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기업웨비나 다양한 시료부터 High-Content 촬영까지, HT-X1 Plus로 확장하는 바이오이미징의 세계 [토모큐브] 비표지(label-free) 상태에서 살아있는 시료의 3차원 이미징을 가능하게 하는 홀로토모그래피 현미경은 다양한 생명과학 연구 분야에서 필수적인 도구로 자리 잡고 있습니다. 토모큐브는 2022년 런칭한 HT-X1을 통해 다양한 세포 연구를 지원해왔으며, 연구자들은 세포뿐만 아니라 오가노이드, 생조직, 식물, 미생물 등 다양한 시료에 대한 고품질 이미징의 필요성을 느끼고 있습니다. 이번 웨비나에서는 2024년 10월 출시되는 HT-X1 Plus를 소개하며, 이를 활용한 다양한 연구 가능성에 대해 논의할 예정입니다. HT-X1 Plus는 고속, 고효율 이미징 기능을 제공하며, 기존 연구의 한계를 넘어 더욱 폭넓은 바이오 이미징을 가능하게 합니다. 핵심 내용: √ 3차원 비표지 이미징 원리: 살아있는 비고정 시료에 대한 홀로토모그래피 원리와 응용 √ 96 well plate 연구 사례: HT-X1 Plus를 사용한 high-content imaging 연구 사례 소개 √ 다양한 시료 이미징: 동물 세포, 조직, 오가노이드, 식물, 미생물 등 다양한 시료의 영상화 방법 √ 타임랩스 실험 설정: HT-X1 Plus로 타임랩스 이미징 실험을 설정하고 활용하는 방법 본 웨비나는 HT-X1 Plus가 연구의 복잡성을 줄이고, 다양한 생명과학 어플리케이션에서 보다 효율적으로 바이오 이미징을 수행할 수 있도록 돕는 방법을 제시합니다. 기초 연구에서부터 high-content imaging에 이르기까지 HT-X1 Plus는 연구자들에게 새로운 차원의 이미징 솔루션을 제공할 것입니다.
  • 2024년 10월 18일 (금) 오후 02시
  • 박준형 (토모큐브)
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학술웨비나 후생유전학적 치료를 통한, 교모세포종 세포에서 전이인자 발현과 종양 풍부 항원 생성 [Nat. Genet.] 발표내용 요약문(500자내외) Epigenetic treatment has been studied as a means to augment anti-tumor immune cell activity by increasing the expression of antiviral response genes. Previous studies, including our own, have revealed an additional consequence of epigenetic treatment: reactivation of transposable elements (TEs). Normally, most TEs are epigenetically repressed in healthy somatic tissues. However, epigenetic treatment can reactivate TEs as previously unannotated promoters, particularly in rapidly proliferating cells. These reactivated TEs could generate unique proteins that may act as novel antigens for immunotherapy. To study epigenetic treatment as a novel method to augment immunotherapy in cancers with a low number of somatic mutation-derived antigens, we chose glioblastoma as a model. Specifically, we investigated if drug-induced TE expression increases the antigen repertoire upon combinatorial treatment with DNMT inhibitor (Decitabine) and HDAC inhibitor (Panobinostat), agents currently being tested for clinical use in cancers, including CNS tumors. Using patient-derived primary glioblastoma stem cell (GSC) lines and control cell lines (astrocytes and fibroblasts), we first profiled treatment-induced changes in the epigenetic landscape using WGBS-seq and ATAC-seq. Then, using nanoCAGE-seq, both short-read and long-read RNA-seq, we identified treatment-induced, TE-derived transcripts that are predominantly expressed in glioblastoma cells along with upregulation of antiviral gene programs. Finally, using LC-MS/MS, we validated that tumor-enriched reactivated TEs, which mostly originate from the LTR class, encode HLA-I presented antigens in primary GSCs. Notably, epigenetic therapy also reactivated many TEs in proliferating control cell lines, and thus we provide evidence that targeted approaches like CRISPRa might reduce the side effects of activating nonspecific TE loci. Overall, our findings suggest that the therapeutic utilization of epigenetic treatment-induced, TE-derived antigens holds great promise but also provides a cautionary tale regarding the careful selection of tumor-enriched antigen targets.
