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질문 막단백질의 구조?
개구리절대교주(과기인)  |  02.11 15:48

일단 테크닉 질문이 아닌점 이해해 주시면 감사하겠습니다.

NCBI에서 찾은 단백질이 막 단백질인 경우 멤브레인에서 펩타이드 시퀀스 몇번부터 볓번까지는 내부에, 막에 낀 부분, 막 밖에 있는지를 알고 싶습니다.

이러한 것을 보는 사이트가 있다고는 하는데 어디인지 모르겠습니다.

입체적 구조로 어디서 어디까지 막을 왔다 갔다 하는 것인지를 알고 싶습니다.

이렇것을 조회할 수 있는 사이트가 있으면 알려주시면 감사하겠습니다.

원하는 단백질은 다음과 같습니다.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_033135.2

#NCBI
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

연구가 끝난 단백질의 경우 정확히 밝혀져 있지만 그렇지 않은 경우 프로그램으로

예측하는 수 밖에 없습니다.

아래 사이트에서 예측 가능합니다.

그외 transmembrane 예측 site가 여러군데 있는데 여러개의 site에서 예측해서 공통

결과를 분석해 보는것이 좋을 겁니다.

http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/

http://www.enzim.hu/hmmtop/html/submit.html

금개구리SPEED  |  02.11 16:21  

제가 이 분야 연구를 하지 않아서 도움이 될 지 모르겠지만
receptor에 대해서는 알 수 있는 사이트들이 있어서 올려둘께요
그렇지만 도움이 될 지는 잘 모르겠어요 ㅠ.ㅠ


https://www.proteinatlas.org/ENSG00000196218-RYR1/tissue

http://www.guidetopharmacology.org/GRAC/ObjectDisplayForward?objectId=747

개구리Q.E.D.  |  02.12 03:09  
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