gel 에 loading 했을 때, DNA 또는 loading dye가 가라 앉는게 보였다면 (버퍼에 둥둥 안 뜨고) 큰 문제 없습니다.  일단 HgDNA  band가 안 보이는 걸로 봐서는 DNA가 있는지부터 의심스러운데, Nano drop이 학교에 있을 것 같진 않고, UV spectrophotometer가 있는지 모르겠군요. 없다면 근처 대학교 실험실 가서 DNA 농도 부터 측정해 보세요. 

오오 UV spectrophotometer는 선배님이 학교에 있다고 하셨던것같아요 

HgDNA는 어떻게 준비했나요?

동아리 담당쌤께서 구해다 주셨습니다

대학교 교수님께 연락해서 구하신 건지 아니면 구매하셨는지는 잘 모르겠어요

DNA문제로 보입니다.

그렇군요 알려주셔서 감사합니다 DNA 확인해보겠습니다

안녕하세요. 

실험 결과를 도출하는 과정에서 예상치 못한 전개로 고민이 많겠네요. 

전임자 분의 부재와 새로운 환경 속에서  원인을 찾으려는 시도를 응원합니다.

제 의견은 아래와 같습니다.

1. 로딩 다이 문제는 아닌 것으로 보입니다.
새 로딩 다이와 옛날 로딩 다이의 결과가 유사하게 번졌으므로, 다이 자체의 문제는 아닌 것으로 추측됩니다. 

이 실험에서 결정적으로 DNA 마커를 사용하지 않으셨네요. 마커 사용은 기본입니다.

2. 예상되는 원인은 다음과 같습니다.
2-1. DNA 분해: 정상적인 gDNA는 맨 위에 가늘고 선명한 한 줄로 나와야 합니다. 지금처럼 아래로 길게 흐려진 것(Smear)은 보관 과정 등에서 DNA가 잘게 깨졌음을 뜻합니다.
2-2. 버퍼 고갈 및 열 발생: TBE 버퍼를 너무 여러 번 재사용했거나 100V 전압이 높아, 겔에 열이 발생하면서 밴드가 뚱뚱하게 퍼졌을 수 있습니다. 또한 잦은 버퍼 사용으로 버퍼가 DNase comamination 이 될 가능성도 있습니다.

3. 따라서 다음을 제안드립니다.
3-1. DNA 마커(Ladder) 반드시 넣기: 마커 밴드는 선명한데 내 gDNA만 퍼진다면 DNA가 분해된 것 (새로 추출 필요) (참고 예: https://www.bioneer.co.kr/20-d-1040-cfg.html)
만약 마커 밴드까지 같이 퍼진다면 버퍼나 기기 문제로 새 버퍼 사용하기를 제안합니다. 기존 TBE 버퍼는 버리고, 새로 정확히 희석해서 사용하세요.
3-2.  열 발생 방지를 위해 100V 대신 70~80V로 낮추고 시간을 조금 늘려 천천히 내려 보세요.

추가로 관련 사이트 공유 드립니다.
https://buly.kr/Chr6T2d

https://buly.kr/EI5ppb6


도움이 되셨으면 좋겠습니다.