transcription factor의 potential 관한 기본적인 질문입니다. | 실험 Q&A > 커뮤니티

Q transcription factor의 potential 관한 기본적인 질문입니다.

레벨01 슈동 (대학생)

23.02.01 20:24
조회2313

JASPAR등과 같은 사이트에서 특정 gene에 대한 특정 Transcription factor의 binding을 prediction하면, 어떤 T.F A같은 경우에는 promoter 기준 전후로 굉장히 많은 prediciton site가 나오고 또 다른 T.F. B는 prediction site가 많지는 않지만 promoter 바로 앞부분에 위치한 prediction site가 나오는데요. 기초적인 것일 수도 있는데 문득 이런 의문이 들었습니다. 그렇다면 A가 이 gene에 더 potential한 T.F일지 혹은 B가 더 강력한 inducer일지가 궁금해졌습니다. 경우에 따라 다를 것 같긴 하지만, 둘 중 어느 것이 더 potential하다고 봐야할까요?

#Transcription factor

Mol. Biol.-DNA > etc.

등록순
추천순

A 답변 2

채택된 답변입니다.
레벨08 SPEED heart
23.02.01 22:57

T.F가 결합한다고 inducer라고 볼수있는 근거가 있지는 않을겁니다.

해당 T.F가 turn on, off or up, down regulation에 대하여 알려져있나요?

A, B가 같은 gene 상류에 결합하나요?

예상 binding site 수로 판단하기 힘들겁니다.