한빛사 인터뷰
- 등록2025-02-18
- 조회355
1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드
저희가 개발한 Foldseek-Multimer는 단백질 복합체(4차 구조)를 비교하고 정렬할 수 있는 도구입니다.
AlphaFold2등의 발전으로 인해 단백질(복합체) 구조 예측 데이터가 폭발적으로 증가하고 있습니다. 이에 따라 단백질 복합체의 구조를 빠르고 효율적으로 비교할 수 있는 도구가 필요해졌고, 이러한 요구를 충족하기 위해 Foldseek-Multimer를 개발하게 되었습니다. 앞으로 AI 기술이 발전함에 따라 단백질 구조 예측 도구의 성능이 지속적으로 향상될 것이며, 이에 맞춰 단백질 구조 비교 및 분석 도구 역시 지속적으로 발전할 것이라고 생각합니다.
2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다.
저는 서울대학교 생물정보학 및 기계학습 연구실(https://steineggerlab.com/)에서 마틴 스타이네거 교수님의 지도하에 연구하고 있습니다. 우리 연구실은 연구자들을 위한 생물정보학 프로그램을 개발하고 제공하고 있으며, 대표적인 프로그램으로는 MMseqs2, ColabFold, Foldseek, Metabuli 등이 있습니다.
3. 연구 활동 하시면서 평소 느끼신 점 또는 자부심, 보람
저는 Foldseek-Multimer를 개발하며, 알고리즘을 코드로 구현하고, 버그를 수정하며, 프로그램을 개선하는 과정에서 큰 재미를 느꼈습니다. 마침내 저희의 연구 결과가 출판되었고, 이에 큰 보람을 느끼고 있습니다. Foldseek-Multimer가 많은 연구자들에게 유용한 도구가 되길 바랍니다.
4. 이 분야로 진학하려는 후배들 또는 유학준비생들에게 도움이 되는 말씀을 해 주신다면?
저는 생물정보학을 연구하기 위해서는 생물학, 컴퓨터 과학, 통계학 등에 대한 기본적인 이해가 필수적이라고 생각합니다. 이로 인해 진입 장벽이 높다고 느껴질 수 있지만, 생물정보학은 매우 유망한 분야이므로 꾸준히 공부해 나가다 보면 좋은 결과를 얻을 수 있을 것이라 믿습니다.
5. 연구 활동과 관련된 앞으로의 계획이 있으시다면?
아직 완료하지 못한 연구들이 남아 있어, 이를 마무리하는 것이 목표입니다. 덧붙여, Foldseek-Multimer를 지속적으로 개선하고 확장하는 작업도 진행할 예정입니다.
6. 다른 하시고 싶은 이야기들.....
먼저, 생물정보학에 입문할 수 있도록 도와주시고 연구를 격려해 주신 Martin Steinegger 교수님께 깊이 감사드립니다. 또한, 함께 연구하며 많은 도움을 주신 연구실 동료분들께도 감사의 뜻을 전하고 싶습니다. 마지막으로, Foldseek-Multimer의 개발과 논문 투고 과정에서 도움을 주신 모든 분들께 진심으로 감사드립니다.
#Bioinformatics
#Protein Structure
#Protein Complex
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