregulation that Enhances Sp1-β catenin-p300 Interact
- Adv. Sci. May 24 2024, | https://doi.org/10.1002/advs.202308539
- 2024.05
- 정진규(Weill Cornell Medicine)
The potency of hematopoietic stem cell reprogramming for changing immune tone
- Immunol. Rev. Apr 17 2024, | https://doi.org/10.1111/imr.13335
- 2024.04
- 생명과학
- 안용진(서울대학교)
- 박성혁(서울대학교)
Lactate as a major epigenetic carbon source for histone acetylation via nuclear LDH metabolism
- Exp. Mol. Med. 02 October 2023 | https://doi.org/10.1038/s12276-023-01095-w
- 2023.10
- 생명과학
이주미

인제대학교 의과대학

후성유전학의 대표적인 기전으로 유전자의 프로모터에서 DNA hypermethylation (과메틸화)에 의한 유전자 발현 억제 (Gene silencing)은 이제는 암발생의 hallmarker입니다. 따라서, 주요 암억제유전자 (Tumor suppressor gene)들이 과메틸화(hypermethylation)에 의해 발현이 저해되어 암발생이 유도되는 연구가 많이 보고 되었습니다.
- EMBO Rep.
- 2023.06.29
- 황인아(Weill Cornell Medicine, 이화여자대학교)
- 백지혜(Weill Cornell Medicine)
Histone demethylase KDM2A is a selective vulnerability of cancers relying on alternative telomere maintenance
- Nat. Commun. Published: 29 March 2023;14;1756 | https://doi.org/10.1038/s41467-023-37480-2
- 2023.03
- 의약학
유혜빈

연세대학교

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 ?췌장암은 암 중에서도 진단 이후 평균 생존 기간이 1년 정도밖에 되지 않는 치명적인 질병입니다. 현재 췌장암 치료는 수술에 의한 물리적 절제와 화학 요법에 의한 치료에 의존하고 있는데요. 이러한 치료법은 치료제에 대한 저항성과 암의 재발이 빠르게 증가하는 등 제한적인 효과를 나타내기 때문에, 새로운 접근의 치료법 개발이 필요합니다. 또한, 췌장암 환자는 유전자 발현 양상에 따라서 classical과 basal-like subtype으로 나뉘는데, 그 중에서도 basal-like subtype의 환자들은 치료제 저항성을 더 많이 나타내고 암 전이가 높아서 환자의 예후가 좋지 않습니다. 환자 맞춤형 치료가 대두되고 있는 최근 동향에 따르면, 췌장암에서 subtype 연구는 암치료에서 매우 중요한 부분입니다. 다만 실제 인간 세포주 및 환자들의 경우에는 매우 다양한 유전자 발현 양상을 띄기 때문에 subtype을 명확히 구분하는 것은 현실적으로 어려움이 있고, 이러한 이유로 아직까지 subtype에 대한 깊은 연구가 부족한 실정입니다. ?저희는 이러한 문제를 해결하기 위해 다양한 세포주들을 이용하여 균일하게 basal-like subtype으로 변환시킨 뒤 다양한 실험들을 진행할 수 있도록 ‘세포주 변환 모델 (molecular subtype conversion model)‘을 확립하였습니다. 변환된 암세포들은 비부착성 성장, 이동 능력 등에서 더 공격적인 특성을 띄었고 마우스 실험에서도 암전이가 더 잘 일어나는 것을 확인했습니다. 또한, 차세대 염기서열 분석 (NGS, Next Generation Sequencing)을 통해 basal-like subtype으로의 변환이 크로마틴 및 유전자 발현 변화에 의한 것이며, TEAD2가 특정 인핸서 지역을 활성화시킴으로써 basal-like subtype을 유지한다는 것을 증명하였습니다. 더 나아가서, TEAD2와 함께 CD109-JAK-STAT 경로를 활용하여 basal-like 암세포들이 생존하고 전이하는 데에 기여한다는 것을 밝혔습니다. ?위 연구를 통해 basal-like subtype을 유지하는 TEAD2-CD109-JAK-STAT 경로와 기전을 새롭게 밝혔고, 이는 실제 췌장암 환자에서 subtype을 진단할 수 있는 바이오마커 및 subtype에 따른 환자 맞춤형 치료에 기여할 것으로 기대됩니다. ? ? ? 그림 1. Subtype conversion model에 의해 reprogramming된 Basal-like 암세포의 특성
- Gastroenterology
- 2023.03.20
- 송난(St. Jude Children's Research Hospital, 충북대학교)
Social-epigenetic mediators for racial disparities in pulmonary impairment among childhood cancer survivors.
- Cancer Commun. 2023 Feb;43(2):290-293 | https://doi.org/10.1002/cac2.12371
- 2023.02
- 의약학
- 김민욱(University of Pittsburgh)
- 고성진(University of Pittsburgh)
DNA methylation in cell plasticity and malignant transformation in liver diseases
- Pharmacol. Ther. Available online 17 December 2022 | https://doi.org/10.1016/j.pharmthera.2022.108334
- 2022.12
- 의약학
허해정

