자세한 내용은 홈페이지 참조 (https://sites.google.com/view/cnu-epigeneticslab)

모집 대상
후성유전체 데이터 (Transcriptome, Epigenome, RNA-Protein Interactome) 분석 기반 연구에 관심 및 경험이 있는 지원자

연구분야
후성유전학 (Epigenetics)은 다양한 외부변화 및 자극에 의해 DNA 염기서열의 변화 없이 유전체 상에 발생하는 다양한 화학적 변화에 따른 유전자 발현 조절과 전사 후 조절 변화를 일으키는 기전을 이해하는 학문입니다. 또한 이러한 후성유전적 변화의 인과관계에 따른 정상적인 생물학적 경로 및 질병을 유발하는 다양한 기전을 이해하는 학문입니다.

본 연구실에서는 연구 목적에 따라 embryonic stem cells, induced pluripotent stem cells (iPSCs), primary cultured neurons, mouse disease models 등의 동물 시스템에서 다양한 분자·생화학적, 전유전체적 (Transcriptome 및 Epigenome), 전단백체적 (Mass-spec 기반 분석) 및 동물행동학적 분석법과 같은 다학제적인 접근법들을 사용한 포괄적인 분석을 통해 중요한 생명과학적 질문을 해결해 갑니다.

(1) 후성유전학적 조절기작에서 enhancer RNAs (eRNAs), microRNAs (miRNAs), circular RNAs (circRNAs)와 같은 다양한 기능적 조절 ncRNAs (functional regulatory non-coding RNAs)의 기능적 다이내믹스 이해.
(2) 세포내 다양한 condensates를 유발하는 조절 ncRNAs 및 결합 단백질들의 역할 이해.
(3) ncRNAs 및 후성조절인자들 상의 변형/ 탈변형 (modifications/ de-modifications) 기능 이해.
(4) 히스톤 코드 상호작용 및 다이내믹스의 기능적 조절기작 이해.

Selected Papers (대표논문)

• Hyohi Lee1, Myunggeun Oh1, Jiin Moon1, Yeonju Jang, Seunghwa Jeong, Min Hee Lee, Dahun Um, Daeyoup Lee, Tae-Kyung Kim, Seung-Kyoon Kim* (Corresponding*),  Temporal dynamics of intragenic enhancer RNAs regulate Lin28a expression in response to external stimuli in embryonic stem cells.   

 Nucleic Acids Res,. 2026 In Press (IF: 15.0/ 5Y IF: 17.6, 상위 3.1%)

• Jiin Moon1, Hyohi Lee1, Myunggeun Oh1, Yeonju Jang, Dahun Um, Tae-Kyung Kim, Seung-Kyoon Kim* (Corresponding*),  Embryonic stem cell-specific intragenic enhancer RNA essential for NSUN2-mediated stem cell fate regulation.   

 Int J Biol Macromol [BIOMAC]. 2025 Jun 23;319(Pt 3):145470 (IF: 8.50/ 5Y IF: 8.70, 상위 5.90%)

• V Gorbovytska1, Seung-Kyoon Kim1, F Kuybu, M Götze, D Um, K Kang, A Pittroff, L-M Schneider, A Leitner, Tae-Kyung Kim*, Claus-Dieter Kuhn* (1Co-first),  Enhancer RNAs stimulate Pol II pause release by harnessing multivalent interactions to NELF.   

 Nat Commun., 2022 May 4;13(1):2429.  (IF: 17.69/ 5Y IF: 17.76, 상위 7.43%) 

• Seung-Kyoon Kim1, X Liu1, J Park, D Um, G Kilaru, C-M Chiang, M Kang, K M Huber, Keunsoo Kang*, Tae-Kyung Kim*,  Functional coordination of BET family proteins underlies altered transcription associated with memory impairment in Fragile X syndrome.  

 Sci. Adv., 2021 May 19; 7(21): eabf7346.(IF: 14.98/ 5Y IF: 16.9, 상위 8.78%) 

• Seung-Kyoon Kim1, H Lee1, K Han, S C Kim, Y Choi, S-W Park, G Bak, Y Lee, J K Choi, Tae-Kyung Kim, Yong-Mahn Han*, Daeyoup Lee*,  SET7/9 methylation of the pluripotency factor LIN28A is a nucleolar localization mechanism that blocks let-7 biogenesis in human ESCs. 

 Cell Stem Cell., 2014 Dec; 15; 735 - 749.  (IF: 22.15/ 5Y IF: 24.56, 상위 2.60%)

• Inkyung Jung1, Seung-Kyoon Kim1, Mirang Kim1, Yong-Mahn Han, Yong Sung Kim, Dongsup Kim*, Daeyoup Lee* (1Co-first),  H2B mono-ubiquitylation is a 5’-enriched active transcription mark and correlates with exon-intron structure in human cells.  

 Genome Res., 2012 Jun; 22 (6): 1026 - 1035.  (IF: 14.39/ 5Y IF: 14.39, 상위 2.70%) 

Bric 링크
https://www.ibric.org/bric/hanbitsa/treatise.do?mode=author-treatise-list&srAuthorId=22311

대표 연구과제
한국연구재단  (NRF)/ 과기부/ 개인기초연구사업- 우수신진연구 (생명과학단)

한국연구재단  (NRF)/ 과기부/ 바이오·의료기술개발 사업- 차세대바이오 사업

한국연구재단  (NRF)/ 과기부/ 집단연구사업- 국가연구소 (NRL2.0)