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DNA 전기영동하는데, gel이 자꾸 위에만 밝게 나오네..

레벨1 라뛔한 (과기인)

DNA 전기영동하고 있습니다.

Red safe사용하고 있고요, 기계도 최신버전으로 구매한지 얼마 되지 않았습니다.

3번을 해봤는데 아래같이 계속 위에 부분만 밝게 나오고,

막상 DNA부분은 너무 어둡게 detection되네요..

도움 부탁드리겠습니다!

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답변 5

- EtBr을 gel에 넣어서 사용한 것 같습니다.

- 정상적인 현상이고 EtBr은 (+) -> (-)로 움직입니다.

- Dye가 내려온 만큼 밝은 부분은 위로 움직입니다.

- 전기영동 후 증류수에 담궈 여분의 EtBr을 제거하든지 sample에 EtBr을

넣고 전기영동하면 위와 같은 현상은 없어집니다.

저희 실험실은 EtBr을 사용하지 않고 있습니다.

EtBr 대신 red safe를 사용하고 있습니다.

red safe를 사용하는데, EtBr을 사용했을 때와 비슷한 이유로

이런현상이 생길 수 있는 걸까요?

- EtBr과 charge가 동일할 겁니다.

- DNA가 연하게 보이는 것은 양도 적고 배경 때문으로 보입니다.

- sample에 넣어서 사용하면 깨끗한 이미지를 얻을 수 있습니다.

저는 red safe를 사용할 때 저렇게 나왔었는데 gel red로 바꾸었더니 저런 현상 없이 일정하게 깔끔하게 잘 나오더라구요!

gel을 위아래 뒤집어서(큰 size marker가 아래로 오게) 사진을 찍어보시고 사진이 아래가 밝게 나오면 전기영동이 문제고, 위가 밝으면 UV등을 한번 살펴보세요.