500개 이상이면 총 예산이 상당하겠네요😅
16S V3-V4 기준으로 샘플당 18만 원이면 아주 비싼 금액은 아니지만, 500개 규모라면 추가 할인은 충분히 협의해볼 만한 수준인 것 같습니다.
다만 업체마다 포함 범위가 정말 많이 다릅니다. 단순히 샘플당 단가만 보지 마시고,
✔️ DNA extraction 포함 여부
✔️ Read depth
✔️ QIIME2/DADA2 파이프라인
✔️ Alpha/Beta diversity, LEfSe, PICRUSt2 포함 여부
✔️ 통계 분석 및 논문용 Figure 제작 포함 여부
✔️ Raw data 제공 여부
이런 부분을 꼭 같이 비교해보세요.
저도 최근 대규모 microbiome 프로젝트를 진행하면서 느낀 건데, 시퀀싱 비용보다 이후 bioinformatics와 통계 분석, 논문용 결과 정리가 생각보다 훨씬 큰 일이 되더라고요. 그래서 처음부터 실험 설계부터 downstream analysis까지 함께 봐줄 수 있는 곳이 오히려 전체 비용과 시간을 많이 아끼는 경우도 있었습니다.
혹시 견적 비교나 분석 범위 때문에 고민되시면 저희가 운영하는
- mediinsightlab@gmail.com으로 메일 주세요
microbiome을 포함한 대규모 omics 데이터 분석, 통계, Figure 및 논문 지원을 하고 있으니 편하게 문의주셔도 괜찮습니다.