한국생명공학연구원

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 암으로 이한 사망률 1위인 폐암의 85%는 비소세포폐암입니다. 그 중 ALK 변이를 가진 환자는 약 3.7%이며 비흡연자 그리고 젊은 연령대에서 발견되는 특징이 있습니다. ALK 표적치료제는 현재 3세대까지 개발되어 임상에서 활용되고 있으나, 치료 1-2년 이내에 내성이 발생하는 문제점이 있습니다. 내성 발생의 원인으로 2차 돌연변이 발생, 등이 보고되고 있으나, 아직 내성 기전이 완전히 밝혀지지 않았습니다. 본 연구에서 단일 세포 전사체와 DNA 메틸롬 분석을 통해 내성 획득 원인으로 시티딘 탈아미노 효소 (Cytidine deaminase, CDA)의 활성화를 규명하였습니다. 내성 세포에서 후성유전학적으로 발생한 DNA의 탈메틸화는 CDA 발현을 증가시킵니다. CDA는 피리미딘 회수 경로의 효소이며, 암세포는 빠른 증식을 위해 분해과정에서 생성된 염기와 뉴클레오시드를 재활용하는 회수 경로를 이용할 수 있습니다. CDA 발현이 높은 내성 세포는 빠르게 증식했을 뿐만 아니라, 전이를 조절하는 전사인자의 활성으로 인해 암세포의 이동성과 침윤성이 높아져 전이를 촉진하는 결과를 나타냈습니다. CDA를 경쟁적 억제제를 이용해 저해하거나, 뉴클레오시드 후성 유전적 변이체인 5-formyl-2′-deoxycytidine를 이용하여 내성 세포의 사멸을 선택적으로 유도하는 새로운 치료법을 제안했습니다. 이번 연구는 ALK 변이를 가진 비소세포폐암 환자가 ALK 표적 치료제에 대해 내성을 가졌을 때 새로운 치료법으로 활용될 수 있을 것으로 기대됩니다. 본 연구는 2022년 8월 23일 Experimental and Molecular Medicine 저널에 게재되었습니다. 2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다. 본 연구는 한국과학기술연합대학원대학교 (UST) 박사과정 대학원생이자 한국생명공학연구원 (KRIBB)의 연구생으로 재직하며 수행되었습니다. 제가 몸 담았던 한국생명공학연구원 노화융합연구단 김미랑 박사님 실험실은 폐암, 위암을 포함한 여러 암종과 지방간질환의 바이오마커 및 치료 기술 개발을 위해 후성유전학적 및 분자생물학적 관점에서 연구를 하고 있습니다. 기전을 밝히기 위한 in vitro, in vivo 실험부터 다중 오믹스 분석까지 다양한 방면으로 연구를 진행하고 있습니다. 대전 대덕연구단지에 위치한 한국생명공학연구원
- Exp. Mol. Med.
- 2022.10.19
- 정윤희(German Cancer Research Center (DKFZ))
Systematic evaluation of cell-type deconvolution pipelines for sequencing-based bulk DNA methylomes
- Brief. Bioinform. 2022 Jul 18;23(4):bbac248 | https://doi.org/10.1093/bib/bbac248
- 2022.07
- 김화진(성균관대학교)
  Interview
- 김정훈(성균관대학교)
DBC1 is a key positive regulator of enhancer epigenomic writers KMT2D and p300
- Nucleic Acids Res. Published: 08 July 2022 | https://doi.org/10.1093/nar/gkac585
- 2022.07
- 생명과학
- 고성진(University of Pittsburgh)
NOTCH-YAP1/TEAD-DNMT1 axis drives hepatocyte reprogramming into intrahepatic cholangiocarcinoma
- Gastroenterology Available online 10 May 2022 | https://doi.org/10.1053/j.gastro.2022.05.007
- 2022.05
- 정찬(DGIST)
Targeting integrated epigenetic and metabolic pathways in lethal childhood PFA ependymomas
- Sci. Transl. Med. 6 Oct 2021, Vol 13, Issue 614 | DOI: 10.1126/scitranslmed.abc0497
- 2021.10
- 생명과학
김대환

