"준킴님 시간되십니까." 이번 연구는 갑자기 날아든 메일로부터 시작됐습니다. 이전 직장에서 일하고 있던 어느 날, 김천아 박사님이 학부생한테 메일을 받았다며 연락을 주셨거든요. 듣자하니 어떤 학부생이 우리 논문을 재밌게 읽었다며, 자기가 코딩을 엄청나게 잘하니 논문 내용을 자동화하는 프로그램을 짜보고 싶다는 내용이었습니다. 김천아 박사님은 저에게 어떻게 생각하냐고 물었고, 저는 이왕 코딩 잘하는 친구면 다른 더 좋은 연구를 같이 해보자고 제안 드렸습니다.

Nucleic Acids Res.2025-01-13

이 연구는 한국생명공학연구원(KRIBB, 생명연) 내 국가생명연구자원정보센터(KOBIC)에서 시작됐습니다. 어느 날 KOBIC에서 일하고 있던 박지환 박사(현 아주대학교 조교수)님이 연락을 주더라고요. 당시 최첨단 DNA 염기서열 분석 기법인 롱리드 시퀀싱 데이터를 생산할 계획인데, 그 분석을 좀 같이 하자는 이야기였죠. 당연히 기쁜 마음으로 그러겠다고 했습니다. 상황이 썩 좋지만은 않았거든요.

Nucleic Acids Res.2025-01-10

이 연구는 신림동 꼭대기쪽 자취방 뒤에 있던 감나무에서 시작됐습니다. 저는 존경해마지 않는 이준호 선생님 연구실에서 박사과정을 했는데, 그때 연구실에서 키우던 예쁜꼬마선충 말고 다른 새로운 야생 선충을 다양하게 채집하고 싶었거든요. 이런 야생 선충을 새로운 모델생물을 개발하고 싶단 생각을 했던 겁니다. 예쁜꼬마선충 말고도 새롭고 신기한 선충들이 많을 텐데, 이런 걸 연구하면 더 재밌는 연구를 할 수 있을 거라는 확신이 있었거든요.

Genome Res.2023-11-06

제가 박사를 받은 이준호 연구실 어딘가에는 먼지가 수북하게 쌓인 외장하드가 여럿 잠들어 있었습니다. 제대로 된 분석도 하기 어려웠던 시절에 쌓아둔 시퀀싱 데이터가 가득 담긴 것들이었죠. 처음 데이터를 생산할 때만 해도 금방 분석이 끝날 줄 알았던 일들이지만 그 끝은 쉽게 찾아오지 않았고, 공동연구 한다던 사람들도 하나 둘 사라졌습니다.

Nucleic Acids Res.2021-03-16

이번 논문은 길이가 긴 리드(long read)를 활용하여 예쁜꼬마선충 하와이 품종의 고품질 유전체를 만들고, 이를 영국 브리스톨 품종의 유전체인 표준 유전체와 비교한 것입니다. 이를 통해 두 품종 사이에 발생한 구조 변이를 밝히고, 대안적 텔로미어 연장(alternative lengthening of telomeres)이라는 텔로미어 유지 기작을 통해 새로운 염색체 끝부분(subtelomere)이 만들어졌다는 것을 보였습니다.

Genome Res.2019-05-30