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한규동
한규동 (Kyudong Han) 저자 이메일 보기
Louisiana State University
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조회 8023  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Mobile DNA in Old World Monkeys: A Glimpse Through the Rhesus Macaque Genome
Kyudong Han,1* Miriam K. Konkel,1* Jinchuan Xing,1*{dagger} Hui Wang,1* Jungnam Lee,1 Thomas J. Meyer,1 Charles T. Huang,1 Erin Sandifer,1 Kristi Hebert,1 Erin W. Barnes,1 Robert Hubley,2 Webb Miller,3 Arian F. A. Smit,2 Brygg Ullmer,4 Mark A. Batzer1{ddagger}

The completion of the draft sequence of the rhesus macaque genome allowed us to study the genomic composition and evolution of transposable elements in this representative of the Old World monkey lineage, a group of diverse primates closely related to humans. The L1 family of long interspersed elements appears to have evolved as a single lineage, and Alu elements have evolved into four currently active lineages. We also found evidence of elevated horizontal transmissions of retroviruses and the absence of DNA transposon activity in the Old World monkey lineage. In addition, 100 precursors of composite SVA (short interspersed element, variable number of tandem repeat, and Alu) elements were identified, with the majority being shared by the common ancestor of humans and rhesus macaques. Mobile elements compose roughly 50% of primate genomes, and our findings illustrate their diversity and strong influence on genome evolution between closely related species.

1 Department of Biological Sciences, Biological Computation and Visualization Center, Center for Bio-Modular Multi-Scale Systems, Louisiana State University, Baton Rouge, LA 70803, USA.
2 Institute for Systems Biology, Seattle, WA98103, USA.
3 Center for Comparative Genomics and Bioinformatics, Pennsylvania State University, University Park, PA 16802, USA.
4 Department of Computer Science, Center for Computation and Technology (CCT), Louisiana State University, Baton Rouge, LA70803, USA.

* These authors contributed equally to this work.

{dagger} Present address: Department of Human Genetics, University of Utah Health Sciences Center, Salt Lake City, UT 84112, USA

{ddagger} To whom correspondence should be addressed.

THIS ARTICLE HAS BEEN CITED BY OTHER ARTICLES :
Evolutionary and Biomedical Insights from the Rhesus Macaque Genome.
Rhesus Macaque Genome Sequencing and Analysis Consortium:Kyudong Han, Jungnam Lee, Young H. Kim et al. (2007) Science 316, 222-234
논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2007년 04월 (BRIC 등록일 2007-04-13)
- 연구진: 국외연구진
- 분야: 생물학관련 모든분야
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1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 간단히 설명 2006년 1월에 Old World monkey lineage에 속하는 Rhesus Macaque genome sequence (rheMac2)가 BLAT과 ENSEMBL web sever를 통해 공개되었습니다. Rhesus macaque (Macaca mulatta)는 인간 질병 연구에 있어 중요한 역할을 하고 있습니다. 그 이유 중 하나가 인간 HIV/AIDS 질병 백신 개발을 위한 동물 모델로서 가장 적합한 biological source이기 때문입니다. 또한 nonhuman primate 통한 biomedical 연구에 있어 rhesus macaque이 18%를 차지하고 있습니다. 이번 rhesus macaque genome seq...
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