Oregon Health and Science University, 현 전남대학교 면역치료혁신센터

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 전립선암은 한국남성에게 5번째로 흔하게 발생하는 암종으로 초기에 발견하여 제거할 경우 95% 이상의 완치율을 보이며, 종양의 성장에 호르몬의 하나인 Androgen이 필요하다는 것이 발견된 이후 근 80년 동안 체내 Androgen을 제거하는 호르몬 박탈 요법이 전립선암의 재발을 막는 치료의 핵심을 이루고 있으며 미국의 경우는 전립선암이 성인 남성에게 가장 빈번하게 발생하는 암종으로 활발하고 연구되고 있습니다. 전립선암 환자의 생존가능기간은 Androgen의 생산이나 그 세포내 활성을 차단하는 약물들(apalutamide, abiraterone, enzalutamide)에 의해 상당기간 연장되었지만 결국 이러한 약물들도 악성화의 진행을 막는 효과가 사라지게 되는 경우가 발생하며 그 시점에서 환자의 질병은 치료 불가능한 전이성 거세저항성 전립선암으로 간주되게 됩니다. 이 전이성 거세저항성 전립선암의 경우 암세포가 전립선조직에만 머물러 있지 않아 혈관이나 림프관을 통해 다른 장기로 전이되며 주로 골수나 림프샘에서 빈번하게 발견됩니다. 그 중에서도 종양내에 신경세포에서 발현되는 유전자군이 많이 발현되는 경우는 암세포의 기원이었던 전립선 선암(adenocarcinoma) 리니지에서 어떻게 신경내분비(neuroendocrine prostate cancer, NEPC) 세포로 재프로그램화(lineage plasticity)가 일어나는지 그 기전을 규명하는데 초점을 두고 연구되고 있습니다. Staff scientist로 재직했던 OHSU Knight cancer institute에서 저희 팀이 세웠던 가설은 평상시에 Androgen receptor가 저해하고 있던 어떤 전사인자가 Enzalutamide와 같은 강력한 저해제의 투약으로 차츰 활성화가 가능해지고 이에 따라 신경세포에서 발현되는 유전자들이 점차 증가되는게 아닐까 하는 것이었습니다. 이를 검증하기 위해 먼저 Enzalutamide를 지속적으로 투여하여 Androgen receptor가 잘 저해되어도 생존이 가능한 세포주에서 신경세포 분화를 나타내는 지표들이 증가하는지를 추적하였고, 이러한 양상을 보이는 몇몇 세포주의 RNA-seq을 통해 특징적인 전사체의 변화를 관찰하였습니다. 이 결과로 Enzalutamide 저항성을 획득함과 동시에 신경내분비 세포로의 재프로그램화를 조절할 가능성이 있는 전사인자로 E2F1를 지목할 수 있었습니다. 흥미롭게도 기존에 발표된 거세 저
- Clin. Cancer Res.
- 2021.07.13
- 이현욱(New York University)
Epithelial-mesenchymal transition: Insights into nickel-induced lung diseases
- Semin. Cancer Biol. Available online 29 May 2021 | https://doi.org/10.1016/j.semcancer.2021.05.020
- 2021.05
- 이재은(KAIST)
- 김미영(KAIST)
Cancer epigenetics: past, present and future
- Semin. Cancer Biol. Available online 31 March 2021 | https://doi.org/10.1016/j.semcancer.2021.03.025
- 2021.03
Coordinated Methyl Readers: Functional Communications in Cancer
- Semin. Cancer Biol. Available online 19 March 2021 | https://doi.org/10.1016/j.semcancer.2021.03.015
- 2021.03
- 의약학
- 정찬(University of Michigan)
  Interview
Integrated Metabolic and Epigenomic Reprograming by H3K27M Mutations in Diffuse Intrinsic Pontine Gliomas
- Cancer Cell Available online 13 August 2020 | https://doi.org/10.1016/j.ccell.2020.07.008
- 2020.08
- 생명과학