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연재 [당신의 논문 동료] 다양한 public database (HPA, GTEx…) 소개부터 활용까지
앞선 글에서 GWAS 데이터포털인 CMDKP, T2DP 및 Genebass를 소개해드렸습니다. 본 글은 이 포털 이외에 제가 사용하거나 알고 있는 여러 데이터 포털 중 Human Protein Atlas와 GTEx를 상세히 소개해드리고자, 나머지 데이터베이스도 간단히 언급하고자 합니다. 제가 어떤 유전자에 대해 공부하겠다는 마음이 들었을 때 가장 먼저 들어가 보는 사이트입니다. 처음에는 사람에서 특정 유전자의 조직별 발현량과 세포 내 위치 정보(안티바디 기반)를 알려주는 사이트로 유명했는데, 이제는 정말 여러 유용한 정보를 제공하는 정보 포털로 자리매김했다고 생각합니다. 당신의 논문 동료 -
연재 [실전 실험 프로토콜 101] #20. MBP 퓨전 단백질 시스템을 이용한 결합 단백질 찾기
타깃 단백질의 기능 중 타깃 단백질의 특정 지역에 어떤 단백질이 결합하여, 타깃 단백질의 특정 기능을 조절하는 타깃 결합 단백질을 찾는 방법에 대해 알아보겠습니다. 타깃 단백질의 특정 지역을 pMAL 벡터의 maltose-binding protein (MBP) 다운 스트림에 넣어서 MBP 퓨전 발현 벡터를 만듭니다 (노트 1, 출처 1). 이 발현 벡터를 박테리아에 넣어서 MBP 퓨전 단백질을 발현시킵니다. 퓨전 단백질의 발현을 확인한 다음, 이 과발현 단백질을 Amylose resin과 인큐베이션 (incubation)해서 발현 단백질만 따로 추출합니다 (노트 2). MBP 퓨전 단백질의 컨트롤로 MBP만 들어있는 단백질을 추출합니다. 실전 실험 프로토콜 101 -
2022년 11월 18일 테라노스의 창업자이자 최고 경영자인 엘리자베스 홈즈(Elizabeth Holmes)는 사기죄로 징역 11년 3개월을 선고받았다. 스탠퍼드 출신이며 한때 기업가치 90억 달러 (한화 12조 원)에 달하는 테라노스의 창업자이자 포브스, 포츈지 등 최고의 저널의 표지를 장식했던 그녀는 어쩌다 몰락했을까? 이 책을 소개하는 이유는 바이오텍 창업자를 포함하여 바이오산업에서 종사하는 모두에게 각각에게 주는 교훈이 있기 때문이다. 창업자에게는 욕망과 열정이 어떻게 타락의 길로 이끄는지를 모여주는 반면교사가 되고 직원에게는 자신이 헌신해야 하는 기업의 가치를 어떻게 알아보는지를 알려주기 때문이다. 김박사의 책장
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연구성과 어릴 때 학대 트라우마 생기면 ‘조현병’ 등 정신질환 위험 커져
어릴 적 신체적·정신적·성적으로 학대 또는 피해를 받아 트라우마(심리적 상처)가 생긴 사람은 조현병 같은 중증 정신병 위험을 높인다는 연구 결과가 나왔다. 분당서울대병원 정신건강의학과 김의태 교수팀은 한국, 영국에서 모집한 2700여명을 대상으로 한 대규모 공동 연구에서 이같은 결과가 확인됐다고 지난 22일 밝혔다. 이번 연구 결과는 국제 정신과학 학술지인 ‘랜싯 정신과학(Lancet Psychiatry)’ 최신 호에 발표됐다. 동아일보 | Lancet Psychiatry -
연구성과 임신성 당뇨병력에 현재 비알코올성 지방간까지 있으면 2형 당뇨병 위험 6배 높아
임신성 당뇨 병력이 있었던 여성이 현재 비알코올성 지방간이 있으면 제2형 당뇨병 발생위험이 최고 6배 이상 높아진다는 연구 결과가 나왔다. 성균관의대 강북삼성병원 서울건진센터 조유선 교수, 데이터관리센터 류승호, 장유수 교수 연구팀은 2015년~2019년 사이에 건강검진을 받은 성인 여성 중 출산력이 있는 여성 14만여 명을 3.9년간 추적 관찰한 결과 이같이 나왔다고 밝혔다. 세계일보 | European journal of epidemiology