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CFX96 사용법 및 결과 분석 방법...

레벨1 염전노예3213 (대학원생)

등록일 2023.05.30 23:42:40
조회1329

안녕하세요..

대학원생입니다.

제가 보통 thermo 사의 onestep 장비를 이용하여 qPCR을 돌리는데, 예약관계로 CFX96으로 같은 세팅으로 돌렸는데 amplification 값이 나오지 않아 질문드립니다.

melting curve는 잘 나오는데 amplification 값이 모두 N/A가 나와 분석이 불가능 한 상황입니다...

그냥 Ct값만 나오면 계산하려고 house keeping gene등 모두 unkonown 으로 두고 qPCR을 돌렸는데 값이 나오지 않네요,,ㅠㅠ

결과랑 melting curve 등,,,아래 첨부드립니다.

upload_image

도움,,부탁드리겠습니다.

감사합니다.

#qRT-PCR
#CFX96
#qPCR

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답변 1

답변등록

레벨5 CBD 김선우
2023.05.31 09:05

저 시스템을 쓰지 않아서 잘은 모르지만

마지막 running protocol을 보면 모든 step에서 plate read 기능이 켜져있는데 저부분은 작성자분이 수정하신건가요? 제가 사용한 기기의 기본 세팅은 형광 측정하는 구간은 annealing-extension 구간이랑 마지막 metcurve 구간만 활성화 되어있거든요. 불필요하게 95도 denature 구간까지 다 read한다고 체크 되어있어서 CT 계산이 안된 거 같은데요.

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