제가 Genomic DNA를 뽑아낸 뒤 TE buffer와 섞어서 PCR에 사용했거든요.
근데 제가 PCR을 할 영역은 3kb정도이고 Primer도 그렇게 맞춰서 짰는데요.
도대체 뭐가 잘못된건지 PCR product를 전기영동해 보았을때,
5kb정도의 밴드하나만 뜨네요.
뭐가 잘못된걸까요?;
프라이머는 프라이머 블라스트 돌려서 짠것이고 확실히 맞게 짠것 같은데..
도무지 원인을 알 수가 없네요.
실제 gDNA 상에서 F/R primer사이의 길이가 3kb이고 primer에 문제가 없다면
3kb가 나오는 것이 정상입니다.
조건을 바꿔서 한번 해보시죠..
mRNA기준으로 product size를 예상하고 gDNA PCR을 하시면 예상 size는 100% 틀리게
나옵니다.
그렇게 하진 않으셨을거라고 생각합니다만..
