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Celemics Library Preparation Kit (LP/EP) | 셀레믹스 NGS 라이브러리 준비 키트 (제품 페이지 바로가기)

Celemics Library Preparation Kit (LP/EP) | 셀레믹스 NGS 라이브러리 준비 키트 (제품 페이지 바로가기)

Celemics Library Preparation Kit는 셀레믹스의 NGS Target Enrichment Panel 외 다양한 공급업체의 NGS Panel 및 시퀀싱 플랫폼에도 호환성이 높아 효율적으로 사용가능합니다. Standard Library Preparation Kit (LP Kit) 및 Enzymatic Preparation Kit (EP Kit)는 End-repair, A-tailing Enzyme Mix 외 최적화된 인덱스 프라이머(Index Primers), 어댑터(Adapters), 버퍼(Buffers) 등 필요한 모든 시약으로 구성되어 있습니다.

• 고효율 라이브러리 준비에 필요한 최적화된 Enzyme
• 따라하기 쉬운 간편한 실험 프로토콜
• ISO 품질 시스템 하에서 생산되어 반복 실험에도 높은 재현성
• 다양한 공급 업체의 NGS 패널 및 시퀀싱 플랫폼에 호환 가능

셀레믹스는 Illumina, MGI, Thermo Fisher(Ion Torrent)사의 NGS 시퀀싱 플랫폼별로 최적화된 라이브러리 제작 키트(Library Preparation Kit)를 공급합니다.
Library Preparation Kit는 각 시퀀싱 플랫폼별로 두 가지(LP, EP) 방식으로 구성되어 있습니다.

1. Library Preparation Kit (LP)
LP 키트는 이미 단편화된 DNA* 또는 cfDNA와 같이 길이가 시퀀싱 장비에 알맞은 상태일 때 사용하는 키트입니다.플랫폼에 따라 약간의 차이가 있지만 보통 아래와 같은 과정으로 DNA Library를 제작합니다. *일반적으로 Sonication 또는 Enzyme을 이용한 Fragmentation 방법을 이용합니다.

• End Repair/A-tailing (ER/A)
  단편화된 DNA는 Sticky end를 가지고 있는 경우가 많습니다. 이 과정은 Sticky end를 Blunt end로 만든 후 3’ 말단에 dA base를 하나 붙여주는 과정입니다. 
  합성된 dA base는 다음 과정인 Adapter Ligation에서 이용됩니다. 단, ThermoFisher(Ion Torrent)에서는 A-tailing 과정은 진행하지 않습니다.
• Adapter Ligation
  1번 과정을 통해 말단 처리된 DNA들에 각 시퀀싱 플랫폼에 사용할 수 있는 Adapter를 붙이는 과정입니다. MGI, Thermo Fisher(Ion Torrent) 플랫폼은 이 과정에서 샘플을 구별할 수 있는 Index를 붙여줍니다. 
• Purification
  ER/A, Adapter Ligation 과정 이후 남아있는 Enzyme들과 Buffer를 제거하는 정제 과정입니다.
• PCR
  ER/A, Ligation Process를 거쳐 정상적으로 NGS Library의 형태를 지니는 DNA 조각들만을 선별하기 위해 PCR을 수행합니다. Illumina 플랫폼은 이 과정에서 샘플을 구별할 수 있는 Index 서열을 붙여줍니다.
• Purification
  PCR 과정 이후 남아있는 Enzyme들과 Buffer를 제거하는 정제과정입니다.
  
  

2. Library Preparation Kit (EP)
EP 키트는 단편화가 되지 않은 DNA를 단편화와 동시에 Library Prep을 할 수 있는 키트입니다. 플랫폼에 따라 약간의 차이가 있지만 보통 아래와 같은 과정으로 DNA Library를 제작합니다.

• Fragmentation/End Repair/A-tailing (FER/A)
  Genomic DNA와 같이 큰 DNA들을 Short-read NGS 플랫폼에서 사용하려면 반드시 단편화 과정을 거쳐야 합니다. EP Kit는 FER/A 반응에 Fragmentase가 포함되어 Fragmentation, End Repair, A-tailing 세 가지 반응을 동시에 수행합니다. *본 과정에서 Thermo Fisher(Ion Torrent) 플랫폼의 경우 A-tailing 과정은 진행하지 않습니다.
• Adapter Ligation
  1번 과정을 통해 말단 처리가 된 DNA들에 각 시퀀싱 플랫폼에 사용할 수 있는 Adapter를 붙이는 과정입니다. MGI, Thermo Fisher(Ion Torrent)의 플랫폼은 이 과정에서 샘플을 구별할 수 있는 Index를 붙여줍니다.
• Purification
  FER/A, Adapter Ligation 과정 이후 남아있는 Enzyme들과 Buffer를 제거하는 정제 과정입니다.
• PCR
  FER/A, Ligation Process를 거쳐 정상적으로 NGS library 의 형태를 지니는 DNA 조각들만을 선별하기 위해 PCR을 수행합니다. Illumina 플랫폼은 이 과정에서 샘플을 구별할 수 있는 Index 서열을 붙여줍니다.
• Purification
  PCR 과정 이후 남아있는 Enzyme들과 Buffer를 제거하는 정제과정입니다.

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