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이주석
이주석 (Ju-Seog Lee) 저자 이메일 보기
National Institutes of Health
 
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Classification and prediction of survival in hepatocellular carcinoma by gene expression profiling
Ju-Seog Lee 1, In-Sun Chu 1, Jeonghoon Heo 1, Diego F. Calvisi 1, Zongtang Sun 2, Tania Roskams 3, Anne Durnez 3, Anthony J. Demetris 4, Snorri S. Thorgeirsson 1 *

1Laboratory of Experimental Carcinogenesis, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Bethesda, MD
2National Laboratory of Molecular Oncology, Cancer Institute, Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing, China
3Departments of Morphology and Molecular Pathology and Hepatology, University of Leuven, Leuven, Belgium
4Thomas E. Starzl Transplant Institute, University of Pittsburgh Medical Center, Pittsburgh, PA
*Correspondence to Snorri S. Thorgeirsson, Laboratory of Experimental Carcinogenesis, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Bethesda, MD 20892-4255
fax: (301) 496-0734

Abstract
We analyzed global gene expression patterns of 91 human hepatocellular carcinomas (HCCs) to define the molecular characteristics of the tumors and to test the prognostic value of the expression profiles. Unsupervised classification methods revealed two distinctive subclasses of HCC that are highly associated with patient survival. This association was validated via 5 independent supervised learning methods. We also identified the genes most strongly associated with survival by using the Cox proportional hazards survival analysis. This approach identified a limited number of genes that accurately predicted the length of survival and provides new molecular insight into the pathogenesis of HCC. Tumors from the low survival subclass have strong cell proliferation and antiapoptosis gene expression signatures. In addition, the low survival subclass displayed higher expression of genes involved in ubiquitination and histone modification, suggesting an etiological involvement of these processes in accelerating the progression of HCC. In conclusion, the biological differences identified in the HCC subclasses should provide an attractive source for the development of therapeutic targets (e.g., HIF1a) for selective treatment of HCC patients. Supplementary material for this article can be found on the HEPATOLOGY Web site (http://interscience.wiley.com/jpages/0270-9139/suppmat/index.html) (HEPATOLOGY 2004;40:667-676.)

Received: 8 April 2004; Accepted: 5 May 2004

Digital Object Identifier (DOI)
10.1002/hep.20375  About DOI

Additional Material
This article includes Supplementary Notes, Tables, and Figures available at http://www.interscience.wiley.com/jpages/0270-9139/suppmat

저자코멘트
The link below directs to the editorial comment on my published work in the same issue of Hepatology. It provides different view of my works that will also be very useful to oncologists/clinicians or someone who is very much interested in microarray studies of human cancer in regard of its clinical implication.
Editorials, "A new way to look at liver cancer" :
http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/abstract/109606306/ABSTRACT

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2004년 09월 (BRIC 등록일 2004-09-08)
- 연구진: 국외연구진
- 분야: Cancer Biology/Oncology, Genomics, Systems Biology
- 추천: 임선희 (동아대학교, 화학생명과학부, 조교수)
- 추천사유: 제가 미국 NCI에 파견 나갔을 때 위 그룹의 3명의 한국과학자들이 열심히 연구하였던 것을 기억합니다. 원래는 Nature Medicine에 투고하였으나 훌륭한 결과라는 것은 인정하면서도 2003년 초에 Liver cancer와 연관된 microarray 결과가 이미 Nature Medicine에 보고되어 게재할 수 없다는 이유로 Hepatology에 투고한 것으로 알고 있습니다.
또한 위의 첫번째, 두번째, 세번째의 3명의 한국 연구자들은 이 그룹에서 liver cancer와 stem cell과 관련된 다수의 훌륭한 업적들도 곧 소개될 것으로 알고 있습니다.
이 논문을 특별히 추천하는 것은 국내에서 이와 같은 논문이 많이 시도되었으나, 실제 수준있는 저널에 실리지 못하고 있습니다. 그의 큰 이유로는 마이크로 어레이의 고가로 인한 제한된 샘플이 문제가 되기도 하고 분석에 있기도 합니다. 그에 비해 이 논문은 놀랄만한 샘플 수를 사용하고 거기에 통계적 분석도 전문적인 통계학자에 의해 이루어져 국내에서 모범이 되는 연구논문이 될 것으로 사료됩니다. 특히 우리나라는 Liver Caner가 심각하게 문제되는 곳이므로 많은 연구자들에게 도움이 될 것으로 사료됩니다.

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