한빛사 인터뷰
1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드
주요 정신질환에 해당하는 우울증, 양극성장애, 조현병은 주로 임상의가 환자의 증상과 행동을 관찰하고 평가하여 최종 진단을 결정합니다. 하지만 진단에 있어서 임상의의 주관성이 개입되고 golden standard로 사용되는 분자적 진단 마커가 존재하지 않기 때문에 세가지 질환을 객관적인 수치를 기반으로 정확히 감별하고 진단하는 것은 어렵습니다. 주요 정신질환에서 두 질환의 감별 및 진단을 위한 분자 마커들이 발굴되었지만, 세 질환을 감별하고 진단하는 분자 마커 발굴하고 검증하는 연구는 아직 많이 존재하지 않습니다.
이번 논문의 목적은 질량분석기반 단백체학 분석기법을 기반으로 우울증, 양극성장애, 조현병의 감별 및 진단은 위한 단백질 바이오마커를 발굴 및 개발하고 머신러닝기법을 사용하여 발굴한 단백질 바이오마커와 임상 데이터를 결합한 진단 앙상블 모델을 개발하는 것입니다. 이번 논문에서는 우울증, 양극성장애, 조현병과 관련된 600여개의 단백질 타겟들을 선정하고 질량분석기반 단백체학 분석을 통해 선정한 단백질의 정량 성을 확인하였습니다. 다음으로 총 675례의 피실험자의 혈액 (혈장) 시료에서 개별적으로 질량분석기반 단백체학 분석을 수행하여 개별 피실험자에 대한 단백질 타겟의 정량 데이터를 수집하였습니다. 이후에, 머신러닝기법을 사용하여 진단 모델을 개발하고 개발한 모델의 성능을 평가 및 검증하는 스토리입니다. 논문 리뷰과정에서 에디터 및 리뷰어 4명분의 반응이 긍정적이었습니다. 리뷰어분들께서 주요 정신질환의 감별 및 진단에서 단백체학 접근법의 잠재성을 인정해주셔서 감사했습니다.
2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁드립니다.
제가 소속되어있는 서울대학교 의과대학 의과학과 Proteomics & Biomarker Lab은 대한민국에서 단백체학의 선구 연구실입니다. 지금까지 교수님과 연구실 선배님들 및 현재 대학원생들의 수많은 노력과 노고를 통해 중요한 단백체학 분석 기법 및 기술을 구축하고 보완해왔습니다. 또한 많은 임상의들과 공동연구를 통해 중요한 연구결과들을 도출하였으며 좋은 영향력 있는 논문들에 발표해왔습니다.
3. 연구 활동 하시면서 평소 느끼신 점 또는 자부심, 보람
연구를 수행하면서 여러 사람들과의 공동연구를 통해 제가 생각하지 못했던 여러 관점들과 방향을 공부할 수 있었습니다. 가장 보람이 있을 때는 아무래도 고생한 논문이 최종 승인되었을 때 입니다.
4. 이 분야로 진학하려는 후배들 또는 유학준비생들에게 도움이 되는 말씀을 해 주신다면?
단백체학은 다학제적 학문으로 어느 것 하나만 잘해서 되는 분야는 아니라고 생각합니다. 가장 중요한 것은 본인이 하고 있는 연구에 흥미를 느끼는 것입니다. 대량 시료를 대상으로 실험을 하는 것에 대해 익숙해야 하고 분석에 사용하는 질량 분석장비의 원리 및 유지 및 관리에도 흥미가 있어야 합니다. 또한 방대한 단백체 데이터 안에서 중요한 생물학적 의미를 발견하는 것에 흥미가 있어야 합니다. 컴퓨터 프로그래밍 언어에 익숙하다면 단백체학 데이터 분석을 하는데 더욱 수월 할 것이라 생각합니다. 또한 공동 연구하는 사람들과 지속적인 논의를 하는 것이 중요하다고 생각합니다. 가장 중요한 것은 다른 사람들이 볼 수 없는 새로운 아이디어를 고안하는 것인데, 이것은 단시간에 이루어지는 것은 아니라고 생각합니다. 꾸준히 열심히 노력하고 열정을 가지고 임한다면 가능 할 것이라 생각합니다.
5. 연구 활동과 관련된 앞으로의 계획이 있으시다면?
현재 경도인지장애 및 알츠하이머성 치매 조기진단을 위한 단백체 바이오마커 발굴 및 개발 그리고 검증 연구를 수행하고 있습니다. 치매 연구도 본 논문의 주요정신질환 연구처럼 좋은 결과를 냈으면 하는 바입니다. 또한 단백체학 연구를 다방면으로 수행해보고 싶습니다. 따라서 기회가 된다면 해외의 유명연구실 또는 연구소에서 연구 경험을 쌓고 싶습니다.
6. 다른 하시고 싶은 이야기들.....
지금의 제가 있기까지 감사드려야 할 분들이 많습니다. 단백체학에 대해서 아무것도 몰랐던 저를 받아주신 지도 교수님이신 김영수 교수님께 너무 감사드립니다. 교수님의 지도와 가르침 덕분에 좋은 성과를 낼 수 있었습니다. 또한 본 연구를 수행함에 있어서 많은 도움을 주신 Proteomics & Biomarker Lab의 동료 및 선배님들께 감사의 인사를 올립니다. 특히 본 연구를 수행하는데 있어서 도움을 주신 또한 여인준 박사님, 김요섭 박사님, 동기인 이지현 학우에게 감사의 인사를 올립니다. 또한 같이 연구를 수행한 서울대학교 정신건강의학과 이상진 선생님 및 안용민 교수님께 감사 말씀 올립니다. 더욱이, 아무것도 몰랐던 저에게 귀중한 훈련을 통한 실험 및 연구자의 자세를 가르쳐주신 차의과학대학원 약리학교실 박준호 교수님께 감사드립니다. 또한 본 연구 외적으로 많은 도움을 주시고 계신 서울대학교병원 융합의학과 한도현 교수님께 감사드립니다.
마지막으로 항상 저를 응원해주는 우리 가족 및 가족이 될 소명이에게 매우 감사드립니다.
#주요정신질환
#질량분석기반 단백체학
#단백질 바이오마커
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