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김태완
김태완 (Taewan Kim) 저자 이메일 보기
The University of Texas MD Anderson Cancer Center
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Role of MYC-Regulated Long Noncoding RNAs in Cell Cycle Regulation and Tumorigenesis

Taewan Kim*, Young-Jun Jeon*, Ri Cui, Ji-Hoon Lee, Yong Peng, Sung-Hak Kim, Esmerina Tili, Hansjuerg Alder and Carlo M. Croce

Affiliations of authors: Department of Molecular and Cellular Oncology, The University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston, TX (TK); Department of Molecular Virology, Immunology and Medical Genetics (TK, YJJ, RC, ET, HA, CMC), Department of Neurological Surgery (SHK), and Department of Anesthesiology (ET), Wexner Medical Center, The Ohio State University, OH; School of Biological Sciences, Seoul National University and National Creative Research Initiative Center for Symbiosystem, Seoul, Republic of Korea (JHL); State Key Laboratory of Biotherapy/Collaborative Innovation Center of Biotherapy, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu, China (YP); School of Life Sciences and Biotechnology, Korea University, Republic of Korea (SHK).

*Authors contributed equally to this work.
Correspondence to: Carlo M. Croce, MD, 1082 BRT, 460 West 12th Ave, Columbus, OH 43210

Abstract

Background: The functions of long noncoding RNAs (lncRNAs) have been identified in several cancers, but the roles of lncRNAs in colorectal cancer (CRC) are less well understood. The transcription factor MYC is known to regulate lncRNAs and has been implicated in cancer cell proliferation and tumorigenesis.

Methods: CRC cells and tissues were profiled to identify lncRNAs differentially expressed in CRC, from which we further selected MYC-regulated lncRNAs. We used luciferase promoter assay, ChIP, RNA pull-down assay, deletion mapping assay, LC-MS/MS and RNA immunoprecipitation to determine the mechanisms of MYC regulation of lncRNAs. Moreover, soft agar assay and in vivo xenograft experiments (four athymic nude mice per group) provided evidence of MYC-regulated lncRNAs in cancer cell transformation and tumorigenesis. The Kaplan-Meier method was used for survival analyses. All statistical tests were two-sided.

Results: We identified lncRNAs differentially expressed in CRC (P < .05, greater than two-fold) and verified four lncRNAs upregulated and two downregulated in CRC cells and tissues. We further identified MYC-regulated lncRNAs, named MYCLos. The MYC-regulated MYCLos may function in cell proliferation and cell cycle by regulating MYC target genes such as CDKN1A (p21) and CDKN2B (p15), suggesting new regulatory mechanisms of MYC-repressed target genes through lncRNAs. RNA binding proteins including HuR and hnRNPK are involved in the function of MYCLos by interacting with MYCLo-1 and MYCLo-2, respectively. Knockdown experiments also showed that MYCLo-2, differentially expressed not only in CRC but also in prostate cancer, has a role in cancer transformation and tumorigenesis.

Conclusions: Our results provide novel regulatory mechanisms in MYC function through lncRNAs and new potential lncRNA targets of CRC.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2015년 04월 (BRIC 등록일 2018-05-14)
- 연구진: 국내+국외 연구진
- 분야: Cancer Biology/Oncology, Molecular_Biology, Genomics
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  댓글 5
회원작성글 김성학  (2015-02-13 02:26)
김박사! 또 한건 했구만... 도대체 논문을 몇개나 내는거야.ㅎㅎ 축하해. 건강 잘 챙기고.
회원작성글 Serendipity  (2015-02-20 06:04)
수고했어~~~
회원작성글 김연희  (2015-03-20 11:07)
반가운 이름이길래 혹시나 해서 클릭했더니...역시나..ㅎㅎ 축하하오~ 한국엔 안 들오는가???
회원작성글 TW  (2015-07-15 06:46)
다들 감사 드립니다.
회원작성글 HMC  (2015-07-28 01:44)
Thanks a lot for the CMC comment
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