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이도훈 님의 인터뷰
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급성골수성백혈병(Acute myeloid leukemia, AML)은 매우 복잡한 유전자 변이 패턴을 가지는 암입니다. 환자에 따라 굉장히 다양한 변이 프로파일이 나타나며, 이에 따라 치료 반응이 달라져 예후에 영향을 미치게 되어 치료와 연구가 어려운 암이지요. 그럼에도 불구하고 FLT3, RAS와 같은 신호전달 관련 유전자, RUNX1, CEBPA, NPM1, ASXL1과 같은 전사 인자 및 크로마틴 조절자, ...
Nat. Commun.2025-02-01
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생물정보학 분야에서는 히스톤 단백질 꼬리의 화학적 변이의 조합이 유전자 발현을 조절한다는, 이른바 “히스톤 코드” 가설을 정량적으로 모델링하기 위한 많은 연구들이 있어왔습니다. 이 복잡한 문제를 과연 어떤 방식으로 접근했을까요? 물론 다양한 방법들이 제시되어 왔지만, 그 중에서도 유전체 상의 특정 위치에 대하여, 히스톤 ChIP-seq 실험으로 정량화된 여러 종류의 히스톤 변형 프로파일로부터 주변 유전자의 발현을 예측하는, 일종의 ‘기계 학습’ 문제로 변환하여 푸는 방법이 큰 성공을 거둬 왔습니다. 과거의 연구들은 주로 통계적인
Nat. Commun.2023-02-13
