한빛사 인터뷰
1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드
ACT-like domain 은 일차대사산물 생합성에 관련한 효소에 주로 존재하는 ACT 도메인과 비슷한 구조를 가진 단백질 도메인입니다. 제가 현재 소속한 실험실에서 ACT-like 도메인이 진핵생물에서 가장 큰 전사인자 그룹 중 하나인 bHLH에 존재한다는걸 처음 확인하였지만, 아미노산 서열 유사도가 낮아서 소수의 단백질에 대해서만 존재가 알려져 있었습니다. 본 연구에서는 구조기반 서열 분석을 통해 ACT-like 도메인이 식물 bHLH에 광범위하게 존재하는 것을 밝혔고, bHLH 전사인자의 진화에 중요한 역할을 한다는 것을 밝혔습니다. 식물 bHLH의 진화과정에서 ACT-like 도메인과 병합하는 과정이 일어나 ACT-like 도메인이 있는 것과 없는 두 그룹으로 분기하였고, bHLH 도메인과 ACT-like domain이 co-evolution 하는 것을 밝혔습니다. 뿐만 아니라 ACT-like 도메인이 bHLH 도메인의 DNA 결합을 조절하는 기능이 green algae와 현생 식물에 보존되어있다는 것을 확인하여 두 도메인의 분자적 기능이 서로 연관되어 있음을 밝혔습니다.
2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다.
저는 현재 미시간 주립 대학에 있는 Erich Grotewold 실험실에서 연구중입니다. 제가 소속되어 있는 실험실은 아라비돕시스와 옥수수에서 flavonoid 생합성 관련 경로가 어떻게 조절되는지를 이해하기위해, 유전학, 생물정보학, 분자생물학, 생화학 등의 다양한 접근방법을 사용해 연구하고 있습니다.
3. 연구 활동 하시면서 평소 느끼신 점 또는 자부심, 보람
저는 그동안 다양한 국적, 성별의 학부졸업생 혹은 학부생들과 함께 연구를 진행해왔습니다. 멘티들이 보통 피펫이 무엇인지도 모르고 실험실에 들어왔다가 어느순간 과제내용을 논의 할 수 있을 정도로 실력이 향상되는 모습을 볼때 자부심과 보람을 느꼈습니다. 더불어 다양한 연구자와 교류한 경험이 연구내용의 다양성뿐 아니라 연구 문화의 다양성도 접해 볼 수 있는 기회를 제공해준다는 점에서 유용했다고 생각합니다.
4. 이 분야로 진학하려는 후배들 또는 유학준비생들에게 도움이 되는 말씀을 해 주신다면?
영미권 대학원이나 유학을 계획하지만, 영어때문에 망설여 지시는 분이 계시다면, 영어는 연구하는데 그리 중요한 요소가 아니라고 꼭 말씀드리고 싶습니다. 본인이 하는 연구에 확신과 자신감이 있다면, 영어는 필수조건은 아닙니다. 주저하고 고민하고 두려워서 시간만 버리지 말고 평소 관심있는 교수님 최근 논문을 읽어보고 본인의 생각을 이메일로 보내보세요.
5. 연구 활동과 관련된 앞으로의 계획이 있으시다면?
우리나라에 자생하는 약용작물은 오래전부터 약재로 쓰여져 왔고, 그 약리 활성작용은 이미 약재로 사용되면서 충분히 검증되었다고 생각합니다. 하지만 아쉽게도 약리 활성 물질이 어떤 생합성 경로를 통해 합성되는지, 그리고 어떤 효능이 있는지는 아직 과학적인 입증이 부족합니다. 현재 저는 specialized metabolite의 가장 대표 생합성 경로 중 하나인 flavonoid 생합성을 다각도로 접근하여 연구하고 있습니다. 현재 연구하는 내용을 발판삼아 우리나라에 자생하는 약용작물에 적용하여 유용 자원을 발굴하는데 기여하고 싶습니다.
6. 다른 하시고 싶은 이야기들.....
박사학위를 받는것도 쉽지 않은 여정이었는데 더 험난한 여정을 포닥생활을 하면서 겪고 있습니다. 박사학위동안 전혀 접해보지 않은 연구 내용을 말도 잘 통하지 않은 미국에서 새롭게 시작할땐 가끔 제가 가지고 있는 능력이 부족하게 느껴질 때도 있었습니다. 거침없는 논의를 통해 저의 시야을 넓혀주고 계신 현재 PI인 Erich Grotewold 와 좋은 일 있으면 함께 웃어주고 슬픈일 있으면 함께 고민해주는 실험실 가족들, 그리고 절 멘토 라고 불러주지만 제가 더 의지하는 저의 멘티들에게 감사하다고 전하고 싶습니다. 그리고 저의 든든한 버팀목인 서울대학교 농업생명과학대학 기능성 식물 연구실 양태진 교수님, 부족한 저의 언제나 빨간팬 선생님이었던 실험실 오빠, 언니, 동생, 친구들에게 감사하다는 말을 전하고 싶습니다. 마지막으로 저의 가장 든든한 버팀목인 세상에서 가장 똑똑한 김연정 박사님, 한국에 계시는 가족들에게 감사하다고 전하고 싶습니다.
#bHLH Transcription factor
# ACT-like domain
# Plant
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