Flow cytometry (FACS) 분석 소프트웨어를 만들어 봤습니다... | 소리마당 > 커뮤니티

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N Flow cytometry (FACS) 분석 소프트웨어를 만들어 봤습니다...

rekcuf (과기인)

26.09.30 20:24 (수정)
조회9503

코딩의 1도 모르는데, Vibe coding이란게 있다고 해서 해 보다가 어떻게 여기까지 왔네요...ㅜ.ㅜ

만든 프로그램은 FCS mini라고 이름 붙였고, Flow cytometry (FACS)용 분석 프로그램입니다.

윈도우 10. 11에서 돌아가는 것 확인해 보았고, 주변 동료들에게 테스트 요청해 보니 FlowJo 만큼은 못하겠지만 상당히 괜찮다는 평을 들었습니다.

다운로드 및 간단한 설명은 http://sourceforge.net/projects/fcs-mini 의 File 탭에서 가능하고, https://www.youtube.com/watch?v=ygQhh2AE2Q4 에 16분짜리 튜토리얼 동영상을 올려 놓았습니다 (튜토리얼은 BV421을 이용한 CD8+ cell proliferation 비교실험, CD8+ purity 실험을 예로 제시했고, 자막파일도 sourceforge에 업로드 했습니다).

개인이 만들다 보니 당연히 프리웨어이고, 몇개월동안 수백번 이상의 버그 픽싱을 거치기는 했지만 혹시 발생하는 버그는 해당 sourceforge.net 게시판에 올려 주시기 바랍니다.

튜토리얼에도 나오지만, 일단 장점은,

(1) 분석하고자 하는 fcs 파일들을 Group으로 묶어 주시면, 편리한 기능 (GBA: Group Batch Analysis 등)을 이용하실 수 있습니다

(2) Batch 저장 (pptx, csv) 기능이 굉장히 유용합니다. Report builder 기능도 사용가능합니다

(3) Module로 cell cycle, proliferation, calcium influx, UMAP analysis 기능을 넣어 놓았습니다

(4) Auto / Manual compensation 기능을 넣어 놓았습니다

(5) Tab 페이지 형식이라 FlowJo 보다 깔끔하게 보실 수 있습니다

요즘은 실험실에 예산이 넉넉해서 FlowJo 같은 상용프로그램의 라이센스를 충분히 활용할 것 같은데, 혹시 대안 프로그램을 찾고 계신다면 한번 사용을 권해 드립니다.

감사합니다.