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질문 단백질 추출 통해 나온 추출물 단백질들은 structure 형태인가요? 아니면 origin ? 형태인가요?
알실험방죽돌이(대학원생)  |  03.21 01:47
갓 입학한 석사생 입니다.....ㅎㅎ
학부전공이랑 다른 전공으로와서 많이 헤매는 중입니다. 도와주세요 선배님들...ㅠㅠ

우선 제가 사용하고 있는 생물은 히드라입니다. 그리고 추출에 사용하는 시약은 시그마의 tri reagent 입니다. (성분은 똑같은데 이름만 다른 trizol 도 있더라구요)

실험 목표는 히드라에서 단백질을 추출해서 들어있는 단백질의 분자량과 여러 특성을 알아보려는데요.
목표하고있는 단백질은 논문검색을 통해 서열들을 알아봤습니다.
그런데...논문에서는 structure라는 표현으로 아미노산 서열이 길어야 15개? 정도인데 비해, NCBI에서보여지는 origin 아미노산 서열은 짧게는 40~60개 정도?로 길더군요..
확인하려는 단백질들의 분자량을 환산해보았을때, structure 는 커봐야 3kDa 가 나오는데, origin은 5~40 kDa 가 나옵니다.
(제 생각에는 히드라가 가진 단백질의 크기는 70kDa를 넘지 않을것같습니다.)
SDS-PAGE를 내리려는데 marker들은 보통 10kDa~240kDa 범위를 가지고 있더라구요...
찾아보니 Tricine-SDS PAGE protocol을 이용하면 20kDa 이하의 단백질도 확인이 가능하다는 것도 알았습니다.
우선 gradient gel 을 이용해볼 생각이긴 하지만, marker 선택을 해야해서.......

*** tri reagent 로 추출한 단백질들이 structure 형태로 있는지, origin형태로 나오는건지....잘모르겠습니다.(origin이라는 개념도 명확하지 않아서 잘 모르겠습니다.) 
SDS-PAGE를 내릴 때, marker 의 범위를 어디로 잡아야 할지 알려주시면 감사하겠습니다.









#단백질추출
#structure
#origin
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