[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
BRIC Top5
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
전체보기 추천논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
김진호
김진호 (Jinho Kim) 저자 이메일 보기
POSTECH
  인터뷰보기 
조회 5069  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Rewiring of PDZ Domain-Ligand Interaction Network Contributed to Eukaryotic Evolution

Jinho Kim1, Inhae Kim1, Jae-Seong Yang2, Young-Eun Shin1, Jihye Hwang3, Solip Park2, Yoon Sup Choi4, Sanguk Kim1,2,3*

1 Division of Molecular and Life Science, Pohang University of Science and Technology, Pohang, Korea, 2 School of Interdisciplinary Bioscience and Bioengineering, Pohang University of Science and Technology, Pohang, Korea, 3 Division of ITCE, Pohang University of Science and Technology, Pohang, Korea, 4 Cancer Research Institute, Seoul National University, Seoul, Korea

Abstract
PDZ domain-mediated interactions have greatly expanded during metazoan evolution, becoming important for controlling signal flow via the assembly of multiple signaling components. The evolutionary history of PDZ domain-mediated interactions has never been explored at the molecular level. It is of great interest to understand how PDZ domain-ligand interactions emerged and how they become rewired during evolution. Here, we constructed the first human PDZ domain-ligand interaction network (PDZNet) together with binding motif sequences and interaction strengths of ligands. PDZNet includes 1,213 interactions between 97 human PDZ proteins and 591 ligands that connect most PDZ protein-mediated interactions (98%) in a large single network via shared ligands. We examined the rewiring of PDZ domain-ligand interactions throughout eukaryotic evolution by tracing changes in the C-terminal binding motif sequences of the PDZ ligands. We found that interaction rewiring by sequence mutation frequently occurred throughout evolution, largely contributing to the growth of PDZNet. The rewiring of PDZ domain-ligand interactions provided an effective means of functional innovations in nervous system development. Our findings provide empirical evidence for a network evolution model that highlights the rewiring of interactions as a mechanism for the development of new protein functions. PDZNet will be a valuable resource to further characterize the organization of the PDZ domain-mediated signaling proteome.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2012년 02월 (BRIC 등록일 2012-02-10)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Genetics
관련 인터뷰
1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드비교유전학은 인간 유전체 프로젝트로 대표되는 유전체 시퀀싱 기술이 발달하면서 함께 발전한 학문입니다. 비교유전학은 유전자들의 기능과 역할에 대한 많은 궁금증을 풀어냈으며 병원균의 독성 유전자를 밝히는 등 인간의 삶의 질 향상에도 많은 이바지를 했습니다.그러나 최근 비교유전학 분야는 급속한 패러다임의 변화를 겪고 있다고 생각합니다. 유전자는 혼자서 활동하는 것이 아니라 다른 유전자와의 상호작용을 통해서 활동합니다. 따라서 유전자들 사이의 상호작...
관련 보도자료
생체회로의 네트워크 구축․신경질환 발생 메커니즘 규명...POSTECH 김상욱 교수팀
 ‘웹상에서 개인 또는 집단 사이에 상호의존적인 관계를 통해 만들어지는 관계 구조’를 의미하는 소셜네트워크*1의 분석방법을 통해 간질 등 신경질환을 일으키는 치명적인 유전자 이상을 예측할 수 있다는 연구결과가 나와 학계의 눈길을...
  댓글 0
등록
 
목록
한국유전체학회
관련링크
김진호 님 전체논문보기 >
관련인물
김상욱 (POSTECH)
남석진 (성균관대학교 의과대학)
박연희 (성균관대학교 의과대학, 삼...)
박웅양 (성균관대학교 의과대학, 삼...)
이수현 (Pfizer Oncology)
관련분야 논문보기
Genetics

외부링크
Google (by Jinho Kim)
Pubmed (by Jinho Kim)
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
바이오 QC 실무과정 6기 모집
바이오 QC 실무과정 6기 모집
사전접수: ~2019.01.07
날짜: 2019.03.04~12.09
장소: 성남시 분당구 황새울로 329번길 5
임상시험종사자 생체시료분석법 이해, 생물학적동등성시험의 이해
임상시험종사자 생체시료분석법 이해, 생물학적동등성시험의 이해
사전접수: ~2018.12.20
날짜: 2018.12.20~21
장소: 한국제약바이오협회 강의장 / 이매스교육센터
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아