한빛사 인터뷰
1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드
DNA는 체내 생명활동의 근간이 되는 물질로, 복제 (replication)을 통해 유전정보를 다음 세대로 전달합니다. DNA 복제는 생명활동 영위와 유전에 필수적인 과정이지만, DNA 복제과정 도중 전사가 일어난다면 DNA 복제체 (replisome)와 RNA 전사체 (transcriptome) 사이에 충돌이 일어나서 DNA 복제가 멈출 수 있습니다. 이 현상을 ‘transcription-replication conflicts’ (TRC)라고 하고, DNA 복제가 제대로 이뤄지지 않으면 암, 신경계 질환 등 심각한 질병을 일으킬 수 있습니다. TRC를 일으키는 원인은 다양한데, 최근 들어 이중가닥 DNA 사이에 RNA 한 가닥이 들어가서 생성되는 R-loop이 TRC를 일으키는 주요 원인 중 하나로 인식되어 많은 연구가 이루어지고 있습니다. 하지만 DNA 복제 도중 알룹 또는 RNA 전사체와 충돌했을 때 어떤 일이 일어나는지는 잘 알려져 있지 않았습니다. 저는 single-molecule DNA curtain 기술을 이용해서, in vitro 상에서 DNA 복제 도중 R-loop 혹은 RNA 전사체를 만났을 때 생기는 DNA 복제의 차이를 연구했습니다. RNA와 DNA가 붙어있는 가닥 (RNA-DNA hybrid)의 위치 (template strand vs nontemplate strand)에 따라 DNA 복제 스트레스 유발 정도가 다르다는 것, RNA 전사체와 충돌할 경우 굉장히 높은 비율의 스트레스를 가지며, 특히 RNA polymrease가 있을 경우 DNA 복제가 더욱 방해 받는다는 것을 실시간 형광 이미징 기법으로 밝혀냈습니다.
RNA와 DNA의 녹는점을 비교했던 실험이 기억납니다. 어떤 장비로 어떻게 실험해야 할지 알고 있는 사람이 거의 없어서 고생을 좀 했었습니다. 장비 찾아다니고, 담당자 연락하고, 어떻게 실험 해야 할지 생각하면서 골머리를 앓았었는데, 지금 생각해보면 좋은 경험이었던 것 같습니다. 제가 기계치인데, 결국에는 뻰치랑 드라이버 들고 장비 뜯고있더라고요 ㅎㅎ. 사람은 본인이 필요하면 결국 스스로 하게 되는구나 다시 한번 생각했습니다.
2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다.
RNA와 DNA의 녹는점을 비교했던 실험이 기억납니다. 어떤 장비로 어떻게 실험해야 할지 알고 있는 사람이 거의 없어서 고생을 좀 했었습니다. 장비 찾아다니고, 담당자 연락하고, 어떻게 실험 해야 할지 생각하면서 골머리를 앓았었는데, 지금 생각해보면 좋은 경험이었던 것 같습니다. 제가 기계치인데, 결국에는 뻰치랑 드라이버 들고 장비 뜯고있더라고요 ㅎㅎ. 사람은 본인이 필요하면 결국 스스로 하게 되는구나 다시한번 생각했습니다.
많은 분들께서 저희 연구실 이름에 ‘물리’라는 단어가 들어가서 거부감을 느끼시는데, 사실 저희 연구실은 물리학 기반의 실험 테크닉을 사용하는 것이지, 물리학과처럼 수식 풀고, 증명하고… 이런 것 거의 하지 않습니다. 다른 생물학과 연구실처럼 단백질 정제, western blot, 현미경 등등 다양한 테크닉을 다루는 연구실이기 때문에, ‘물리’라는 단어에 크게 거부감을 느끼지 않으셨으면 좋겠습니다!
3. 연구 활동 하시면서 평소 느끼신 점 또는 자부심, 보람
안되는 실험의 해결책을 찾는 것이 기분 좋습니다... 교수님이랑, 연구실 사람들이랑 모여서 해결방법을 모색하는데, 그게 먹힐 때 기분 째집니다. 남들이 생각 못했던 걸 생각할 때, 그리고 예상했던 결과가 맞아떨어지면 좀 뿌듯합니다 ㅎㅎ
4. 이 분야로 진학하려는 후배들 또는 유학준비생들에게 도움이 되는 말씀을 해 주신다면?
특히 DNA repair 분야는 질병과도 큰 연관이 있다고 생각하기 때문에, 관심을 가지고 살펴보는 것도 좋다고 생각합니다. 학회도 많이 참석하시고, 논문도 읽으면서 요즘 연구 분야의 트렌드를 보는 것도 필요하다고 생각합니다. 저도 논문들 열심히 읽으면서 요즘 연구 동향들을 많이 살펴보겠습니다.
5. 연구 활동과 관련된 앞으로의 계획이 있으시다면?
유니스트에서 박사 졸업 이후, 해외로 박사 후 연구과정을 밟고 싶습니다. 아직 졸업 후 어떤 연구를 하고 싶은지 찾고 있는 중입니다.
6. 다른 하시고 싶은 이야기들.....
다들 체력 기릅시다 체력!
#DNA replication
# R-loop
# 단분자 이미징
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