  • 2024년 10월 25일 (금) 오전 10시
  • 맹주헌 (Washington University School of Medicine)
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  • 2024년 10월 31일 (목) 오전 11시
  • 안치훈 (Translational Research Institute, AdventHealth)
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기업웨비나 AI와 홀로토모그래피의 만남: 세포와 소기관의 정밀 분석 솔루션 TomoAnalysis [토모큐브] 이번 웨비나에서는 TomoAnalysis의 혁신적인 기능과 연구 적용 방안을 소개합니다. TomoAnalysis는 AI와 홀로토모그래피 기술을 결합하여 염색 없이도 세포와 소기관을 정밀하게 분석할 수 있는 통합 솔루션입니다. 3차원 영상 분석을 지원하는 TomoAnalysis는 다양한 생물학적 샘플에 대한 깊이 있는 이해를 제공하며, 많은 양의 이미지 데이터를 동시에 분석하고 연구 시간을 단축할 수 있는 배치 분석 기능을 지원합니다. 핵심 내용: √ 고해상도 3D 시각화로 복잡한 생물학적 구조를 공간적 맥락에서 이해하기 √ AI 기반 분석으로 세포, 핵, 지질 방울, 미토콘드리아 등을 정확하게 분할하고 측정하기 √ 굴절률 기반 분석으로 세포의 물리적, 형태학적 특성을 정밀하게 정량화 하기 (예: 부피, 표면적, 건 질량) √ 형광 이미지와의 통합 분석으로 다각도의 세포 정보 얻기 √ 다양한 연구 니즈에 맞춘 유연한 워크플로우 구성하기 본 웨비나를 통해 TomoAnalysis가 어떻게 연구의 새로운 패러다 임을 제시하고, 복잡한 데이터 세트의 비교 연구를 효과적으로 수행할 수 있는지 알아보시기 바랍니다. TomoAnalysis는 고난도의 분석 작업을 보다 신속하고 정확하게 수행할 수 있도록 도와줄 것입니다.
  • 2024년 11월 07일 (목) 오후 02시
  • 김혜진 (토모큐브)
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기업웨비나 AI와 홀로토모그래피의 만남: 세포와 소기관의 정밀 분석 솔루션 TomoAnalysis [토모큐브] 이번 웨비나에서는 TomoAnalysis의 혁신적인 기능과 연구 적용 방안을 소개합니다. TomoAnalysis는 AI와 홀로토모그래피 기술을 결합하여 염색 없이도 세포와 소기관을 정밀하게 분석할 수 있는 통합 솔루션입니다. 3차원 영상 분석을 지원하는 TomoAnalysis는 다양한 생물학적 샘플에 대한 깊이 있는 이해를 제공하며, 많은 양의 이미지 데이터를 동시에 분석하고 연구 시간을 단축할 수 있는 배치 분석 기능을 지원합니다. 핵심 내용: √ 고해상도 3D 시각화로 복잡한 생물학적 구조를 공간적 맥락에서 이해하기 √ AI 기반 분석으로 세포, 핵, 지질 방울, 미토콘드리아 등을 정확하게 분할하고 측정하기 √ 굴절률 기반 분석으로 세포의 물리적, 형태학적 특성을 정밀하게 정량화 하기 (예: 부피, 표면적, 건 질량) √ 형광 이미지와의 통합 분석으로 다각도의 세포 정보 얻기 √ 다양한 연구 니즈에 맞춘 유연한 워크플로우 구성하기 본 웨비나를 통해 TomoAnalysis가 어떻게 연구의 새로운 패러다 임을 제시하고, 복잡한 데이터 세트의 비교 연구를 효과적으로 수행할 수 있는지 알아보시기 바랍니다. TomoAnalysis는 고난도의 분석 작업을 보다 신속하고 정확하게 수행할 수 있도록 도와줄 것입니다.
  • 2024년 11월 07일 (목) 오후 02시
  • 김혜진 (토모큐브)
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기업웨비나 Chromatin Profiling Just Got Faster with CUT&Tag: CUT&Ta, 보다 빠르고 효율적인 크로마틴 프로파일링 [Cell Signaling Technology] Cleavage Under Targets & Tagmentation (CUT&Tag), like CUT&RUN, is a new chromatin profiling method that requires less of your sample and time. It uses a primary antibody, a secondary antibody, and pAG-Tn5 to identify protein-DNA interactions across the genome for analysis with next-generation sequencing (NGS). A major advantage of CUT&Tag is that the Tn5 also completes the adaptor ligation as part of the assay, which streamlines the DNA library prep. Go from cells to DNA library with as little as 100,000 cells in just 1-2 days. CUT&Tag은 CUT&RUN과 마찬가지로 필요한 세포수가 적고, 실험 시간이 덜 소요되는 새로운 염색질 프로파일링 방법입니다. 1차 항체, 2차 항체, pAG-Tn5를 사용하여 차세대 염기서열 분석(NGS)을 위해 게놈 전체의 단백질-DNA 상호작용을 식별합니다. CUT&Tag의 주요 장점은 in vivo에서 Tn5가 어댑터 ligation을 완료하여 DNA 라이브러리 준비를 간소화한다는 점입니다. 단 1~2일 만에 세포 수가 10만 개에 불과한 세포에서 DNA 라이브러리를 진행하실 수 있습니다. 본 웨비나에서는 연구자 분들의 성공적인 실험을 위해 아래와 같은 내용을 소개할 예정입니다. • Introduction of CUT&Tag • CUT&Tag benefit and tips. • Choosing between CUT&Tag vs CUT&RUN. • Q&A session
  • 2024년 10월 28일 (월) 오전 10시
  • 김선영 (Cell Signaling Technology)
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