GraphPad Prism 5 IC50 계산 문의드립니다. | 실험 Q&A > 커뮤니티

Q GraphPad Prism 5 IC50 계산 문의드립니다.

레벨02 대학원생파이팅 (대학원생)

MTT Assay를 통하여 2가지의 약물을 2.5 uM에서 40uM까지 얻은 결과값을 이용하여 IC50값을 구하곤 했는데요.

최근 제가 구하고 있는 방법이 무언가 잘못되었다는 느낌이 생겨서 질문을 드리고 싶습니다.

upload_image

MTT Assay 결과를 토대로 그린 IC50 그래프값입니다.

sample 1의 경우 IC50 7.3 이며 sample 2 의 경우 IC50의 값이 8.3입니다.

그러나 MTT 데이터를 살펴보면 sample 2 IC50 가 8.3으로 나오는 것과는 그 결과가 너무 달라 보여서 질문 드리고싶습니다.

제가 지금 하고있는 데이터 분석이 맞는것인지.. 다르다면 어떻게 바꾸어야 하는지 알고싶습니다.

IC50값을 구할 때, 프리즘에서 XY 그래프 선택란에서 그래프를 선택하고

MTT 값을 기입한 뒤 트랜스폼을 이용하여 X=log[X]로 바꾸어주 고

Normalize한 뒤 Nonlinear regression ( curve fit.) 에서

Dose-response Inhibition

Log(Inhibition) vs Normalized response Varable slope를 선택하여 데이터를 분석합니다.

분석하는 데이터 파일도 첨부해보았습니다. 아시는 분께 부탁드리겠습니다

재분석을 부탁드리는 것이 아닙니다. 제 분석방법이 맞는것인지, 아니라면 어느 부분이 잘못되었는지 알고 싶습니다.

Etc.

A 답변 2

Log(Inhibition) vs Normalized response Varable slope를 선택하여 데이터를 분석합니다.

이 부분에서 잘못된것같습니다 저도 이걸알아보고있는데 어렵군용

Log(Inhibition) vs Normalized response Varable slope를 선택하면 해당 데이터를 그래프방정식으로 하여 Y값을 0-100까지로 설정합니다.

Log(Inhibition) vs response variable slope (four 파라미터)를 기본적으로 사용하는 것 같은데 이 방정식을 사용할 때도 cell viability가 거의 4-100까지는 나와야 합니다.

한 cell viability 가 거의 40-100 % 된다면 두번째 방정식을 사용해도 ic50의 제 값이 나오지 않는 것을 확인하였습니다.

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(일반인)

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