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김형표
김형표 (Hyoung-Pyo Kim) 저자 이메일 보기
연세대학교 의과대학
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Epigenome mapping highlights chromatin-mediated gene regulation in the protozoan parasite Trichomonas vaginalis

Song MJ1,2, Kim M1, Choi Y1,3, Yi MH1, Kim J1, Park SJ1, Yong TS1, Kim HP1,2,3

1Department of Environmental Medical Biology, Institute of Tropical Medicine, Yonsei University College of Medicine, Seoul, 03722, Korea.
2Graduate Program of Nano Science and Technology, Yonsei University College of Medicine, Seoul, 03722, Korea.
3BK21 PLUS Project for Medical Science, Yonsei University College of Medicine, Seoul, 03722, Korea.

Abstract
Trichomonas vaginalis is an extracellular flagellated protozoan parasite that causes trichomoniasis, one of the most common non-viral sexually transmitted diseases. To survive and to maintain infection, T. vaginalis adapts to a hostile host environment by regulating gene expression. However, the mechanisms of transcriptional regulation are poorly understood for this parasite. Histone modification has a marked effect on chromatin structure and directs the recruitment of transcriptional machinery, thereby regulating essential cellular processes. In this study, we aimed to outline modes of chromatin-mediated gene regulation in T. vaginalis. Inhibition of histone deacetylase (HDAC) alters global transcriptional responses and induces hyperacetylation of histones and hypermethylation of H3K4. Analysis of the genome of T. vaginalis revealed that a number of enzymes regulate histone modification, suggesting that epigenetic mechanisms are important to controlling gene expression in this organism. Additionally, we describe the genome-wide localization of two histone H3 modifications (H3K4me3 and H3K27Ac), which we found to be positively associated with active gene expression in both steady and dynamic transcriptional states. These results provide the first direct evidence that histone modifications play an essential role in transcriptional regulation of T. vaginalis, and may help guide future epigenetic research into therapeutic intervention strategies against this parasite.

논문정보 F1000선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2017년 03월 (BRIC 등록일 2017-04-07)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Genomics
- 추천: Faculty of 1000 Biology
- 추천사유: F1000Prime Recommendations, Dissents and Comments for [Song MJ et al., Sci Rep 2017, 7:45365]. In F1000Prime, 07 Apr 2017; F1000Prime.com/727446647
CRISPR-BetaBinomial(CB2) 기법을 이용한 CRISPR pooled screen data 분석[Genome Res.]
정현환
발표: 정현환 (Baylor College of Medicine, Texas C...)
일자: 2019년 6월 26일 (수) 오전 10시 (한국시간)
언어:
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