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Bio일정  >  행사

제51회 차세대 생명정보학 교육 워크샵(Visium HD 데이터 분석)

  • 등록 25.06.19
  • 조회 662

제51회 차세대 생명정보학 교육 워크샵 


국가생명연구자원정보센터(KOBIC)에서는 방대한 생명정보를 분석하고 활용하는 시스템을 구축하고 있습니다. NGS 기술의 발달에 따라 유전체 데이터가 폭발적으로 생산되어, 이에 따라 다양한 생물학 분야에서의 유전체 데이터 분석 기술이 요구되고 있습니다. 이러한 유전체 정보 분석 기반 구축과 더불어 국내 연구자들이 다양한 유전체 정보들을 잘 활용할 수 있도록 유전체 정보 분석 이론 및 실습을 위한 교육을 마련하였습니다. 

 본 교육은 10x Genomics사의 Visium HD 데이터를 활용한 고해상도 공간전사체 분석 워크샵입니다. 10x Cloud의 Space Ranger를 이용한 HD 이미지 및 시퀀싱 데이터 처리부터 시작하여, 웹 요약 리포트를 통해 데이터 품질을 평가하고, Loupe Browser를 활용한 HD 데이터 시각화 방법을 소개합니다. 이어서, 외부 분석 도구(third-party tools)를 사용하여 1) Single-sample HD 데이터 후속 분석과 2) 다중 샘플 HD 통합 분석을 수행합니다. 마지막으로, HD와 단일세포 데이터 통합 분석, HD 데이터 핵 분할(nucleus segmentation) 등 다른 고급 분석 응용도 다룰 예정입니다. 본 교육을 통해 다양한 종류의 유전체 데이터에 대한 이해와 분석 능력을 향상시키기를 기대하며, 관심 있는 분들의 많은 참여 부탁드립니다.


2025년 6월 16일

한국생명공학연구원 국가생명연구자원정보센터 센터장     정 해 영


□ 교육 일정
 ㅇ 교육 장소 : 대전광역시 유성구 과학로 125 한국생명공학연구원 KOBIC동 3층 교육실
 ㅇ 교육 내용 : 고해상도 공간 전사체 분석 교육
 ㅇ 교육 일정 : 2025년 7월 17일(목) 오후 12시 30분부터 오후 5시 30분
 ㅇ 연자 소개 : 
Quy Xiao Xuan Lin, PhD
Staff Scientist, Applied Bioinformatics
10x Genomics 
ㅇ 신청 방법 : 네이버 폼 수강신청서 작성 후 제출
  https://naver.me/x1miOJlp
 ㅇ 교육 인원 : 50명* 이내
 ㅇ 문의 사항 : 국가생명연구자원정보센터 차동곤 (dgcha@kribb.re.kr)

* 효율적인 교육 환경을 마련하기 위해 수강 인원을 50명으로 제한합니다.

ㅇ 유의 사항
 - The lecture will be in English. 강의는 영어로 진행될 예정입니다.
 - 본 교육과정은 10x Genomics의 Visium HD 플랫폼을 이미 사용 중이거나, 향후 Visium Spatial 플랫폼 도입을 고려 중인 연구자분들을 대상으로 합니다.
 ※ 개인 노트북을 지참하여 참여하실 경우, 아래 컴퓨터 요구 사양을 충족해야 하며, 실습에 사용할 Loupe Browser*를 사전에 설치해 주시길 바랍니다.
 * Loupe Browser 다운로드 및 설치 안내:
 https://www.10xgenomics.com/support/software/loupe-browser/downloads
ㅇ 시스템 요구사항 (Windows)
 - Windows 10 (64-bit) or later
 - 16GB RAM
 - SSD storage highly recommended
 - Updated video/display drivers recommended
 - 100% scaling display setting recommended 
ㅇ 시스템 요구사항 (macOS)
 - macOS 10.15 (Catalina) or later
 - 16GB RAM
 - SSD storage highly recommended
 - Default display settings recommended


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