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고주온(필명)
진행중 초심자를 위한 생물학+정보학 < 44회 >
고주온(필명)
(http://bioprofiler.tistory.com)
IBM-XT시절부터 개인용 컴퓨터를 사용하였으나, 강산이 변한 지금도 어제 코딩한 내용을 오늘 기억하지 못하는 자유인. 박사학위는 분자유전학 분야로 받았으며, 물리학과 화학에 관심만 있음.
현재 대학 교수로 재직 중.
최근 들어서 데이터 생물학 전 분야에 걸쳐 인공 지능이라는 용어의 빈도가 급격하게 높아지고 있다. 예컨대 유전체 염기 서열의 분석에서부터 후성 유전체, 단백질체, 그리고 대사체 영역에 이르기까지, 변별 학습...
댓글 댓글쓰기  |  09.04  |  조회 1,135
[초심자를 위한 생물학+정보학] 데이터와 인터넷 활용 2: PubChemPy API  - 42
앞에서 의뢰인 (client)으로서의 사용자 컴퓨터 및 프로그램과 이에 대하여 요청에 답하는 응답자 (server)로서의 프로그램, 그리고 해당 규약에 사용되는 출입...
댓글 댓글쓰기  |  2016.12.02  |  조회 2,695
[초심자를 위한 생물학+정보학] 데이터와 인터넷 활용 - 41
지금까지 정보를 다루고 활용하는 몇 가지 예를 알아 보았다. 데이터를 전송 받거나 생산하고, 이렇게 획득한 데이터를 저장하고 분석하기 위해서 컴퓨터와 관련...
댓글 댓글쓰기  |  2016.09.05  |  조회 2,555
[초심자를 위한 생물학+정보학] 계층적 군집화 - 40
지금까지 거리와 상관 계수 등의 기본 개념에 대해서 알아 보았는데, 이번에는 유전자의 발현이나 대사 경로 등의 관련성 등을 알아 보기 위해서 자주 사용하는...
댓글 댓글쓰기  |  2016.07.13  |  조회 2,338
[초심자를 위한 생물학+정보학] 상관 계수 (피어슨) - 39
정보학뿐만 아니라 생물학 관련 분야의 논문에서도 거리 계산과 함께 빈번하게 언급되는 개념으로 상관 계수 (correlation coefficient)가 있다. 어떤 집단의 특...
댓글 댓글쓰기  |  2016.06.17  |  조회 3,526
[초심자를 위한 생물학+정보학] 거리 계산의 실제와 자료형의 중요성 - 38
이번에는 앞에서 예시한 것과 같은 거리 계산을 실제로 수행하면서 초심자들이 겪기 쉬운 착각 또는 범할 수 있는 실수에 대해서 알아 보는 것이 좋겠다.scipy...
댓글 댓글쓰기  |  2016.06.07  |  조회 1,752
[초심자를 위한 생물학+정보학] 다양한 거리 계산 - 37
지난 번에 코사인 유사도를 확인하는 데 사용했던 파이썬의 scipy 모듈에서 거리 (distance)의 계산에 적용할 수 있는 다양한 함수들을 보면, 다음과 같다. 파이...
댓글 댓글쓰기  |  2016.05.20  |  조회 2,757
[초심자를 위한 생물학+정보학] 코사인 유사도와 그 계산 - 36
앞에서도 수 차례 언급했지만, 거리의 종류는 그 개념과 정의에 따라서 매우 다양하다. 이번에는 우리가 가장 쉽게 접하고 이해할 수 있는 유클리드 거리 외에도...
댓글 댓글쓰기  |  2016.04.08  |  조회 4,151
[초심자를 위한 생물학+정보학] 거리의 개념과 척도 - 35
일반적으로 관계 (relation)라 함은 둘 이상의 객체 사이에 서로 연결되어 있는 그 무엇을 의미한다. 이어서 관계의 가깝고 먼 정도를 떠올리게 되고, 따라서 거...
댓글 댓글쓰기  |  2016.03.10  |  조회 2,145
[초심자를 위한 생물학+정보학] 수치 표현 방식과 유효 숫자 및 반올림 - 34
지금까지 컴퓨터에서 실수를 취급할 때 일어나는 부동 소수점 수 (floating-point number)의 처리 방식에 대해서 알아 보았는데, 한 가지 더 알면 도움이 될 내...
댓글 댓글쓰기  |  2016.02.12  |  조회 3,310
 
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