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 전체 > Molecular Biology-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR
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질문 primer design 도와주세요~~~
알옷궤짝이다(대학생)  |  2018.03.11 16:14
primer design을 해야하는데 그냥 제가 마음대로 ATGC를 조합해서 만드는 건가요 아니면 유용유전자의 염기서열에서 "여기서부터 여기까지 primer로 해야지"
이건가요..??ㅜㅜ 아니면 유용유전자 염기서열에서 3염기씩 선택해서 조합해서 만드는건가요??ㅜㅠㅠㅠㅠ도와주세요 ㅠㅠㅠㅠㅠㅠㅠ
#Primer
 
#PCR
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

Primer는 target 유전자의 서열에 상보적으로 결합하는 sequence에서 도출하는 것으로,
유전자에서 증폭을 원하는 부분의 서열을 따라, 앞/뒤 (5', 3') 에서 도출하시면 됩니다.
지금 마음대로 조합을 한다고 하시는거 보니, 아직 PCR의 개념을 잘 모르시는것 같아요~
구글이나 네이버에 PCR 원리만 검색하셔도 자료가 많이 나올테니,
그걸 보시면 원리가 이해가 잘 되실겁니다.

즉... 말씀하고계시는 유용유전자 (타겟)의 염기서열에서, 증폭하고자 하는 구간의
염기서열을 보시고,
거기에 상보적으로 결합하는 염기서열로 5'에서 3'방향으로 만드시면 됩니다.

어려우시다면, primer sequence 도출하는 web site가 많이 있으니,
거기에 타겟 유전자 서열을 넣으셔도 됩니다.  

개구리곰돌2  |  2018.03.12   
ㅜㅜ자세한답변 너무 감사합니다ㅜㅜ
제가 학부생이라서 아직 많은 지식과 정보가 없어서 그만 ㅜㅜ
그런데 상보적으로 결합하는 염기서열로 5' 에서 3' 방향으로 만들라는 거는 자세하게 어떤 의미인가요?? 혹시 예시가 있을까요?ㅜㅜ
알옷궤짝이다  |  2018.03.12   
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.
ㅜㅜ자세한답변 너무 감사합니다ㅜㅜ
제가 학부생이라서 아직 많은 지식과 정보가 없어서 그만 ㅜㅜ
그런데 상보적으로 결합하는 염기서열로 5' 에서 3' 방향으로 만들라는 거는 자세하게 어떤 의미인가요?? 혹시 예시가 있을까요?ㅜㅜ



-->  DNA는 이중나선으로 2개의 가닥의 염기가 수소결합을 통해

상보적으로 결합하고 있는것 아시죠~? 이때에 DNA가 합성될때
새로운 염기가 오는 방향이 5'쪽에서 3'이라, 염기서열을 적을 때에는
5'부터 3'방향으로 적습니다.

개구리곰돌2  |  2018.03.12   
손으로 계산해도 되지만,
간단하게 계산해 주는 웹사이트들 많습니다.
구글에서 primer design 이라고 검색해보세요.
구글신이 대답해줄겁니다.
그게  |  2018.03.13    
http://biochemistry.yonsei.ac.kr/sub/catalog.php?CatNo=13&gene=8&PHPSESSID=35c59cdbc0eafeb613ae36dcf6ba5572

여기에 있는 정보들을 정독 3번만 해보세용
cloning 시에 많은 도움이 됩니다~~~~
개구리kakaoblack99  |  2018.03.16   
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