[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
랩박스 - Neuroscience
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
전체보기 추천논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
김상욱
김상욱 (Sanguk Kim) 저자 이메일 보기
POSTECH
 
조회 621  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Divergence of non-coding regulatory elements explains gene-phenotype differences between human and mouse orthologous genes
열기 Authors and Affiliations

Abstract
Mice have been widely used as a model organism to investigate human gene-phenotype relationships based on a conjecture that orthologous genes generally perform similar functions and are associated with similar phenotypes. However, phenotypes associated with orthologous genes often turn out to be quite different between human and mouse. Herein, we devised a method to quantitatively compare phenotypes annotations associated with mouse models and human. Using semantic similarity comparisons, we identified orthologous genes with different phenotype annotations, of which the similarity score is on a par with that of random gene pairs. Analysis of sequence evolution and transcriptomic changes revealed that orthologous genes with phenotypic differences are correlated with changes in non-coding regulatory elements and tissue-specific expression profiles rather than changes in protein-coding sequences. To map accurate gene-phenotype relationships using model organisms, we propose that careful consideration of the evolutionary divergence of non-coding regulatory elements and transcriptomic profiles is essential.

Keywords: Gene-phenotype relationship, Mouse model, Orthologous gene, non-coding regulatory element, transcriptomic profile
논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2018년 04월 (BRIC 등록일 2018-04-26)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Evolution, Bioinformatics
관련 보도자료
http://www.ksmnews.co.kr/default/index_view_page.php?idx=207371&part_idx=289
CRISPR-BetaBinomial(CB2) 기법을 이용한 CRISPR pooled screen data 분석[Genome Res.]
정현환
발표: 정현환 (Baylor College of Medicine, Texas C...)
일자: 2019년 6월 26일 (수) 오전 10시 (한국시간)
언어:
참석자 접수신청하기

  댓글 0
등록
 
Springer Nature
관련링크
김상욱 님 전체논문보기 >
관련인물
김동효 (POSTECH)
김은정 (POSTECH)
김인해 (POSTECH)
김종경 (EMBL-EBI)
김진호 (삼성서울병원)
박솔잎 (EMBL/Center for Genomic R...)
서상우 (서울대학교)
양재성 (POSTECH)
이동욱 (POSTECH)
이승재 (POSTECH)
이윤태 (POSTECH)
정규열 (POSTECH)
한성규 (POSTECH)
황인환 (POSTECH)
관련분야 논문보기
Evolution

Bioinformatics

외부링크
Google (by Sanguk Kim)
Pubmed (by Sanguk Kim)
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
[재직자 무료교육] 의약품 GMP 품질관리 실무(2일과정)
[재직자 무료교육] 의약품 GMP 품질관리 실무(2일과정)
사전접수: ~2019.07.10
날짜: 2019.07.11~12
장소: 청주시 흥덕구 오송생명1로 194-41 충북산학융합본부
CamBioScience CRISPR/Organoid Workshop
CamBioScience CRISPR/Organoid Workshop
날짜: 2019.08.01~09
장소: 경상남도 양산시 물금읍 부산대학교 양산캠퍼스 첨단의생명융합센터
[BRIC Webinar]초짜 대학원생을 위한 연구방법론-배현진 (울산대학교 의과대학)
생물정보 빅데이터 분석 UCC 공모전
생물정보 빅데이터 분석 UCC 공모전
날짜: 2019.08.22
주관: K-Genome 유전체빅데..
[BRIC Webinar]CRISPR-BetaBinomial(CB2) 기법을 이용한 CRISPR pooled screen data 분석-정현환 (Baylor College of Medicine, Texas Children’s Hospital)
대구경북과학기술원(DGIST) 뇌·인지과학전공 3-DAY INTENSE BRAIN BOOTCAMP
대구경북과학기술원(DGIST) 뇌·인지과학전공 3-DAY INTENSE BRAIN BOOTCAMP
사전접수: ~2019.06.30
날짜: 2019.07.10~12
장소: 대구경북과학기술원 (DGIST) 뇌·인지과학전공
[대졸 미취업자]바이오QC 실무과정 7기 모집
[대졸 미취업자]바이오QC 실무과정 7기 모집
날짜: 2019.09.02~06.12
장소: 성남시 분당구 황새울로 329번길 5
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아